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« MS4Omics » : différence entre les versions

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{{Infobox Service
{{Infobox Service
|Logo=LogoMS4OMICSOrange.jpg
|Logo=Logo MS4OMICS.png
|NomService=MS4OMICS
|NomService=MS4Omics
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|StatutService=En production
|StatutService=En production
|NomAlternatif=Clic Imaging (Ancien nom), Top Omics (Ancien nom)
|NomAlternatifRéduit=Mass spectrometry plateform
|UrlService=https://msap-lab.fr/proteomique/
|UrlService=https://organomics.univ-lille.fr/fr/organisation-generale-de-la-plateforme/ms4omics
|ContactMel=msap-plateformes@univ-lille.fr
|ContactMel=organomics@univ-lille.fr
|Localisation=Lille
|Localisation=Villeneuve-d'Ascq
|StructureAppartenance=MSAP
|StructureAppartenance=PRISM
|Tutelle=CNRS, Université de Lille
|Tutelle=Centre Oscar Lambret, Inserm, CHU de Lille, Université de Lille
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse
|International=Non
}}
}}
{{Coordonnées GPS
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|CoordonneeGeographique=50.60956, 3.13586
|CoordonneeGeographique=50.60804, 3.14476
}}
}}
{{Service
{{Service
|Description=La plateforme '''MS4Omics''' est spécialisée dans la protéomique basée sur la spectrométrie de masse pour les tissus et les fluides biologiques, l’industrie alimentaire, le patrimoine culturel, l’imagerie par spectrométrie de masse. Elle a pour vocation de mettre à disposition des équipes : '''des équipements, des compétences scientifiques adaptés aux demandes'''.  
|Description=La plateforme '''MS4Omics''' offre des services en imagerie par spectrométrie de masse, en protéomique non ciblée (bottom-up, shotgun et top-down proteomic) et en interactomique (crosslinking-MS et BioID).


Deux types de services sont offerts par la plateforme :
MS4Omics peut répondre à diverses questions scientifiques, allant de l''''identification fondamentale de protéines''' dans des organismes entièrement séquencés à des '''analyses impliquant la quantification des variations''', la dynamique des modifications post-traductionnelles, l'identification de protéines dans des génomes non séquencés, l'interactomique et l'imagerie par SM.
* '''L’accès direct aux instruments'''
* '''Les collaborations''' qui représentent souvent des projets de plus grande ampleur.


La plateforme réalise :
La plateforme est une des entités spécialisées d'[[OrganOmics]].
* Identification de protéines par digestion enzymatique à partir d’échantillons variés
|Discipline=Vie & Santé
* Quantification de protéine par méthode Label Free, SILAC, TMT
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines
* Quantification ciblée avec l’utilisation de peptides AQUA et de la méthode PRM
|Thematique=Spectrométrie de masse, Protéomique, Protéogénomique
* Analyse de protéines intactes. Analyse de modifications post-traductionelles (phosphorylation, glycosylation…)
|TypeDonnee=Données expérimentales, Données instrumentales
* Enrichissement en phospho ou glycopeptides / protéines avec utilisation de colonne à façon
|PerimetreCommunaute=ESR, privé, national
* Analyse d’échantillons d’héritage culturel, d’archéologie ou paléontologie
|Communaute=Laboratoires académiques, cliniques et industriels
* Analyse de lipides comme les triacylglycéroles ou de métabolomique.
 
 
La plateforme possède '''différents logiciels d’analyse''' MASCOT Distiller, Proteome discover, PEAKS X, Proteome deconvolution, Maxquant, Skyline, la suite de logiciel pour les MALDI TOF et TOF-TOF, le FT-ICR. Ainsi qu’un serveur avec les bases de données Swissprot, NCBi mais aussi des '''bases de données internes'''.
|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
|SousDisciplineSciences&Technologies=PE4 Chimie physique et analytique
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|Thematique=Spectrométrie de masse, Protéomique, Paléoprotéomique
|TypeDonnee=Données expérimentales, Données instrumentales, Base de données
|Communaute=Communauté de recherche de l'Université de Lille et dans la mesure des possibilités, de l'ESR et acteurs privés
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants, Ingénieurs et Industriels
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants, Ingénieurs et Industriels
|ConditionUsage=La plateforme n'est pas en libre accès. Pour l'utiliser, il convient de contacter les équipes pour discuter du projet et mettre en place l'accès aux machines et aux techniques.
|Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/organomics-540.html,
|Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/organomics-540.html,
|Relation=Infranalytics, ProFI
|Relation=OrganOmics, 3DCellOmics
}}
}}

Dernière version du 19 mai 2026 à 16:11

  MS4Omics
Type de service Plateforme d'acquisition
Statut En production
Autres noms Mass spectrometry plateform
URL https://organomics.univ-lille.fr/fr/organisation-generale-de-la-plateforme/ms4omics
Contact organomics@univ-lille.fr
Localisation Villeneuve-d'Ascq
Structure d'appartenance PRISM
Tutelles Centre Oscar Lambret, Inserm, CHU de Lille, Université de Lille


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte
Analyse


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La plateforme MS4Omics offre des services en imagerie par spectrométrie de masse, en protéomique non ciblée (bottom-up, shotgun et top-down proteomic) et en interactomique (crosslinking-MS et BioID).

MS4Omics peut répondre à diverses questions scientifiques, allant de l'identification fondamentale de protéines dans des organismes entièrement séquencés à des analyses impliquant la quantification des variations, la dynamique des modifications post-traductionnelles, l'identification de protéines dans des génomes non séquencés, l'interactomique et l'imagerie par SM.

La plateforme est une des entités spécialisées d'OrganOmics.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines Thématique et/ou mots clés :

  • Spectrométrie de masse
  • Protéomique
  • Protéogénomique

Type de données :Données expérimentales, Données instrumentales

Périmètre de communauté : ESR, privé, national

Communauté d'utilisateurs : Laboratoires académiques, cliniques et industriels

Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants, Ingénieurs et Industriels


Conditions d'usage : La plateforme n'est pas en libre accès. Pour l'utiliser, il convient de contacter les équipes pour discuter du projet et mettre en place l'accès aux machines et aux techniques.

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/plateformes/organomics-540.html)

Conditions générales d'utilisation :

MS4Omics est en lien avec les services et structures

OrganOmics, 3DCellOmics



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
PRISM Inserm U1192OrganOmics
3DCellOmics
MS4Omics


Enseignement Supérieur et Recherche

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.

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