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{{Infobox Service | {{Infobox Service | ||
|Logo=LogoMS4OMICSOrange.jpg | |||
|NomService=MS4OMICS | |NomService=MS4OMICS | ||
|TypeService=Plateforme d'acquisition | |TypeService=Plateforme d'acquisition | ||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
|NomAlternatif=Clic Imaging (Ancien nom) | |NomAlternatif=Plateforme de protéomique de la MSAP, Mass spectrometry plateform, Clic Imaging (Ancien nom), Top Omics (Ancien nom) | ||
Top Omics (Ancien nom) | |||
|UrlService=https://msap-lab.fr/proteomique/ | |UrlService=https://msap-lab.fr/proteomique/ | ||
|ContactMel=msap-plateformes@univ-lille.fr | |ContactMel=msap-plateformes@univ-lille.fr | ||
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}} | }} | ||
{{Service | {{Service | ||
|Description=MS4Omics est | |Description=La '''plateforme MS4Omics''' est spécialisée dans la protéomique basée sur la spectrométrie de masse pour les tissus et les fluides biologiques, l’industrie alimentaire, le patrimoine culturel, l’imagerie. Elle a pour vocation de mettre à disposition des équipes : '''des équipements, des compétences scientifiques adaptés aux demandes'''. | ||
Elle | |||
Deux types de services sont offerts par la plateforme : | Deux types de services sont offerts par la plateforme : | ||
* L’'''accès direct''' aux instruments | |||
* Les '''collaborations''' qui représentent souvent des projets de plus grande ampleur. | |||
* | La plateforme réalise : | ||
* les | * Identification de protéines par digestion enzymatique à partir d’échantillons variés | ||
* Quantification de protéine par méthode Label Free, SILAC, TMT | |||
* Quantification ciblée avec l’utilisation de peptides AQUA et de la méthode PRM | |||
* Analyse de protéines intactes. Analyse de modifications post-traductionelles (phosphorylation, glycosylation…) | |||
* Enrichissement en phospho ou glycopeptides / protéines avec utilisation de colonne à façon | |||
* Analyse d’échantillons d’héritage culturel, d’archéologie ou paléontologie | |||
* Analyse de lipides comme les triacylglycéroles ou de métabolomique. | |||
La plateforme possède '''différents logiciels d’analyse''' MASCOT Distiller, Proteome discover, PEAKS X, Proteome deconvolution, Maxquant, Skyline, la suite de logiciel pour les MALDI TOF et TOF-TOF, le FT-ICR. Ainsi qu’un serveur avec les bases de données Swissprot, NCBi mais aussi des '''bases de données internes'''. | |||
|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé | |Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé | ||
|SousDisciplineSciences&Technologies=PE4 Chimie physique et analytique | |SousDisciplineSciences&Technologies=PE4 Chimie physique et analytique | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|Thematique=Spectrométrie de masse, | |Thematique=Spectrométrie de masse, Protéomique, Paléoprotéomique | ||
|Communaute=Communauté de | |TypeDonnee=Données expérimentales, Données instrumentales, Base de données | ||
|Beneficiaire= | |Communaute=Communauté de recherche de l'Université de Lille et dans la mesure des possibilités, de l'ESR et acteurs privés | ||
|Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/ | |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants, Ingénieurs et Industriels | ||
|Relation=Infranalytics | |Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/organomics-540.html, | ||
|Relation=Infranalytics, ProFI, OrganOmics, 3DCellOmics | |||
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