LIGAN-PM

LIGAN-PM

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Autres noms	FG LIGAN-PM, Plateforme de séquençage LIGAN, Lille Integrative Genomic Advanced Network Genomic Platform
URL	http://ligan.good.cnrs.fr/
Contact	http://ligan.good.cnrs.fr/informations-pratiques/contact/
Localisation	Lille
Structure d'appartenance	France Génomique
Tutelles	CNRS, Université de Lille

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

Documentation

Stockage

Conservation

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Localisée à l’Institut Européen de Génomique du Diabète (EGID) sur le site du CHRU de Lille, la plateforme lilloise LIGAN-PM est dédiée au séquençage de nouvelle génération (Next Generation Sequencing – NGS) de l’exome, du génome et du transcriptome humain pour une médecine personnalisée, et inclut aussi d’autres technologies de pointe (génotypage, microfluidique…).

La plateforme a développé des protocoles adaptés à la recherche en génétique des maladies humaines. Ceci à des fins de diagnostic étiologique des maladies génétiques rares ou fréquentes et de médecine personnalisée. LIGAN-PM est un outil de collaboration scientifique de haute expertise en génétique humaine et une plateforme de service ouverte aux organismes publics et privés.

L’équipe est constituée de plusieurs groupes : un groupe de biologistes pour le développement et l’application de protocoles, un groupe expérimenté en bioinformatique pour l’analyse des données à l’issue du séquençage, un groupe bio-statistique et un groupe pour le management des ressources informatiques afin de gérer les analyses bioinformatiques et de stoker les données générées pendant la durée du projet, et au-delà.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes« Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de génomique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique. Usagers et bénéficiaires :Chercheur, enseignant-chercheur, médecin

Conditions d'usage : La soumission des projets se fait obligatoirement par l’intermédiaire du portail internet de France Génomique

Conditions tarifaires :

Certification/Label :Mise en place de la certification NF EN ISO 15189 (http://ligan.good.cnrs.fr/qualite/)

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
France Génomique	GeT LIGAN-PM GenomiqueENS TGML

Centre National de la Recherche Scientifique