Genoscope

Genoscope

Nom développé	Centre National de Séquençage
Autres noms	Plateforme de séquençage du Genoscope
URL	https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx
Tutelles	CEA
Identifiants
RNSR	201722556Y
ROR	028pnqf58
Localisation	Évry-Courcouronnes

Service

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
URL	https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx
Contact	pcoutool@genoscope.cns.fr
Structure d'appartenance	Genoscope

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

Chargement de la carte...

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L'équipe de la plateforme nationale de séquençage du Genoscope s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes.

Il s’est orienté vers l’étude de la biodiversité, à travers le séquençage de novo de grands génomes complets, de metagénomes complexes et plus généralement de collections d’ADN nécessitant une approche de séquençage à très grande échelle.

Une équipe de chercheurs se consacre aussi au développement et optimisation de nouvelles stratégies de séquençage, y compris l’essai et valorisation des données issus de séquenceurs de troisième génération : lectures ultra longues, modifications épigénétiques, stratégies read-until, etc.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Biodiversité

Type de données :Données génomiques, Données de séquençage

Communauté d'utilisateurs : Communautés scientifiques académiques

Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins

Conditions d'usage : Les soumissions de projets s’effectue via le site de France Génomique

Conditions tarifaires : Les projets sont co-financés avec les laboratoires demandeurs.

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Genoscope est en lien avec les services et structures

France Génomique

Offre de services de Genoscope

• Genoscope (Plateforme de calcul)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
Genoscope	Genoscope

Le ROR en est un identifiant unique dédié aux organismes de recherche. Le Research Organization Registry (ROR) est une base de données collaborative qui comprend des identifiants et des métadonnées pour plus de 102 000 organisations impliquées dans la recherche