LoRDEC

LoRDEC

Type de service	Outils de gestion des données
Statut	En production
Autres noms	LoRDEC: hybrid Correction of Long Reads
URL	http://www.atgc-montpellier.fr/lordec/, http://www.lirmm.fr/~rivals/lordec/
Contact	Eric.Rivals@lirmm.fr
Localisation	Montpellier
Structure d'appartenance	LIRMM
Tutelles	CNRS-INS2I

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Chargement de la carte...

{"format":"leaflet","minzoom":false,"maxzoom":false,"limit":50,"offset":0,"link":"all","sort":[""],"order":[],"headers":"show","mainlabel":"","intro":"","outro":"","searchlabel":"... autres r\u00e9sultats","default":"\u0026#32;","import-annotation":false,"width":"280px","height":"280px","centre":false,"title":"","label":"","icon":"","lines":[],"polygons":[],"circles":[],"rectangles":[],"copycoords":true,"static":false,"zoom":false,"defzoom":14,"layers":["OpenStreetMap"],"image layers":[],"overlays":[],"resizable":false,"fullscreen":false,"scrollwheelzoom":true,"cluster":true,"clustermaxzoom":20,"clusterzoomonclick":true,"clustermaxradius":20,"clusterspiderfy":true,"geojson":"","clicktarget":"","showtitle":true,"hidenamespace":true,"template":"","userparam":"","activeicon":"","pagelabel":false,"ajaxcoordproperty":"","ajaxquery":"","locations":[{"text":"\u003Cb\u003E\u003Ca href=\"/index.php/LoRDEC\" title=\"LoRDEC\"\u003ELoRDEC\u003C/a\u003E\u003C/b\u003E","title":"LoRDEC","link":"","lat":43.63687,"lon":3.84071,"icon":""}],"imageLayers":[]}

Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Bioinformatique
• Outil d'analyse
• Analyse de données de séquençage NGS
• Méthodologie
• Alignements de lectures sur des génomes

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

LoRDEC est en lien avec les services et structures

IFB

Portée internationale de LoRDEC

ELIXIR (https://elixir-europe.org/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
LIRMM	ATGC LoRDEC DORIST

Centre National de la Recherche Scientifique