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Nom d'usage institut du CNRS
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(Nom d'usage institut du CNRS)
 
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{{Infobox Service
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|TypeService=Plateforme de calcul
|TypeService=Plateforme de calcul
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atgc-hts@lirmm.fr
atgc-hts@lirmm.fr
|Localisation=Montpellier
|Localisation=Montpellier
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|StructureAppartenance=IFB, LIRMM
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|Tutelle=CNRS, IRD
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|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation
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{{Coordonnées GPS
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|CoordonneeGeographique=43.63687, 3.84071
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{{Service
{{Service
|Description=ATGC, plateforme de bioinformatique de Montpellier a la triple vocation de diffuser les outils bioinformatiques développés au sein de la communauté montpelliéraine, de favoriser les collaborations entre partenaires informaticiens et biologistes, et d’apporter une aide à ces chercheurs en mettant en place des services bioinformatiques en lien direct avec leurs travaux.
|Description=ATGC, plateforme de bioinformatique de Montpellier fournit des services de génomique évolutive, comparative et fonctionnelle. Elle met en avant les développements méthodologiques réalisés par l'équipe Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB) du LIRMM. Ces développements sont diffusés à la communauté scientifique sous forme de services en libre accès sur le site web de la plateforme. La plupart des outils peuvent être utilisés directement en ligne, via une interface web dédiée à partir de laquelle chaque utilisateur peut charger ses propres données. Ces interfaces ont été conçues pour faciliter la présentation des outils, l'analyse et l'interprétation des résultats.  


Expertise :
Expertise :
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*Analyse génomique : recherche de mutations, insertion délétions, réarrangements
*Analyse génomique : recherche de mutations, insertion délétions, réarrangements
*Mapping de reads génomiques ou transcriptomiques
*Mapping de reads génomiques ou transcriptomiques
[[Commentaire Annuaire CNRS:: Plateforme CNRS Sciences informatiques qui est un site d'implantation de l'Institut Francais de Bioinformatique]]
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|Thematique=Plateforme de bioinformatique
|Thematique=Plateforme de bioinformatique
|TypeDonnee=
|Communaute=
|Beneficiaire=
|ConditionUsage=Les outils sont accessibles en ligne gratuitement. Ils peuvent être téléchargés et/ou exécutés sur les clusters du LIRMM.
|ConditionUsage=Les outils sont accessibles en ligne gratuitement. Ils peuvent être téléchargés et/ou exécutés sur les clusters du LIRMM.
|ModeleEconomique=
|Certification=IBiSA;http://www.ibisa.net/plateformes/
|Certification=IBiSA, RENABI, Cancéropôle Grand Sud Ouest
|Relation=France Génomique, CNRS Sciences informatiques
|Cgu=
|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/
}}
}}
[[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]] [[Catégorie:Catalogue CNRS Sciences informatiques]]