Carbohydrate-Active enZYmes Database

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Carbohydrate-Active enZYmes Database
Type de service Entrepôt de données
Statut En production
Autres noms CAZy
URL http://www.cazy.org/
Contact cazy@afmb.univ-mrs.fr
Localisation Marseille
Structure d'appartenance Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques
Identifiant dans un autre catalogue http://doi.org/10.17616/R38W88 (re3data)


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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43° 14' 8.02" N, 5° 26' 22.63" E



En 1998, la base de données Carbohydrate-Active enZYmes Database (CAZy) est créée et mise à jour par l’équipe Glycogénomique du laboratoire Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques (AFMB). L’objectif de CAZy est d’établir les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Les enzymes actives sur les glucides (CAZymes) modifient, créent ou lysent les liaisons glycosidiques des sucres complexes et des polysaccharides qui sont utilisés par les êtres vivants. Ces glucides peuvent jouer le rôle de source de carbone, de signaux moléculaires spécifiques, de stockage de l’énergie ou intervenir dans les interactions hôtes-pathogènes. L’équipe Glycogénomique a développé une classification en familles qui relie la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification est composée de 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et les enzymes dites à activités auxiliaires). Les  modules de fixation aux sucres (Carbohydrate-Binding Modules) figurent également dans cette base de données. Un couplage entre la base de données CAZy et les moyens en bioinformatique permet d’examiner le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes. La classification CAZy est largement utilisée par la communauté scientifique pour ses données annotées (annotations structurales et fonctionnelles des protéines issues de GenBank, UniProt, Protein Data Bank).


Domaines scientifiques :Vie & Santé


Biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale et biophysique moléculaire; Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Base de données
  • Carbohydrate-Active enZYmes
  •  Enzymes actives sur les glucides
  • CAZymes
  • Glycoside hydrolases
  • Glycosyltransférases
  • Carbohydrate estérases
  • Polysaccharide lyases
  • Carbohydrate-Binding Modules
  • Catalyse enzymatique
  • Génomique
  • Bioinformatique

Type de données :Données annotées, Séquençage des protéines, Séquençage du génome,  Structure moléculaire, Structure 3D, Relation structure activité, Activité enzymatique

Communauté d'utilisateurs : Communauté de chercheurs en biologie structurale, génie génétique et bioinformatique Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Bioinformaticiens

Conditions d'usage : Utilisateurs : accès libre. Déposants : membres de l’équipe Glycogénomique du laboratoire Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques

Modèle économique : Gratuit

Certification/Label qualité :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance[modifier]