CATdb

CATdb

Type de service	Entrepôt de données
Statut	En production
Autres noms	Complete Arabidopsis Trancriptome database
URL	http://tools.ips2.u-psud.fr/CATdb, http://tools.ips2.u-psud.fr/GEM2NET/
Contact	gnet.db@ips2.upsaclay.fr
Localisation	Gif-sur-Yvette
Structure d'appartenance	IPS2
Tutelles	CNRS, INRAE

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Documentation

Conservation

Exposition

Réutilisation

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CATdb met à disposition les analyses de transcriptome réalisées par la plateforme POPS de l’IPS2 (cf. SPOMICS), depuis les plans expérimentaux jusqu’aux analyses différentielles en passant par les descriptions complètes des échantillons et leurs traitements, pour plusieurs espèces végétales. Le module GEM2Net donne accès aux méta-analyses du transcriptome d’Arabidopsis thaliana sous conditions de stress variées.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes« Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :

Type de données :Données et Analyses transcriptomiques

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation : http://tools.ips2.u-psud.fr/CATdb/terms/ten/

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IPS2	CATdb

Centre National de la Recherche Scientifique