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Gentyane (voir la source)

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{{Infobox Service
{{InfoboxStructureService
|Logo=Logo gentyanev7.jpg
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|NomService=Gentyane
|Nom=Gentyane
|NomAlternatif=Plateforme de GENoTYpage et séquençage en AuvergNE
|Url=https://gentyane.clermont.inrae.fr/
|Tutelle=INRAE, Université Clermont Auvergne
|IDRNSR=201923155R
|Localisation=Clermont-Ferrand
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|StatutService=En production
|StatutService=En production
|NomAlternatif=Plateforme de GENoTYpage et séquençage en AuvergNE
|UrlService=https://gentyane.clermont.inrae.fr/
|ContactMel=gentyane@inrae.fr , charles.poncet@inrae.fr , vincent.pailler@inrae.fr
|ContactMel=gentyane@inrae.fr , charles.poncet@inrae.fr , vincent.pailler@inrae.fr
|Localisation=Clermont-Ferrand
|StructureAppartenance=GDEC, INRAE Genomics
|StructureAppartenance=INRAE
|PhaseCycleVie=Planification, Collecte, Analyse, Stockage
|Tutelle=INRAE
}}
|IDRNSR=201923155R
{{Coordonnées GPS
|PhaseCycleVie=Planification, Analyse, Stockage
|CoordonneeGeographique=45.77568, 3.14227
}}
}}
{{Service
{{ServiceStructure
|Description=La plate-forme GENTYANE est rattachée à INRAE (Centre de Auvergne Rhône Alpes) et plus particulièrement au Département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP). Gentyane a été labélisée Infrastructure Scientifique Collective INRAE en 2019. En 2020, associée aux plateformes GeT de Toulouse, PGTB de Bordeaux et EPGV d'Evry, nous constituons l'Infrastructure Genomics INRAE. Gentyane est labellisée IBISA depuis 2009 et membre du noyau central du PIA France Génomique en 2020. La plateforme est certifiée ISO 9001:  2015 depuis 2012 et NF-X 50 900 depuis 2014. Elle est intégrée à l’UMR INRAE-Université Clermont Auvergne(UCA) 1095 « Génétique, Diversité et Écophysiologie des Céréales (GDEC) » et membre du réseau de plateforme UCA Partner. Elle a été créée à partir de financements obtenus de la DSPPV INRA, du Conseil Régional Auvergne Rhône Alpes, du GIS IBISA et de fonds Européens FEDER.
|Description=La '''plateforme de services génomiques Gentyane''', '''Génotypage et Séquençage à Haut Débit''', assure une mission de R&D et de service pour la communauté scientifique et des partenaires socio-économiques d’une large gamme d’application de '''génotypage sur puce à haut débit''', et de '''séquençage Longs Fragments à haut débit'''.
 
La plate-forme GENTYANE est rattachée à INRAE (Centre de Auvergne Rhône Alpes) et plus particulièrement au Département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP). Gentyane a été labélisée Infrastructure Scientifique Collective INRAE en 2019. En 2020, associée aux plateformes GeT de Toulouse, PGTB de Bordeaux et EPGV d'Evry, nous constituons l'Infrastructure Genomics INRAE. Gentyane est labellisée IBISA depuis 2009 et membre du noyau central du PIA France Génomique en 2020. La plateforme est certifiée ISO 9001:  2015 depuis 2012 et NF-X 50 900 depuis 2014. Elle est intégrée à l’UMR INRAE-Université Clermont Auvergne(UCA) 1095 « Génétique, Diversité et Écophysiologie des Céréales (GDEC) » et membre du réseau de plateforme UCA Partner. Elle a été créée à partir de financements obtenus de la DSPPV INRA, du Conseil Régional Auvergne Rhône Alpes, du GIS IBISA et de fonds Européens FEDER.


Elle a pour objectifs scientifiques : (1) d’appuyer les recherches conduites dans les différentes équipes  de l’UMR GDEC; (2) de réaliser des prestations de génotypage et séquençage pour le compte d’autres équipes INRAE ou d’autres organismes publics et privés; (3) d’assurer une veille technologique permettant de mettre en place de nouveaux outils répondant mieux, plus rapidement et à un coût moindre aux attentes des utilisateurs.
Elle a pour objectifs scientifiques :  
#d’appuyer les recherches conduites dans les différentes équipes  de l’UMR GDEC;  
#de réaliser des prestations de génotypage et séquençage pour le compte d’autres équipes INRAE ou d’autres organismes publics et privés;  
#d’assurer une veille technologique permettant de mettre en place de nouveaux outils répondant mieux, plus rapidement et à un coût moindre aux attentes des utilisateurs.


Si la plate-forme n’a pas d’activité de recherche propre, hormis pour des développements technologiques, elle s’implique de façon active aux programmes auxquels elle contribue en agissant en tant qu’interlocuteur principal pour les choix des marqueurs et des techniques les mieux adaptés aux finalités des projets.
Si la plate-forme n’a pas d’activité de recherche propre, hormis pour des développements technologiques, elle s’implique de façon active aux programmes auxquels elle contribue en agissant en tant qu’interlocuteur principal pour les choix des marqueurs et des techniques les mieux adaptés aux finalités des projets.
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|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution
|SousDisciplineVie&Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution
|Thematique=Génomique
|Thematique=Génomique, Transcriptomique, Séquençage de génome, Séquençage ARN et microARN, PCR quantitative, Microarray, Épigénétique, Métagénomique, Génotypage
Transcriptomique
Séquençage de génome
Séquençage ARN et microARN
PCR quantitative
Microarray
Épigénétique
Métagénomique
Génotypage
|TypeDonnee=Génomique
|TypeDonnee=Génomique
|Communaute=Communauté scientifique publique et privée
|Communaute=Communauté scientifique publique et privée
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|Science ouverte=Politique de données
|Science ouverte=Politique de données
|Politique de données=PGD de structure DMP Opidor
|Politique de données=PGD de structure DMP Opidor
|ConditionUsage=Pour soumettre un projet à Gentyane, utiliser le formulaire de contact disponible sur le site internet de la plateforme. Décrire brièvement le projet et la stratégie que vous souhaiteriez mettre en œuvre. L'expert responsable de la technologie concernée par votre demande vous recontactera pour étudier avec vous la faisabilité du projet, la meilleure approche à utiliser et la nature des services que la plateforme peut vous offrir. Une réponse vous sera adressée dans les deux semaines suivant la demande. Le délai nécessaire à la réalisation des projets varie entre 48 heures et 2 mois selon le type de technologie et de service sollicités.
|ModeleEconomique=Prestations payantes
|ModeleEconomique=Prestations payantes
|Certification=ISC Inrae, membre de l'Infrastructure de Recherche INRAE Genomic's
|Certification=IBiSA;http://www.ibisa.net/plateformes/,
IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)
ISO 9001;https://qualite.ibisa.net/certificats/gentyane-QMS-FRAFR-COFRAC.pdf ,
 
NFX 50-900;https://qualite.ibisa.net/certificats/gentyane-NFX50-FRAFR.pdf,
ISO 9001  
ISC INRAE;https://www.inrae.fr/liste-infrastructures-scientifiques-collectives
NFX 50-900
|Relation=GeT, EPGV, PGTB, CNRGV, France Génomique
}}
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