« ENA » : différence entre les versions

ENA
Type de service	Entrepôt de données
Caractéristiques de l'entrepôt
Type d’entrepôt	Disciplinaire
Type de restriction	Soumis à la création d'un compte
Hébergement des données	UE
Identifiant pérenne	✓
Identifiants fournis	ID interne, BioSample
Identifiants utilisés
Formats de fichiers acceptés
Schéma de métadonnées
Licence des jeux de données	Creative Commons
Conditions d'accès aux données	Ouvert, Embargo
Modération / Curation	Les métadonnées sont modérées automatiquement via une checklist, à laquelle s'ajoute une vérification manuelle selon les cas. Il y a une prise de contact en direct avec les contributeurs dans certains cas.
Volumétrie maximale définie
Politique de conservation des données	Cet entrepôt existe depuis 1985.
Interopérabilité machine	API REST, FTP
Versioning	✓
Statut	En production
Autres noms	European Nucleotide Archive, Archive européenne des nucléotides
URL	https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
Contact	https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/support
Localisation	Saffron Walden (Angleterre)
Structure d'appartenance	EMBL-EBI
Tutelles
Identifiants
re3data	10.17616/R3HW3J
Identifiant dans un autre catalogue	https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.dj8nt8 (FAIRsharing)

Version du 2 juillet 2024 à 09:21

L'Archive européenne des nucléotides (ENA) capture et présente les informations relatives aux flux de travail expérimentaux basés sur le séquençage des nucléotides. Elle enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre les informations d'entrée, les données de sortie de la machine et les informations interprétées.

Les données qui parviennent à l'ENA proviennent de différentes sources. Il s'agit notamment de données brutes, de séquences assemblées et d'annotations provenant d'efforts de séquençage à petite échelle, de données fournies par les principaux centres de séquençage européens et d'échanges réguliers et complets avec nos partenaires de l'International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).

Dans le cadre de l'effort mondial visant à améliorer l'accès aux données de séquençage de nucléotides et leur utilisation, l'ENA collabore largement au développement de nos services et de nos technologies, ainsi qu'aux activités de normalisation.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

Biologie moléculaire
Génomique

Type de données :Séquences nucléotidiques, Données brutes, Annotations

Communauté d'utilisateurs : Communauté de recherche en sciences de la vie Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :CoSO (https://www.ouvrirlascience.fr/wp-content/uploads/2024/04/ListedesEntrepotsdeConfiance v1 202403.xlsx)

Conditions générales d'utilisation : https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
EMBL-EBI	ENA PRIDe

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 {{Service
-|Description=L''''Archive européenne des nucléotides (ENA)''' capture et présente les informations relatives aux '''flux de travail expérimentaux basés sur le séquençage des nucléotides'''. Un flux de travail typique comprend l'isolement et la préparation du matériel pour le séquençage, une exécution d'une machine de séquençage dans laquelle les données de séquençage sont produites et un pipeline d'analyse bioinformatique ultérieur. L'ENA enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre les informations d'entrée, les données de sortie de la machine et les informations interprétées.
+|Description=L''''Archive européenne des nucléotides (ENA)''' capture et présente les informations relatives aux '''flux de travail expérimentaux basés sur le séquençage des nucléotides'''. Elle enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre les informations d'entrée, les données de sortie de la machine et les informations interprétées.
 Les données qui parviennent à l'ENA proviennent de différentes sources. Il s'agit notamment de '''données brutes, de séquences assemblées et d'annotations''' provenant d'efforts de séquençage à petite échelle, de données fournies par les principaux centres de séquençage européens et d'échanges réguliers et complets avec nos partenaires de l'International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).