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« Ocean Gene Atlas » : différence entre les versions
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|Tutelle=Université de Toulon, CNRS, IRD, Université Aix-Marseille | |Tutelle=Université de Toulon, CNRS, IRD, Université Aix-Marseille | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Exposition, Réutilisation | |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Exposition, Réutilisation | ||
|CoordonneeGeographique=43.23215, 5.43621 | |CoordonneeGeographique=43.23215, 5.43621 | ||
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|Description=Le '''portail d'accès Ocean Gene Atlas''' permet d' | |Description=Le '''portail d'accès Ocean Gene Atlas, OGA''' ou Atlas génétique de l'océan est un service Web qui permet d'explorer la biogéographie des gènes d'organismes planctoniques marins. | ||
Il permet aux utilisateurs d'interroger les séquences de protéines ou de nucléotides par rapport aux catalogues mondiaux de gènes de référence océaniques : les catalogues de séquences de gènes (ENA), le contexte environnemental des échantillons (PANGAEA) et les estimations de l'abondance des gènes dans les échantillons (calculées par la cartographie des séquences brutes lues sur les catalogues de gènes). | |||
En un seul clic, l'abondance et la localisation des séquences cibles sont visualisées sur les cartes du monde ainsi que leur distribution taxonomique. Des panneaux de résultats interactifs permettent d'ajuster les seuils de qualité de l'alignement et d'afficher l'abondance des gènes dans le contexte des caractéristiques environnementales (température, nutriments, etc.) mesurées au moment de l'échantillonnage. | |||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes; Ecologie, évolution et biologie environnementale | |SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes; Ecologie, évolution et biologie environnementale | ||
|Thematique=Biologie marine | |Thematique=Biologie marine | ||
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|ModeleEconomique=Accès gratuit | |ModeleEconomique=Accès gratuit | ||
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