« USCBF-CN » : différence entre les versions

Unité Gestion Chimiothèque Nationale
Type de service	Plateforme d'accès
Statut	En production
Autres noms	Unité de Gestion de la Chimiothèque Nationale, UGCN, UPS 3035
URL	http://ugcn.cn.cnrs.fr/ups3035/
Contact	philippe.jauffret@enscm.fr
Localisation	Montpellier
Structure d'appartenance	Chimiothèque Nationale
Tutelles

Version du 15 mars 2019 à 16:28

Créée en 2007, l'unité de gestion de la Chimiothèque Nationale (UGCN) est une unité propre de service du CNRS hébergée par l'Ecole Nationale de Chimie de Montpellier.

L’UGCN est chargée des aspects opérationnels de la Chimiothèque Nationale : l’aide au développement des chimiothèques et extractothèques, l’administration du système d'information, la communication et l’aide à la mise en place des collaborations scientifiques à l'interface chimie-biologie. Les missions de l’UGCN sont de :

Définir les normes de conditionnement des substances et de représentation de l'information chimique des collections (structures, nomenclatures, propriétés, codages des molécules, logiciel MDL Isis/Base, format SDF, format standard compatible avec le criblage à haut débit, livre blanc du chimiothécaire); -
Constituer et administrer une base de données regroupant des collections de produits chimiques de synthèse et de substances naturelles mises à disposition par les laboratoires publics français (70.000 composés et 15.000 extraits naturels, pour la plupart originaux et peu testés);
Enrichir cette base de données par de nouveaux descripteurs chimio-informatiques et des données d’activités biologiques mises à disposition par les laboratoires partenaires;
Faciliter la mise en place de collaborations scientifiques entre les laboratoires dépositaires des substances et des laboratoires publics ou privés de recherche en biologie : procédures simples, peu onéreuses et protégées juridiquement par un accord de transfert de matériel (MTA Material tranfer agreement, définit les termes de la collaboration scientifique entre chimiste et biologiste);
Promouvoir le criblage de la chimiothèque sur des cibles biologiques diversifiées afin d’offrir des services adaptés aux besoins des biologistes : Criblage total de la Chimiothèque Nationale, Criblage de la «Chimiothèque Essentielle » (sélection de 1040 composés « les plus divers »), Criblage de Chimiothèques « ciblées » sur des familles pour des tests biologiques particuliers, Criblage de Chimiothèque personnalisée (sélection de composés par l’utilisateur). Les résultats d’un criblage sont archivés à l’UGCN et renvoyés vers les équipes de la chimiothèque, chacun pour ses produits;
Former les nouveaux chimiothécaires à la création et l'administration de bases de données chimiques de leurs laboratoires.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

Chimie de synthèse et matériaux« Chimie de synthèse et matériaux » n’est pas dans la liste (PE1 Mathématiques, PE2 Constituants fondamentaux de la matière, PE3 Physique de la matière condensée, PE4 Chimie physique et analytique, PE5 Chimie de synthèse et matériaux, PE6 Sciences informatiques et informatique, PE7 Ingénierie des systèmes et de la communication, PE8 Ingénierie des produits et des procédés, PE9 Sciences de l'Univers, PE10 Sciences du Système Terre, ...) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Sciences & Technologies ». Biologie moléculaire et structurale et biochimie« Biologie moléculaire et structurale et biochimie » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :

Chimiothèque académique
Collections de produits de synthèse
Collections de composés naturels
Collections d’extraits naturels
Chimio-informatique
Logiciel MDL Isis/Base
Format SDF
Standard database format
Criblage biologique
Criblage haut débit
Relation structure activité
Visualisation structures chimiques

Type de données :Bases de données chimiques, Base de données structurales

Communauté d'utilisateurs : Chimistes des laboratoires publics qui sont membres du GIS Chimiothèque Nationale, Biologistes des laboratoires publics et privés Usagers et bénéficiaires :Chercheurs

Conditions d'usage : L'utilisateur s'enregistre en remplissant un formulaire, sélectionne des molécules et présente un projet. L'UGCN établit un accord de transfert de matériel (MTA , Material tranfer agreement) dans le cadre d"une collaboration scientifique.

Conditions tarifaires : Gratuit pour l'accès aux bases de données (nécessite un enregistrement préalable). Payant pour l'acquisition des produits issus des collections de la Chimiothèque Nationale (participation aux frais de conditionnement, de gestion de dossier et d’expédition)

Certification/Label :http://ugcn.cn.cnrs.fr/ups3035/certificat_ISO9001-_2018-2021.pdf (?)

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
ChemBioFrance	Chimiothèque Nationale USCBF-CN ADME-Tox Criblage Chémoinformatique
Chimiothèque Nationale	USCBF-CN

@@ Ligne 8 : / Ligne 8 : @@
 |Localisation=Montpellier
 |StructureAppartenance=Chimiothèque Nationale
-|PhaseCycleVie=Collecte, Réutilisation
+|PhaseCycleVie=Collecte, Conservation, Réutilisation
 |CoordonneeGeographique=43.62136, 3.86464
 }}
@@ Ligne 19 : / Ligne 19 : @@
 *Enrichir cette base de données par de nouveaux descripteurs chimio-informatiques et des données d’activités biologiques mises à disposition par les laboratoires partenaires;
 *Faciliter la mise en place de collaborations scientifiques entre les laboratoires dépositaires des substances et des laboratoires publics ou privés de recherche en biologie : procédures simples, peu onéreuses et protégées juridiquement par '''un accord de transfert de matériel''' (MTA Material tranfer agreement, définit les termes de la collaboration scientifique entre chimiste et biologiste);
-*Promouvoir le criblage de la chimiothèque sur des cibles biologiques diversifiées afin d’offrir des services adaptés aux besoins des biologistes : Criblage total de la Chimiothèque Nationale, Criblage de '''la «Chimiothèque Essentielle »''' (sélection de 1040 composés « les plus divers »), Criblage de '''Chimiothèques « ciblées »''' sur des familles pour des tests biologiques particuliers,  Criblage de '''Chimiothèque personnalisée''' (sélection de composés par l’utilisateur). Les résultats d’un criblage sont archivés à l’UGCN et renvoyés vers les équipes de la chimiothèque, chacun pour ses produits;
+*Promouvoir le criblage de la chimiothèque sur des cibles biologiques diversifiées afin d’offrir des services adaptés aux besoins des biologistes : Criblage total de la Chimiothèque Nationale, Criblage de '''la «Chimiothèque Essentielle »''' (sélection de 1040 composés « les plus divers »), Criblage de '''Chimiothèques « ciblées »''' sur des familles pour des tests biologiques particuliers,  Criblage de '''Chimiothèque personnalisée''' (sélection de composés par l’utilisateur). '''Les résultats d’un criblage''' sont '''archivés à l’UGCN''' et renvoyés vers les équipes de la chimiothèque, chacun pour ses produits;
 *Former les nouveaux chimiothécaires à la création et l'administration de bases de données chimiques de leurs laboratoires.
 |Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé