ParameciumDB

  ParameciumDB

Type de service	Entrepôt de données
	Caractéristiques de l'entrepôt Type d’entrepôt Disciplinaire Type de restriction Réservé aux administrateurs Hébergement des données Identifiant pérenne ✕ Identifiants fournis Identifiant interne Identifiants utilisés PMID Formats de fichiers acceptés Schéma de métadonnées Licence des jeux de données Conditions d'accès aux données Ouvert Modération / Curation Volumétrie maximale définie Politique de conservation des données Interopérabilité machine Versioning
Statut	En production
URL	https://paramecium.i2bc.paris-saclay.fr
Contact	olivier.arnaiz@i2bc.paris-saclay.fr
Localisation	Gif-sur-Yvette
Structure d'appartenance	I2BC
Tutelles	CNRS, Université Paris-Saclay

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Conservation

Exposition

Réutilisation

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ParameciumDB est une base de données communautaire sur l'organisme modèle Paramecium. Le site web donne accès aux génomes de nombreuses espèces de paramécies ainsi qu'à leurs annotations. ParameciumDB intègre également des jeux de données de séquencage (DNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq) fournis par la communauté. Ce portail permet d'interroger, d'extraire, de visualiser et de comparer les données publiques les plus récentes.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative; LS6 Immunité, infection et immunothérapie Thématique et/ou mots clés :

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires : Accès gratuit

Certification/Label :ELIXIR Data Resources (https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources)

Conditions générales d'utilisation :

Portée internationale de ParameciumDB

ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
I2BC	CRISPR-Cas++ ParameciumDB

code unique assigné à un objet de façon permanente (DOI, Handle…).

Ensemble structuré d’informations décrivant, expliquant et localisant une ressource physique ou numérique

autorisation par laquelle l'auteur d’une œuvre de l’esprit concède certains des droits que lui offre le droit d'auteur quant à l'utilisation, à la modification, à la rediffusion et à la réutilisation de l'œuvre.

la curation de données consiste à trier, organiser et mettre en forme un ensemble de données, de manière à le rendre exploitable.

capable de communiquer et d’opérer avec d’autres systèmes d’information.

Centre National de la Recherche Scientifique