Bureaucrates, emailconfirmed, Administrateurs d’interface, Administrateurs (MediaWiki Sémantique), Conservateurs (MediaWiki Sémantique), Modificateurs (MediaWiki Sémantique), Masqueurs de modifications, Administrateurs
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{{Infobox Service | {{Infobox Service | ||
|NomService=GnpIS | |NomService=GnpIS | ||
|TypeService=Entrepôt de données | |TypeService=Entrepôt de données | ||
|TypeEntrepot=Disciplinaire | |||
|TypeRestriction=Soumis à la création d'un compte | |||
|HebergementDonnees=France | |||
|AttributionIdentifiant=Oui | |||
|TypeIdentifiantAttribue=DOI | |||
|SchemaMetadonnees=ISA-Tab | |||
|Licences=Creative Commons | |||
|ConditionAccesDonnees=Ouvert, Embargo, Restreint | |||
|Curation=Une curation manuelle est effectuée pour certaines données, telles que les génomes. Elles sont également annotées sur le plan fonctionnel. | |||
|Interoperabilite=API REST | |||
|Versioning=Oui | |||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
| | |NomDéveloppé=Genetic and Genomic Information System | ||
|UrlService=https://urgi.versailles.inra.fr/gnpis, https://urgi.versailles.inra.fr/Data | |UrlService=https://urgi.versailles.inra.fr/gnpis, https://urgi.versailles.inra.fr/Data | ||
|ContactMel=urgi-contact at versailles.inra.fr | |ContactMel=urgi-contact at versailles.inra.fr | ||
|Localisation=Versailles | |Localisation=Versailles | ||
|StructureAppartenance=URGI,PlantBioInfoPF | |StructureAppartenance=URGI, PlantBioInfoPF | ||
|Tutelle=INRAE | |Tutelle=INRAE | ||
|IDre3data=10.17616/R3RF6C | |||
|IdentifiantAlternatif=https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.dw22y3; FAIRsharing | |||
|IDre3data=R3RF6C | |||
|IdentifiantAlternatif= | |||
|PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation | |PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation | ||
|International=Non | |||
|NomAlternatif=Genetic and Genomic Information System | |||
}} | |||
{{Coordonnées GPS | |||
|CoordonneeGeographique=48.80183, 2.08845 | |CoordonneeGeographique=48.80183, 2.08845 | ||
}} | }} | ||
{{Service | {{Service | ||
|Description=GnpIS est un système d’information modulaire interopérable, multi-espèces (plantes et champignons), permettant le stockage et la mise à disposition de données de génomique et de génétique : annotations de génome, cartographie physiques et génétiques (marqueurs, QTL), polymorphismes de séquence issues de reséquençage et de génotypage, génétique d’association entre marqueurs et caractères phénotypiques (GWAS), phénotypage lié à l’environnement (GxE), ressources génétiques (données patrimoniales INRAE venant pour certaines d’entre elles des centres de ressources biologiques). | |Description='''GnpIS''' est un système d’information modulaire interopérable, multi-espèces (plantes et champignons), permettant le '''stockage et la mise à disposition de données de génomique et de génétique''' : annotations de génome, cartographie physiques et génétiques (marqueurs, QTL), polymorphismes de séquence issues de reséquençage et de génotypage, génétique d’association entre marqueurs et caractères phénotypiques (GWAS), phénotypage lié à l’environnement (GxE), ressources génétiques (données patrimoniales INRAE venant pour certaines d’entre elles des centres de ressources biologiques). | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante= | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes | ||
|Thematique=Analyse de données de séquençage NGS, Analyse de séquences, | |Thematique=Analyse de données de séquençage NGS, Analyse de séquences, | ||
Cartographie, Génomique comparative | Cartographie, Génomique comparative | ||
|ConditionUsage=L’accès aux données peut être public (par défaut avec une licence CC-BY 4.0) ou données en accès authentifié dans le cadre de projets en collaboration avec la plateforme avant publication.. La durée de conservation des données est déterminée dans les accords consortium ou dans le formulaire de demande d’intégration de données . Les données considérées comme patrimoniales pour l’Institut (ressources génétiques, données phénotypiques) sont conservées de façon permanente. | |ConditionUsage=L’accès aux données peut être public (par défaut avec une licence CC-BY 4.0) ou données en accès authentifié dans le cadre de projets en collaboration avec la plateforme avant publication.. La durée de conservation des données est déterminée dans les accords consortium ou dans le formulaire de demande d’intégration de données . Les données considérées comme patrimoniales pour l’Institut (ressources génétiques, données phénotypiques) sont conservées de façon permanente. | ||
|Certification=ELIXIR Data Resources;https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources?page=1, CoSO;https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiance-pour-le-depot-de-donnees-methodologie-et-analyse-de-loffre-existante/ | |||
|Certification=ELIXIR Data Resources;https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources?page=1 | |||
|Cgu=https://urgi.versailles.inrae.fr/Platform/General-Terms-of-Use/Conditions-Generales-d-Utilisation | |Cgu=https://urgi.versailles.inrae.fr/Platform/General-Terms-of-Use/Conditions-Generales-d-Utilisation | ||
|Relation=PlantBioInfoPF | |Relation=PlantBioInfoPF | ||
}} | }} | ||