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Ocean Gene Atlas (voir la source)

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modifications

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 {{Infobox Service
-|Logo=
+|Logo=Oga logo-300x300.png
 |NomService=Ocean Gene Atlas
 |TypeService=Plateforme d'accès
 |StatutService=En production
-|NomAlternatif=
+|NomAlternatif=OGA, Atlas génétique de l'océan
 |UrlService=https://tara-oceans.mio.osupytheas.fr/ocean-gene-atlas/
 |ContactMel=oceangeneatlas at mio.osupytheas.fr
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 |StructureAppartenance=MIO
 |Tutelle=Université de Toulon, CNRS, IRD, Université Aix-Marseille
-|IdentifiantService=
-|IDRNSR=
-|IDre3data=
-|IdentifiantAlternatif=
 |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Exposition, Réutilisation
 |CoordonneeGeographique=43.23215, 5.43621
 }}
 {{Service
-|Description=Le '''portail d'accès Ocean Gene Atlas''' permet d'accéder à trois objets de données complémentaires : les catalogues de séquences de gènes (ENA), le contexte environnemental des échantillons (PANGAEA) et les estimations de l'abondance des gènes dans les échantillons (calculées par la cartographie des séquences brutes lues sur les catalogues de gènes). Les requêtes de l'utilisateur sont composées soit d'une séquence (nucléique ou protéique), soit d'un modèle de Markov caché dérivé d'un alignement de séquences multiples. Les homologies de la requête utilisateur dans les catalogues de gènes sont identifiées à l'aide d'outils de recherche de similarité de séquence standard (par exemple BLAST ou HMMER), et leur abondance estimée basée sur la lecture est affichée sur des cartes du monde interactives et des parcelles écologiques. Un arbre phylogénétique est également déduit afin de situer la requête de l'utilisateur dans son contexte d'homologues du milieu marin ainsi que d'homologues connus à partir de séquences de référence.
+|Description=Le '''portail d'accès Ocean Gene Atlas, OGA''' ou Atlas génétique de l'océan est un service Web qui permet d'explorer la biogéographie des gènes d'organismes planctoniques marins.
+Il permet aux utilisateurs d'interroger les séquences de protéines ou de nucléotides par rapport aux catalogues mondiaux de gènes de référence océaniques : les catalogues de séquences de gènes (ENA), le contexte environnemental des échantillons (PANGAEA) et les estimations de l'abondance des gènes dans les échantillons (calculées par la cartographie des séquences brutes lues sur les catalogues de gènes).
+En un seul clic, l'abondance et la localisation des séquences cibles sont visualisées sur les cartes du monde ainsi que leur distribution taxonomique. Des panneaux de résultats interactifs permettent d'ajuster les seuils de qualité de l'alignement et d'afficher l'abondance des gènes dans le contexte des caractéristiques environnementales (température, nutriments, etc.) mesurées au moment de l'échantillonnage.
 |Discipline=Vie & Santé
 |SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes; Ecologie, évolution et biologie environnementale
 |Thematique=Biologie marine
-|TypeDonnee=
-|Communaute=
-|Beneficiaire=
-|Politique de données=
 |ConditionUsage=Open accès
 |ModeleEconomique=Accès gratuit
 |Certification=ELIXIR Data Resources;https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources
 |Cgu=https://tara-oceans.mio.osupytheas.fr/ocean-gene-atlas/termsOfUse
-|Relation=
-|PorteeInternationale=
 }}