« PRIDe » : différence entre les versions
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|NomService=PRIDe | |NomService=PRIDe | ||
|TypeService=Entrepôt de données | |TypeService=Entrepôt de données | ||
|TypeEntrepot=Disciplinaire | |||
|TypeRestriction=Soumis à la création d'un compte | |||
|HebergementDonnees=UE | |||
|AttributionIdentifiant=Oui | |AttributionIdentifiant=Oui | ||
|TypeIdentifiantAttribue=DOI | |TypeIdentifiantAttribue=DOI | ||
|Licences=Creative Commons | |Licences=Creative Commons | ||
|ConditionAccesDonnees=Ouvert, Embargo, Restreint | |||
|Curation=La modération est automatique lors du téléchargement des fichiers, puis une validation est effectuée par des experts du protocole expérimental, des paramètres de spectrométrie de masse et de la complétude des données : https://www.ebi.ac.uk/pride/markdownpage/pridesubmissiontool#submission_details | |||
|ConservationDonnees=Engagement illimité de conservation, sauf pour les jeux de données non rendus publics (voir rubrique embargo). https://www.ebi.ac.uk/pride/markdownpage/datapolicy | |||
|Interoperabilite=FTP, API REST | |Interoperabilite=FTP, API REST | ||
|Versioning=Oui | |Versioning=Oui | ||
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|UrlService=https://www.ebi.ac.uk/pride/ | |UrlService=https://www.ebi.ac.uk/pride/ | ||
|ContactMel=pride-support@ebi.ac.uk | |ContactMel=pride-support@ebi.ac.uk | ||
|StructureAppartenance=EMBL-EBI | |Localisation=Hinxton (Angleterre) | ||
|StructureAppartenance=EMBL-EBI, BBRSC | |||
|IDre3data=10.17616/R3JG6V | |IDre3data=10.17616/R3JG6V | ||
|IdentifiantAlternatif=https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.e1byny;FAIRsharing | |IdentifiantAlternatif=https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.e1byny;FAIRsharing | ||
|PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation | |PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation | ||
|International=Oui | |International=Oui | ||
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{{Coordonnées GPS | |||
|CoordonneeGeographique=52.08487, 0.17926 | |||
}} | }} | ||
{{Service | {{Service | ||
|Description=L'entrepôt '''PRIDE PRoteomics IDEntifications (PRIDE)''' | |Description=L'entrepôt '''PRIDE PRoteomics IDEntifications (PRIDE)''' est dédié aux '''données protéomiques issues de la spectrométrie de masse''' y compris les identifications de protéines et de peptides et les valeurs d'expression correspondantes, les modifications post-traductionnelles et les preuves de spectres de masse. | ||
PRIDE est l'un des principaux membres du consortium ProteomeXchange (PX), qui offre un moyen normalisé de soumettre des données protéomiques basées sur la spectrométrie de masse à des référentiels publics. | PRIDE est l'un des principaux membres du consortium ProteomeXchange (PX), qui offre un moyen normalisé de soumettre des données protéomiques basées sur la spectrométrie de masse à des référentiels publics. | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | |||
|Thematique=Biologie, Protéomique | |Thematique=Biologie, Protéomique | ||
|TypeDonnee=Données de spectrométrie de masse | |TypeDonnee=Données de spectrométrie de masse, Données brutes, Données protéomiques, Fichiers de listes de pics | ||
|Communaute=Communauté scientifique internationale utilisant des données protéomiques | |||
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants | |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants | ||
|Certification=Entrepôt CoSO; https://www.ouvrirlascience.fr/wp-content/uploads/2024/04/ListedesEntrepotsdeConfiance_v1_202403.xlsx | |Certification=Entrepôt CoSO; https://www.ouvrirlascience.fr/wp-content/uploads/2024/04/ListedesEntrepotsdeConfiance_v1_202403.xlsx | ||
|Cgu=https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/ | |Cgu=https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/ | ||
}} | }} |
Version du 15 juillet 2024 à 13:26
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Type de service | Entrepôt de données | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Statut | En production | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Autres noms | PRoteomics IDEntifications Database | ||||||||||||||||||||||||||||||||
URL | https://www.ebi.ac.uk/pride/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Contact | pride-support@ebi.ac.uk | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Localisation | Hinxton (Angleterre) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure d'appartenance | EMBL-EBI, BBRSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Tutelles | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Identifiants | |||||||||||||||||||||||||||||||||
re3data | 10.17616/R3JG6V | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Identifiant dans un autre catalogue | https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.e1byny (FAIRsharing) |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :
- Biologie
- Protéomique
Type de données :Données de spectrométrie de masse, Données brutes, Données protéomiques, Fichiers de listes de pics
Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique internationale utilisant des données protéomiques Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants
Conditions d'usage :
Conditions tarifaires :
Certification/Label :Entrepôt CoSO (https://www.ouvrirlascience.fr/wp-content/uploads/2024/04/ListedesEntrepotsdeConfiance v1 202403.xlsx)
Conditions générales d'utilisation : https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/
Structure | Services proposés |
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BBRSC | PRIDe |
EMBL-EBI | ENA PRIDe |