« TEFOR Paris Saclay » : différence entre les versions

De Cat OPIDoR
m (Remplacement de texte — « Physiologie, physiopathologie et endocrinologie » par « LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement »)
m (Remplacement de texte : « Catégorie:Catalogue CNRS-INSB » par « Catégorie:Catalogue CNRS Biologie »)
 
(12 versions intermédiaires par 4 utilisateurs non affichées)
Ligne 1 : Ligne 1 :
{{Infobox Service
{{Infobox Service
|Logo=Logo TEFOR-TPS Saclay fond blanc.png
|NomService=TEFOR Paris Saclay
|NomService=TEFOR Paris Saclay
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|StatutService=En production
|StatutService=En production
|NomAlternatif=Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles  Paris-Saclay, TPS,
|NomAlternatif=Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles  Paris-Saclay, TPS
|UrlService=https://tps.tefor.net/
|UrlService=https://tps.tefor.net/
|ContactMel=https://tps.tefor.net/#contact
|ContactMel=https://tps.tefor.net/#contact
|Localisation=Gif-sur-Yvette
|Localisation=Saclay
|StructureAppartenance=TEFOR, Celphedia
|StructureAppartenance=TEFOR, Celphedia
|Tutelle=CNRS, Université Paris-Saclay, INRAE
|Tutelle=CNRS, Université Paris-Saclay, INRAE
|IDRNSR=201922946N
|IDRNSR=201922946N
|PhaseCycleVie=Collecte, Documentation, Conservation
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse, Stockage
|CoordonneeGeographique=48.70402, 2.13241
}}
{{Coordonnées GPS
|CoordonneeGeographique=48.72214, 2.15117
}}
}}
{{Service
{{Service
|Description=En collaboration avec ses partenaires au sein de l'infrastructure TEFOR, '''Tefor Paris Saclay (TPS)''' '''développe des méthodes de phénotypage en 3D d’échantillons transparisés et marqués'''. Avec d’autres partenaires dans TEFOR et des collaborateurs internationaux, le TPS développe des stratégies d’archivage des volumes imagés dans des bases de données, notamment sous forme d’atlas digitaux. Ces stratégies sont développées en parallèle chez le poisson-zèbre et la drosophile et coordonnées par le TPS.  Il s’attache également à développer ou adapter des solutions de visualisation des données 3D de grandes tailles gratuites et faciles d’utilisation. Le TPS propose des services standards de phénotypage intégral de larves de poissons-zèbre ou de cerveaux adultes entiers à l’échelle sub-cellulaire ainsi que le service adapté de traitement des données. Il développe des stratégies automatiques d’analyse volumétrique de différents organes par segmentation des volumes d’intérêt pour des projets de criblage à haut contenu.
|Description=TEFOR Paris-Saclay a pour ambition de faciliter l’accès aux organismes modèles aquatiques pour la recherche fondamentale et appliquée. Les modèles développés par TEFOR Paris-Saclay sont les poissons, en particulier le poisson zèbre, et les xénopes.
 
Les services proposés par TPS sont : Hébergement d’animaux, production de lignées d’intérêt par édition du génome, phénotypage par imagerie d’échantillons fixés de grande taille, ainsi qu'un appui pour la gestion et l’analyse de ces données d’images.
 
Sa recherche technologique s'axe notamment sur le raffinement des méthodes d'édition du génome (prime editing). TPS développe aussi des bases de données d'images : atlas avec cerveaux standardisés (modèle poisson zèbre mais aussi drosophile dans le cadre de l'infrastructure TEFOR). TPS s’attache également à développer ou adapter des solutions de visualisation gratuites et faciles d’utilisation d'images 3D de grandes tailles.
 
Enfin, TPS organise des formations sur les modèles et technologies dont elle est experte. Afin d’être toujours en adéquation avec les besoins de la communauté.
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes; LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; Sciences de la vie appliquées, biotechnologie, et ingénierie moléculaire et des biosystèmes
|SousDisciplineVie&Sante=LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes
|Thematique=poisson-zèbre
|Thematique=Poisson zèbre, Autres poissons modèles, Modèles aquatiques, Zootechnie, Édition du génome, Production de lignées d'intérêt, Imagerie, Reconstitution 3D, Gestion de données
|TypeDonnee=Images, reconstitution 3D
|Communaute=Communautés de recherche publique et industrielle
|Beneficiaire=Membres des laboratoires de recherche
|ConditionUsage=Remplir le formulaire de contact afin de définir votre projet !
|ModeleEconomique=Devis sur demande
|Certification=IBiSA;https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/
|Certification=IBiSA;https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/
}}
}}
[[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]]

Dernière version du 10 novembre 2023 à 11:37

  TEFOR Paris Saclay
Type de service Plateforme d'acquisition
Statut En production
Autres noms Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles Paris-Saclay, TPS
URL https://tps.tefor.net/
Contact https://tps.tefor.net/#contact
Localisation Saclay
Structure d'appartenance TEFOR, Celphedia
Tutelles CNRS, Université Paris-Saclay, INRAE
Identifiants
RNSR 201922946N


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


Chargement de la carte...




TEFOR Paris-Saclay a pour ambition de faciliter l’accès aux organismes modèles aquatiques pour la recherche fondamentale et appliquée. Les modèles développés par TEFOR Paris-Saclay sont les poissons, en particulier le poisson zèbre, et les xénopes.

Les services proposés par TPS sont : Hébergement d’animaux, production de lignées d’intérêt par édition du génome, phénotypage par imagerie d’échantillons fixés de grande taille, ainsi qu'un appui pour la gestion et l’analyse de ces données d’images.

Sa recherche technologique s'axe notamment sur le raffinement des méthodes d'édition du génome (prime editing). TPS développe aussi des bases de données d'images : atlas avec cerveaux standardisés (modèle poisson zèbre mais aussi drosophile dans le cadre de l'infrastructure TEFOR). TPS s’attache également à développer ou adapter des solutions de visualisation gratuites et faciles d’utilisation d'images 3D de grandes tailles.

Enfin, TPS organise des formations sur les modèles et technologies dont elle est experte. Afin d’être toujours en adéquation avec les besoins de la communauté.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Poisson zèbre
  • Autres poissons modèles
  • Modèles aquatiques
  • Zootechnie
  • Édition du génome
  • Production de lignées d'intérêt
  • Imagerie
  • Reconstitution 3D
  • Gestion de données

Type de données :Images, reconstitution 3D

Communauté d'utilisateurs : Communautés de recherche publique et industrielle Usagers et bénéficiaires :Membres des laboratoires de recherche


Conditions d'usage : Remplir le formulaire de contact afin de définir votre projet !

Conditions tarifaires : Devis sur demande

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/)

Conditions générales d'utilisation :



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
CelphediaPHENOMIN-ICS
PHENOMIN-TAAM
PHENOMIN-CIPHE
TEFOR Paris Saclay
TEFOR Fly Facility
TEFOR-TACGENE
AniRA
Chronobiotron
TRIP
SdP
SILABE
MPRC
Anexplo
TEFORTEFOR Paris Saclay
TEFOR Fly Facility
TEFOR-TACGENE