« Go@l » : différence entre les versions

← Modification précédente

Go@l (voir la source)

Version du 18 avril 2025 à 15:21

1 224 octets ajoutés , 18 avril

aucun résumé des modifications

SidonieRaffy

12 701

modifications

@@ Ligne 4 : / Ligne 4 : @@
 |TypeService=Plateforme d'acquisition
 |StatutService=En production
+|NomDéveloppé=GenOmique at Lille
 |NomAlternatif=GenOmique at Lille
 |UrlService=https://ums-plbs.univ-lille.fr/les-plateformes-constitutives/genomique
 |ContactMel=genomique-plbs@univ-lille.fr
 |Localisation=Lille
-|PhaseCycleVie=Collecte
+|StructureAppartenance=PLBS
+|Tutelle=Université de Lille, Inserm, CHU de Lille, CNRS, Institut Pasteur de Lille
+|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse, Documentation
 |International=Non
 }}
 {{Service
-|Description=La plateforme GO@L comprend deux plateaux spécialisés :
+|Description=La '''plateforme Go@l''' offre son expertise en '''étude de faisabilité et en montage de projets d’analyse génomique pour des projets à moyen/haut débit'''.
-* Le plateau Transcriptomics and Applied Genomics (TAG), localisé à l’Institut Pasteur de Lille, est spécialisé dans les applications de microbiologie.
+Elle comprend deux plateaux spécialisés :
-* Le plateau de Génomique Fonctionnelle et Structurale (GFS), intégré dans les locaux du Centre de Biologie Pathologie Génétique du CHU de Lille, développe son expertise notamment au service de la génomique humaine associée à des pathologies ciblées (cancers, maladies neuro-dégénératives...) et l'étude de modèles animaux.
+* Le plateau Transcriptomics and Applied Genomics (TAG)
+* Le plateau de Génomique Fonctionnelle et Structurale (GFS)
+La plateforme développe son expertise sur les approches suivantes :
+* '''Génomique « génomes entiers »''' : WGS, WES, amplicon-seq, Tn-seq, CGH-arrays.
+* '''Transcriptomique''' : RNA-seq, sRNA-seq, dRNA-seq, NGS-RACE, qRT-PCR, RNA-seq full-length, micro-arrays, DGE, single-cell.
+* '''Métagénomique''' : amplicon-seq ciblé 16S-ITS.
+De la réalisation des expérimentations à l’accompagnement des équipes, la plateforme apporte son expertise sur le traitement des données générées :
+* '''Assemblage, caractérisation et annotation génomiques, détection et annotation des variants, étude de transmission mendélienne'''.
+* '''Analyse différentielle d’expression''', analyse non supervisée.
+* '''Assignation taxonomique, évaluation diversité (α et β), mesure de dysbiose'''.
 |Discipline=Vie & Santé
 |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
-|Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/genomic-at-lille-go-l-625.html
+|Thematique=Plateforme de génomique, Transcriptomique, Single cell, RNA-Seq, Small RNA-Seq, Biostatistique, DGE
-|StatutPage=Page en construction
+|TypeDonnee=Données de séquençage, Données génomiques
+|Communaute=Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique.
+|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins
+|ConditionUsage=La soumission des projets se fait par l’intermédiaire du portail internet de France Génomique
+|Certification=IBiSA; http://www.ibisa.net/plateformes/
+|Relation=France Génomique, Transcriptomique et de Génomique Appliquée
 }}

« Go@l » : différence entre les versions

Go@l (voir la source)

Version du 18 avril 2025 à 15:21

« Go@l » : différence entre les versions