« ENA » : différence entre les versions

ENA
Type de service	Entrepôt de données
Caractéristiques de l'entrepôt
Type d’entrepôt	Disciplinaire
Type de restriction	Soumis à la création d'un compte
Hébergement des données	UE
Identifiant pérenne	✓
Identifiants fournis	ID interne, BioSample
Identifiants utilisés
Formats de fichiers acceptés
Schéma de métadonnées
Licence des jeux de données	Creative Commons
Conditions d'accès aux données	Ouvert, Embargo
Modération / Curation	Les métadonnées sont modérées automatiquement via une checklist, à laquelle s'ajoute une vérification manuelle selon les cas. Il y a une prise de contact en direct avec les contributeurs dans certains cas.
Volumétrie maximale définie
Politique de conservation des données	Cet entrepôt existe depuis 1985.
Interopérabilité machine	API REST, FTP
Versioning	✓
Statut	En production
Nom développé	European Nucleotide Archive
Autres noms	Archive européenne des nucléotides
URL	https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
Contact	https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/support
Localisation	Saffron Walden (Royaume-Uni)
Structure d'appartenance	EMBL-EBI
Tutelles
Identifiants
re3data	10.17616/R3HW3J
Identifiant dans un autre catalogue	https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.dj8nt8 (FAIRsharing)

Dernière version du 23 mai 2025 à 09:35

L'Archive européenne des nucléotides (ENA) capture et présente les informations relatives aux flux de travail expérimentaux basés sur le séquençage des nucléotides. Elle enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre les informations d'entrée, les données de sortie de la machine et les informations interprétées.

Les données qui parviennent à l'ENA proviennent de différentes sources. Il s'agit notamment de données brutes, de séquences assemblées et d'annotations provenant d'efforts de séquençage à petite échelle, de données fournies par les principaux centres de séquençage européens et d'échanges réguliers et complets avec leurs partenaires de l'International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).

Dans le cadre de l'effort mondial visant à améliorer l'accès aux données de séquençage de nucléotides et leur utilisation, l'ENA collabore largement au développement de services et de technologies, ainsi qu'aux activités de normalisation.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

Biologie moléculaire
Génomique

Type de données :Séquences nucléotidiques, Données brutes, Annotations

Communauté d'utilisateurs : Communauté de recherche en sciences de la vie Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :CoSO (https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiance-pour-le-depot-de-donnees-methodologie-et-analyse-de-loffre-existante/)

Conditions générales d'utilisation : https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/

Portée internationale de ENA

ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/)

Global Core Biodata Resources (https://globalbiodata.org/what-we-do/global-core-biodata-resources/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
EMBL-EBI	ENA PRIDe ArrayExpress EGA EMPIAR PDBe

@@ Ligne 15 : / Ligne 15 : @@
 |Versioning=Oui
 |StatutService=En production
-|NomAlternatif=European Nucleotide Archive, Archive européenne des nucléotides
+|NomDéveloppé=European Nucleotide Archive
+|NomAlternatifRéduit=Archive européenne des nucléotides
 |UrlService=https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
 |ContactMel=https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/support
-|Localisation=Saffron Walden (Angleterre)
+|Localisation=Saffron Walden (Royaume-Uni)
 |StructureAppartenance=EMBL-EBI
 |IDre3data=10.17616/R3HW3J
@@ Ligne 24 : / Ligne 25 : @@
 |PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation
 |International=Oui
+|NomAlternatif=European Nucleotide Archive, Archive européenne des nucléotides
 }}
 {{Coordonnées GPS
@@ Ligne 29 : / Ligne 31 : @@
 }}
 {{Service
-|Description=L''''Archive européenne des nucléotides (ENA)''' est un entrepôt pour la gestion, le partage, l'intégration, l'archivage et la diffusion des '''données de séquençage'''.
+|Description=L''''Archive européenne des nucléotides (ENA)''' capture et présente les informations relatives aux '''flux de travail expérimentaux basés sur le séquençage des nucléotides'''. Elle enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre les informations d'entrée, les données de sortie de la machine et les informations interprétées.
+Les données qui parviennent à l'ENA proviennent de différentes sources. Il s'agit notamment de '''données brutes, de séquences assemblées et d'annotations''' provenant d'efforts de séquençage à petite échelle, de données fournies par les principaux centres de séquençage européens et d'échanges réguliers et complets avec leurs partenaires de l'International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).
+Dans le cadre de l'effort mondial visant à améliorer l'accès aux données de séquençage de nucléotides et leur utilisation, l'ENA collabore largement au '''développement de services et de technologies, ainsi qu'aux activités de normalisation'''.
 |Discipline=Vie & Santé
 |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
@@ Ligne 37 : / Ligne 43 : @@
 |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants
 |ModeleEconomique=Gratuit
-|Certification=CoSO;https://www.ouvrirlascience.fr/wp-content/uploads/2024/04/ListedesEntrepotsdeConfiance_v1_202403.xlsx
+|Certification=CoSO;https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiance-pour-le-depot-de-donnees-methodologie-et-analyse-de-loffre-existante/
 |Cgu=https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/
+|PorteeInternationale=ELIXIR; https://www.elixir-europe.org/,
+Global Core Biodata Resources; https://globalbiodata.org/what-we-do/global-core-biodata-resources/
 }}