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|Logo=Cropped-data-analysis-core 2-coul rvb gb.png
|Logo=Cropped-data-analysis-core 2-coul rvb gb.png
|NomService=DAC
|NomService=DAC
|TypeService=Plateforme d'accès
|TypeService=Plateforme de calcul
|StatutService=En production
|StatutService=En production
|NomAlternatif=The Data Analysis Core
|NomAlternatif=The Data Analysis Core, Centre d’analyse des données, Plateforme d’informatique biomédicale Data Analysis Core
|UrlService=https://dac.institutducerveau-icm.org/
|UrlService=https://dac.institutducerveau-icm.org/
|ContactMel=dac@icm-institute.org
|ContactMel=dac@icm-institute.org
|Localisation=Paris
|Localisation=Paris
|StructureAppartenance=ICM
|StructureAppartenance=ICM, IFB
|Tutelle=CNRS, AP-HP, INSERM, Sorbonne Université
|Tutelle=CNRS, AP-HP, INSERM, Sorbonne Université
|PhaseCycleVie=Planification, Analyse, Documentation, Stockage, Conservation, Exposition
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage, Réutilisation
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{{Coordonnées GPS
{{Coordonnées GPS
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{{Service
{{Service
|Description='''The Data Analysis Core (DAC)''' fournit à l'Institut du Cerveau de Paris un soutien structurel et une expertise dans le '''traitement, l'intégration et l'analyse de données''' de la recherche fondamentale et clinique en neurosciences.
|Description=La '''plateforme d’informatique biomédicale Data Analysis Core (DAC)''' fournit à l'Institut du Cerveau de Paris un soutien structurel et donne accès à des solutions logicielles et à une expertise méthodologique pour une variété de processus de gestion et d'analyse de données biomédicales. Cela comprend la '''définition et la mise en œuvre de bonnes pratiques dans les processus de curation, de normalisation, d'annotation et de structuration des données spécifiques au domaine'''. L'objectif est d'atteindre des normes de qualité élevées en matière de cohérence, de fiabilité, de valeur et d'interopérabilité des données.  


Les activités du Data Analysis Core exploitent les équipements de calcul haute performance gérés par le département IT, dont une plateforme Bio-IT Illumina DRAGEN, des serveurs de base de données, un stockage haute performance, un cluster de 800 cœurs et des serveurs d'application. En collaboration avec les chercheurs, les plateformes et les services de soutien à la recherche de l'institut, le Data Analysis Core facility optimise l'institut pour le cloud computing à haut débit, le stockage, le traitement et le partage des données, afin de permettre à ses chercheurs de répondre à leurs questions.
Les activités du Data Analysis Core exploitent les '''équipements de calcul haute performance''' gérés par le département IT, dont une plateforme Bio-IT Illumina DRAGEN, des serveurs de base de données, un stockage haute performance, un cluster de 800 cœurs et des serveurs d'application.


Elle est organisé en quatre divisions :
Elle est organisée en quatre divisions :


* La '''division Bioinformatique''' développe, exécute des pipelines et fournit des interfaces pour traiter et visualiser les données de séquençage de nouvelle génération (NGS), y compris la génomique (panel de gènes, séquençage de l'exome entier et du génome entier), la transcriptomique (analyses de l'ARN-seq en vrac et de l'ARN-seq dans une seule cellule), l'épigénomique (accessibilité de la chromatine ATAC-seq) et la ChIP-seq (liaison des protéines).  
* La '''division Bioinformatique''' développe, exécute des pipelines et fournit des interfaces pour traiter et visualiser les données de séquençage de nouvelle génération (NGS), y compris la génomique (panel de gènes, séquençage de l'exome entier et du génome entier), la transcriptomique (analyses de l'ARN-seq en vrac et de l'ARN-seq dans une seule cellule), l'épigénomique (accessibilité de la chromatine ATAC-seq) et la ChIP-seq (liaison des protéines).  




* '''La division Biostatistique''' fournit un soutien expert en matière d'analyse statistique pour tout type de données biologiques. Elle fonctionne comme un service d'assistance réactif qui fournit un soutien en matière d'analyse statistique aux chercheurs tout au long de leurs projets de recherche. Elle anticipe et répond aux besoins émergents de l'institut en concevant des méthodes statistiques avancées pour traiter l'analyse intégrée de données multidimensionnelles et multimodales, y compris les données omiques, électrophysiologiques, d'imagerie cellulaire, de neuro-imagerie et cliniques.t des analyses pour les analyses morphologiques et les statistiques descriptives.
* '''La division Biostatistique''' fournit un soutien expert en matière d'analyse statistique pour tout type de données biologiques. Elle fonctionne comme un service d'assistance réactif qui fournit un soutien en matière d'analyse statistique aux chercheurs tout au long de leurs projets de recherche. Elle anticipe et répond aux besoins émergents de l'institut en concevant des méthodes statistiques avancées pour traiter l'analyse intégrée de données multidimensionnelles et multimodales.




* '''La division Analyse d'images'''  aide les chercheurs à analyser les images provenant de toutes les technologies d’imagerie en étroite collaboration avec les plateformes QUANT, CENIR et Histomics, y compris la photonique/électromicroscopie et la neuro-imagerie. La division fournit une assistance dans le cadre de projets de segmentation et de classification basées sur l’IA et développe des outils et des analyses pour les analyses morphologiques et les statistiques descriptives.
* '''La division Analyse d'images'''  aide les chercheurs à analyser les images provenant de toutes les technologies d’imagerie en étroite collaboration avec les plateformes QUANT, CENIR et Histomics. La division fournit une assistance dans le cadre de projets de segmentation et de classification basées sur l’IA et développe des outils et des analyses pour les analyses morphologiques et les statistiques descriptives.


   
   
* '''La division Gestion des données''' offre un soutien opérationnel aux chercheurs dans la gestion des exigences croissantes en matière de trouvabilité, d'accès, d'interopérabilité et de réutilisation de leurs données (FAIR) en fournissant des bases de données et des interfaces web sécurisées selon des modèles de données partagés.
* '''La division Gestion des données''' offre un soutien opérationnel aux chercheurs dans la gestion des exigences croissantes en matière de trouvabilité, d'accès, d'interopérabilité et de réutilisation de leurs données (FAIR) en fournissant des bases de données et des interfaces web sécurisées selon des modèles de données partagés.
 
 
Les équipes de l'ICM ont, dans cet optique, élaboré un modèle de '''Plan de gestion de données''' [[Propose un modèle de DMP::https://dmp.opidor.fr/template_export/266355240.pdf|DMP-ICM]] proposé dans l’outil DMP OPIDoR.
|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
|SousDisciplineSciences&Technologies=PE6 Sciences informatiques et informatique
|SousDisciplineSciences&Technologies=PE6 Sciences informatiques et informatique
|SousDisciplineVie&Sante=LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux
|Thematique=Plateforme de bioinformatique
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Biostatistique, Génomique, Logiciel, Analyse à grande échelle, Séquençage
|Communaute=Communauté scientifique dans le domaine des neurosciences
|Beneficiaire=Chercheurs, cliniciens
|Beneficiaire=Chercheurs, cliniciens
|Relation=IFB, NeurATRIS
|Relation=NeurATRIS, ICONICS, France Génomique
|StatutPage=Page en construction
|StatutPage=Page en construction
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