« Genoscope » : différence entre les versions
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{{InfoboxStructureService | {{InfoboxStructureService | ||
|Logo=Logo Genoscope ORIG 344.gif | |Logo=Logo Genoscope ORIG 344.gif | ||
|NomAlternatif=Centre National de Séquençage, Plateforme de séquençage du Genoscope | |||
|NomAlternatif=Centre National de Séquençage | |||
|Url=https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx | |Url=https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx | ||
| | |Tutelle=CEA | ||
|IDRNSR=201722556Y | |IDRNSR=201722556Y | ||
|IDROR=028pnqf58 | |IDROR=028pnqf58 | ||
|Localisation=Évry-Courcouronnes | |||
|TypeService=Plateforme de calcul | |||
|StatutService=En production | |||
|ContactMel=pcoutool@genoscope.cns.fr | |||
|StructureAppartenance=Genoscope | |||
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse | |||
|NomStructure=Genoscope | |||
|Description=Après avoir été l’un des acteurs du projet génome humain, le '''Centre National de Séquençage''' ('''Genoscope''') a mis le cap vers '''la génomique environnementale'''. L’exploitation des données de séquences, prolongée par l’identification expérimentale des fonctions biologiques, notamment dans le domaine de '''la biocatalyse''', ouvrent des perspectives de développements en '''biotechnologie industrielle'''. C’est dans une logique de développement durable que le Genoscope cherche '''des solutions biologiques dans la chimie de synthèse''', afin de la rendre moins polluante et moins consommatrice d’énergie et de carbone fossile. | |Description=Après avoir été l’un des acteurs du projet génome humain, le '''Centre National de Séquençage''' ('''Genoscope''') a mis le cap vers '''la génomique environnementale'''. L’exploitation des données de séquences, prolongée par l’identification expérimentale des fonctions biologiques, notamment dans le domaine de '''la biocatalyse''', ouvrent des perspectives de développements en '''biotechnologie industrielle'''. C’est dans une logique de développement durable que le Genoscope cherche '''des solutions biologiques dans la chimie de synthèse''', afin de la rendre moins polluante et moins consommatrice d’énergie et de carbone fossile. | ||
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{{Coordonnées GPS | |||
|CoordonneeGeographique=48.62399, 2.43972 | |||
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{{ServiceStructure | {{ServiceStructure | ||
|Description=L'équipe du laboratoire de séquençage s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes.Le séquençage est assuré par des séquenceurs très haut débit de deuxième génération. Ces machines permettent d'atteindre un débit autorisant le séquençage de génomes entiers dans un intervalle de temps limité. | |||
Les projets traités par le laboratoire de séquençage sont essentiellement de grands projets acceptés suite aux appels d'offres Genoscope et, plus récemment depuis 2012, aux appels d'offres France Génomique "Grands Projets de Séquençage option Biodiversité". Le laboratoire de séquençage prend également en charge tous les projets propres dont les porteurs de projet des équipes scientifiques du Genoscope. | |||
Les projets actuellement développés concernent un large panel d'organismes, par exemple : | |||
* Reséquençage : champignon unicellulaire comme la levure (Saccharomyces cerevisiae) ou organisme végétal comme le riz (genre Oryza), | |||
* Séquençage de novo de protiste (Paramecia), d'organisme animal comme la limnée (genre Lymnaea) ou d'organisme végétal comme le blé (genre Triticum), | |||
* Séquençage de transcriptomes d'organismes eucaryotes comme le chêne (genre Quercus), | |||
* Projets de métagénomique et de métatranscriptomique (projets Tara Océans, biodiversité des sols français) | |||
* Projets de séquençage du Génome de la truffe noire du Périgord, du génome d'Ectocarpus. | |||
* 1002 génomes de levures, biodiversité des plantes alpines. | |||
|Discipline=Vie & Santé | |||
|StatutPage=Page en construction | |||
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