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« Systems Biomedicine » : différence entre les versions

Systems Biomedicine (voir la source)

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{{Infobox Service
{{Infobox Service
|NomService=NSBD
|NomService=Systems Biomedicine
|TypeService=Plateforme de calcul
|TypeService=Plateforme de calcul
|StatutService=En production
|StatutService=En production
|NomDéveloppé=Networks and Systems Biology for Diseases
|NomAlternatifRéduit=Biomédecine des systèmes
|NomAlternatifRéduit=Biologie des systèmes et des réseaux pour les maladies
|NomAlternatif=Networks and Systems Biology for Diseases, Biologie des systèmes et des réseaux pour les maladies
|UrlService=https://www.marseille-medical-genetics.org/a-baudot/
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|ContactMel=anais.baudot@univ-amu.fr
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|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage
|International=Non
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|NomAlternatif=Networks and Systems Biology for Diseases, Biologie des systèmes et des réseaux pour les maladies
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{{Coordonnées GPS
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{{Service
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|Description=L'équipe '''Networks and Systems Biology for Diseases (NSBD)''' a pour objectif de développer des algorithmes, des outils d'analyse et d'intégration de données biologiques et de proposer des approches "système" pour l'étude des pathologies génétiques humaines.
|Description=L'équipe '''Systems Biomedicine''' élabore des stratégies informatiques pour transformer les données biomédicales en connaissances sur les maladies génétiques.  
Elle est organisée en deux axes de recherche :
* Développements méthodologiques : Biologie des systèmes et théorie des réseaux
* Applications pour démêler les troubles humains




Pour ce qui est des outils, l'équipe se focalise particulièrement sur :
Elle fournit des solutions pour '''l'analyse et l'intégration des jeux de données en biomédecine'''. Elle exploite l'expertise numérique et développe de nouvelles approches informatiques.
* Des approches non-supervisées appliquées aux réseaux biologiques multi-couches et propose des '''outils de clustering, de marches aléatoires ou de network embedding'''.
* L'intégration de '''données quantitatives''' (transcriptomique, protéomique) dans les réseaux pour identifier des modules perturbés dans différentes conditions.
* L'intégration de '''données multi-omiques''' par des approches de réduction de dimension via des factorisations de matrices.
|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
|SousDisciplineSciences&Technologies=PE6 Sciences informatiques et informatique
|SousDisciplineSciences&Technologies=PE6 Sciences informatiques et informatique
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Génomique, Biostatistique, Logiciel, Séquençage
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Génomique, Biostatistique, Logiciel, Séquençage, Biomédecine
|Relation=IFB
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