PRIDe

  PRIDe

Type de service	Entrepôt de données
	Caractéristiques de l'entrepôt Type d’entrepôt Disciplinaire Type de restriction Soumis à la création d'un compte Hébergement des données UE Identifiant pérenne ✓ Identifiants fournis DOI Identifiants utilisés Formats de fichiers acceptés Schéma de métadonnées Licence des jeux de données CC0 Conditions d'accès aux données Ouvert, Embargo, Restreint Modération / Curation La modération est automatique lors du téléchargement des fichiers, puis une validation est effectuée par des experts du protocole expérimental, des paramètres de spectrométrie de masse et de la complétude des données : https://www.ebi.ac.uk/pride/markdownpage/pridesubmissiontool#submission_details Volumétrie maximale définie Politique de conservation des données Engagement illimité de conservation, sauf pour les jeux de données non rendus publics (voir rubrique embargo). https://www.ebi.ac.uk/pride/markdownpage/datapolicy Interopérabilité machine FTP, API REST Versioning ✓
Statut	En production
Nom développé	PRoteomics IDEntifications Database
URL	https://www.ebi.ac.uk/pride/
Contact	pride-support@ebi.ac.uk
Localisation	Hinxton (Royaume-Uni)
Structure d'appartenance	EMBL-EBI, BBRSC
Identifiants
re3data	10.17616/R3JG6V
Identifiant dans un autre catalogue	https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.e1byny (FAIRsharing)

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Documentation

Conservation

Exposition

Réutilisation

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L'entrepôt PRIDE PRoteomics IDEntifications (PRIDE) est dédié aux données protéomiques issues de la spectrométrie de masse y compris les identifications de protéines et de peptides et les valeurs d'expression correspondantes, les modifications post-traductionnelles et les preuves de spectres de masse.

PRIDE est l'un des principaux membres du consortium ProteomeXchange (PX), qui offre un moyen normalisé de soumettre des données protéomiques basées sur la spectrométrie de masse à des référentiels publics.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Biologie
• Protéomique

Type de données :Données de spectrométrie de masse, Données brutes, Données protéomiques, Fichiers de listes de pics

Périmètre de communauté : ESR, thématique, national, international

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique internationale utilisant des données protéomiques

Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :CoSO (https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiance-pour-le-depot-de-donnees-methodologie-et-analyse-de-loffre-existante/)

Conditions générales d'utilisation : https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/

Portée internationale de PRIDe

ELIXIR (https://elixir-europe.org)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
BBRSC	PRIDe
EMBL-EBI	ENA PRIDe ArrayExpress EGA EMPIAR PDBe

code unique assigné à un objet de façon permanente (DOI, Handle…).

Digital Object Identifier

Ensemble structuré d’informations décrivant, expliquant et localisant une ressource physique ou numérique

autorisation par laquelle l'auteur d’une œuvre de l’esprit concède certains des droits que lui offre le droit d'auteur quant à l'utilisation, à la modification, à la rediffusion et à la réutilisation de l'œuvre.

période d’exploitation exclusive du jeu de données.

la curation de données consiste à trier, organiser et mettre en forme un ensemble de données, de manière à le rendre exploitable.

période d’exploitation exclusive du jeu de données.

capable de communiquer et d’opérer avec d’autres systèmes d’information.

Enseignement Supérieur et Recherche

Comité pour la science ouverte