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{{Infobox Service | {{Infobox Service | ||
|Logo= | |Logo= | ||
|NomService=W4M | |NomService=W4M | ||
|TypeService=Outils de gestion des données | |TypeService=Outils de gestion des données | ||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
|NomAlternatif=Workflow4Metabolomics 3.0 | |NomAlternatif=Workflow4Metabolomics 3.0 | ||
|UrlService=https://workflow4metabolomics.org/ | |UrlService=https://workflow4metabolomics.org/, https://workflow4metabolomics.usegalaxy.fr/ | ||
|ContactMel=support * AT * workflow4metabolomics.org | |ContactMel=support * AT * workflow4metabolomics.org | ||
|Localisation=Villenave d'Ornon | |Localisation=Villenave d'Ornon | ||
|StructureAppartenance=MetaboHUB | |StructureAppartenance=MetaboHUB, IFB | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation | |Tutelle=CEA, CNRS, INRAE,Sorbonne Université, Université Libre de Bruxelles, University of Birmingham | ||
|IdentifiantService= | |||
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|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Exposition, Réutilisation | |||
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{{Coordonnées GPS | |||
|CoordonneeGeographique=44.78776, -0.5791 | |CoordonneeGeographique=44.78776, -0.5791 | ||
}} | }} | ||
{{Service | {{Service | ||
|Description='''Workflow4Metabolomics''', ''' | |Description='''Workflow4Metabolomics''', '''W4M''', est un '''portail collaboratif dédié au traitement, à l’analyse et à l’annotation des données métabolomiques'''. | ||
L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation. | '''L’Institut Français de Bioinformatique''' ([[IFB]]) et l’infrastructure MetaboHUB ont développé des pipelines complets de LC / MS, GC / MS et de RMN en utilisant le cadre de Galaxy pour l'analyse des données, y compris le prétraitement, la normalisation, le contrôle de la qualité, l'analyse statistique (univariée, multivariée PLS / OPLS) et les étapes d'annotation. | ||
W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. | W4M est une structure d'analyse des données permettant l'accès à des ressources de calcul de haute performance mais n'assure pas le stockage à long terme des données. W4M contribue aux initiatives de la Science ouverte et permet l'attribution de DOI. '''Les données et les flux de travail peuvent être réutilisés et partagés publiquement''', devenant ainsi des références utiles pour la communauté. Enfin, la plateforme propose de nombreux tutoriels et un service d'assistance. | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante= | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|Thematique=Analyse métabolomique, Annotation, Galaxy, Bioinformatique | |Thematique=Analyse métabolomique, Annotation, Galaxy, Bioinformatique | ||
|TypeDonnee=Données métabolomiques | |TypeDonnee=Données métabolomiques | ||
|Communaute=Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée | |Communaute=Communauté scientifique de recherche en métabolomique nationale et internationale, académique et privée | ||
|Beneficiaire=Chercheurs (public et privé), doctorantsbb8883749a4a8b8c85ee7cb2aa4676fd | |Beneficiaire=Chercheurs (public et privé), doctorantsbb8883749a4a8b8c85ee7cb2aa4676fd | ||
|Science ouverte=Politique de données | |||
|Politique de données=https://workflow4metabolomics.org/data-policy | |||
|ConditionUsage=Accès en ligne aux services de MetaboHUB via un formulaire de demande d'accès avec création d'un compte utilisateur | |ConditionUsage=Accès en ligne aux services de MetaboHUB via un formulaire de demande d'accès avec création d'un compte utilisateur | ||
|ModeleEconomique=Gratuit pour l'utilisateur final | |ModeleEconomique=Gratuit pour l'utilisateur final | ||
|Certification= | |||
|Cgu=https://ifb-elixirfr.gitlab.io/usegalaxy-fr/welcome//common/terms.html | |||
|Relation= | |||
|PorteeInternationale= | |||
}} | }} | ||
[[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]] | |||