ENA

  ENA

Type de service	Entrepôt de données
	Caractéristiques de l'entrepôt Type d’entrepôt Disciplinaire Type de restriction Soumis à la création d'un compte Hébergement des données UE Identifiant pérenne ✓ Identifiants fournis ID interne, BioSample Identifiants utilisés Formats de fichiers acceptés Schéma de métadonnées Licence des jeux de données Creative Commons Conditions d'accès aux données Ouvert, Embargo Modération / Curation Les métadonnées sont modérées automatiquement via une checklist, à laquelle s'ajoute une vérification manuelle selon les cas. Il y a une prise de contact en direct avec les contributeurs dans certains cas. Volumétrie maximale définie Politique de conservation des données Cet entrepôt existe depuis 1985. Interopérabilité machine API REST, FTP Versioning ✓
Statut	En production
Autres noms	European Nucleotide Archive, Archive européenne des nucléotides
URL	https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
Contact	https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/support
Localisation	Saffron Walden (Angleterre)
Structure d'appartenance	EMBL-EBI
Tutelles
Identifiants
re3data	10.17616/R3HW3J
Identifiant dans un autre catalogue	https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.dj8nt8 (FAIRsharing)

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Documentation

Conservation

Exposition

Réutilisation

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L'Archive européenne des nucléotides (ENA) capture et présente les informations relatives aux flux de travail expérimentaux basés sur le séquençage des nucléotides. Un flux de travail typique comprend l'isolement et la préparation du matériel pour le séquençage, une exécution d'une machine de séquençage dans laquelle les données de séquençage sont produites et un pipeline d'analyse bioinformatique ultérieur. L'ENA enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre les informations d'entrée, les données de sortie de la machine et les informations interprétées.

Les données qui parviennent à l'ENA proviennent de différentes sources. Il s'agit notamment de données brutes, de séquences assemblées et d'annotations provenant d'efforts de séquençage à petite échelle, de données fournies par les principaux centres de séquençage européens et d'échanges réguliers et complets avec nos partenaires de l'International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).

Dans le cadre de l'effort mondial visant à améliorer l'accès aux données de séquençage de nucléotides et leur utilisation, l'ENA collabore largement au développement de nos services et de nos technologies, ainsi qu'aux activités de normalisation.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Biologie moléculaire
• Génomique

Type de données :Séquences nucléotidiques, Données brutes, Annotations

Communauté d'utilisateurs : Communauté de recherche en sciences de la vie Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :CoSO (https://www.ouvrirlascience.fr/wp-content/uploads/2024/04/ListedesEntrepotsdeConfiance v1 202403.xlsx)

Conditions générales d'utilisation : https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
EMBL-EBI	ENA PRIDe

code unique assigné à un objet de façon permanente (DOI, Handle…).

Ensemble structuré d’informations décrivant, expliquant et localisant une ressource physique ou numérique

autorisation par laquelle l'auteur d’une œuvre de l’esprit concède certains des droits que lui offre le droit d'auteur quant à l'utilisation, à la modification, à la rediffusion et à la réutilisation de l'œuvre.

période d’exploitation exclusive du jeu de données.

la curation de données consiste à trier, organiser et mettre en forme un ensemble de données, de manière à le rendre exploitable.

capable de communiquer et d’opérer avec d’autres systèmes d’information.

Comité pour la science ouverte