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{{Infobox Service | {{Infobox Service | ||
|Logo= | |Logo=Oga_logo.png | ||
|NomService=Ocean Gene Atlas | |NomService=Ocean Gene Atlas | ||
|TypeService=Plateforme d'accès | |TypeService=Plateforme d'accès | ||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
|NomAlternatif= | |NomAlternatif=OGA, Atlas génétique de l'océan | ||
|UrlService=https://tara-oceans.mio.osupytheas.fr/ocean-gene-atlas/ | |UrlService=https://tara-oceans.mio.osupytheas.fr/ocean-gene-atlas/ | ||
|ContactMel=oceangeneatlas at mio.osupytheas.fr | |ContactMel=oceangeneatlas at mio.osupytheas.fr | ||
|Localisation=Marseille | |Localisation=Marseille | ||
|StructureAppartenance= | |StructureAppartenance=MIO | ||
|Tutelle= | |Tutelle=Université de Toulon, CNRS, IRD, Université Aix-Marseille | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Exposition, Réutilisation | |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Exposition, Réutilisation | ||
}} | |||
{{Coordonnées GPS | |||
|CoordonneeGeographique=43.23215, 5.43621 | |CoordonneeGeographique=43.23215, 5.43621 | ||
}} | }} | ||
{{Service | {{Service | ||
|Description=Le portail d'accès Ocean Gene Atlas permet d' | |Description=Le '''portail d'accès Ocean Gene Atlas, OGA''' ou Atlas génétique de l'océan est un service Web qui permet d'explorer la biogéographie des gènes d'organismes planctoniques marins. | ||
Il permet aux utilisateurs d'interroger les séquences de protéines ou de nucléotides par rapport aux catalogues mondiaux de gènes de référence océaniques : les catalogues de séquences de gènes (ENA), le contexte environnemental des échantillons (PANGAEA) et les estimations de l'abondance des gènes dans les échantillons (calculées par la cartographie des séquences brutes lues sur les catalogues de gènes). | |||
En un seul clic, l'abondance et la localisation des séquences cibles sont visualisées sur les cartes du monde ainsi que leur distribution taxonomique. Des panneaux de résultats interactifs permettent d'ajuster les seuils de qualité de l'alignement et d'afficher l'abondance des gènes dans le contexte des caractéristiques environnementales (température, nutriments, etc.) mesurées au moment de l'échantillonnage. | |||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante= | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution | ||
|Thematique=Biologie marine | |Thematique=Biologie marine, Plancton | ||
|ConditionUsage=Open accès | |ConditionUsage=Open accès | ||
|ModeleEconomique=Accès gratuit | |ModeleEconomique=Accès gratuit | ||
|Certification=ELIXIR Data Resources;https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources | |Certification=ELIXIR Data Resources;https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources | ||
|Cgu=https://tara-oceans.mio.osupytheas.fr/ocean-gene-atlas/termsOfUse | |Cgu=https://tara-oceans.mio.osupytheas.fr/ocean-gene-atlas/termsOfUse | ||
|Relation= | |Relation=Tara Océan | ||
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