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A l’international, PlantBioinfoPF offre un service de portail de recherche aux fédérations de systèmes d’information comme [[WheatIS]]. En termes d’analyse des génomes, le service d’annotation des gènes et plus particulièrement des éléments transposables, qui s’appuie sur le pipeline [[REPET]], est également ouvert à l’international. L’ensemble de ces activités sont développées par l’Unité de recherche génomique-info ([[URGI]]) à laquelle la plateforme est adossée et s’intègrent dans l’offre de l’Institut français de bioinformatique ([[IFB]]), nœud français de l’infrastructure européenne ELIXIR. | A l’international, PlantBioinfoPF offre un service de portail de recherche aux fédérations de systèmes d’information comme [[WheatIS]]. En termes d’analyse des génomes, le service d’annotation des gènes et plus particulièrement des éléments transposables, qui s’appuie sur le pipeline [[REPET]], est également ouvert à l’international. L’ensemble de ces activités sont développées par l’Unité de recherche génomique-info ([[URGI]]) à laquelle la plateforme est adossée et s’intègrent dans l’offre de l’Institut français de bioinformatique ([[IFB]]), nœud français de l’infrastructure européenne ELIXIR. | ||
Expertises et services de la plateforme | Expertises et services de la plateforme : | ||
*Mise à disposition de ressources de calcul et de stockage, | *Mise à disposition de ressources de calcul et de stockage, | ||
*Publication et intégration de données FAIR (findable, accessible, interoperable, reusable), | *Publication et intégration de données FAIR (findable, accessible, interoperable, reusable), | ||
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*Formation à l'annotation des éléments transposables, à la standardisation de données… | *Formation à l'annotation des éléments transposables, à la standardisation de données… | ||
La plateforme de bioinformatique des plantes (PlantBioinfoPF) a un Plan de Gestion des Données (https://doi.org/10.15454/ | La plateforme de bioinformatique des plantes (PlantBioinfoPF) a un Plan de Gestion des Données (https://doi.org/10.15454/9HM5UI). | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante= | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique | |Thematique=Plateforme de bioinformatique | ||
|TypeDonnee= | |TypeDonnee= |