« ARTbio » : différence entre les versions

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(Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=Jd0fTL6e 400x400.jpg |NomService=ARTbio |TypeService=Plateforme de calcul |StatutService=En production |NomAlternatif=Bioinformatics analyses platform |UrlService=https://www.artbio.fr/ |ContactMel=artbio@listes.upmc.fr |Localisation=Paris |StructureAppartenance=IBPS |Tutelle=INSERM, CNRS, Sorbonne Université |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage }} {{Coordonnées GPS |CoordonneeGeographique=48.84707, 2.36063 }} {{Service |Descr... »)
 
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{{Service
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|Description=ARTbio s’appuie sur l’outil Galaxy, une plateforme ouverte et collaborative qui intègre un ensemble de logiciels d’analyses de données. Galaxy a été créé pour décrire et reproduire précisément les chaînes de traitements informatiques. Il permet aux chercheurs qui ont peu de connaissances en bioinformatique de les acquérir et de mener ainsi eux-mêmes leurs analyses. Une interface web permet de suivre pas à pas les étapes de l’analyse à réaliser et de tester facilement ses différents paramètres. Une communauté s’est formée autour du projet Galaxy, et ses membres enrichissent en permanence la plateforme des logiciels qu’ils ont développés ou qui ont été rendus publics.
|Description='''ARTbio''' est une plateforme de service s’appuyant sur l’outil '''Galaxy''', une plateforme ouverte et collaborative qui intègre un ensemble de '''logiciels d’analyses de données'''. Il permet aux chercheurs qui ont peu de connaissances en bioinformatique de les acquérir et de mener ainsi eux-mêmes leurs analyses. l’objectif est d’amener les chercheurs à réaliser leurs propres analyses, en rendant accessibles les outils dont ils ont besoin, en les aidant à choisir la meilleure stratégie et à identifier les paramètres les plus adaptés à leurs analyses. Une interface web permet de suivre pas à pas les étapes de l’analyse à réaliser et de tester facilement ses différents paramètres.


Pour l’équipe de la plateforme, l’objectif est d’amener les chercheurs à réaliser leurs propres analyses, en rendant accessibles les outils dont ils ont besoin, en les aidant à choisir la meilleure stratégie et à identifier les paramètres les plus adaptés à leurs analyses.
L’équipe d’ARTbio développe actuellement un logiciel visant à analyser la présence de nouveaux virus à partir des expériences de séquençages d’ARN. Elle développe également un outil de virtualisation, qui permet à tout utilisateur d’exécuter ses propres codes sans quitter l’environnement Galaxy, ainsi que le logiciel "Galaxy-Kick-Start", qui permet de déployer rapidement des serveurs Galaxy personnalisés et adaptés à chaque projet d'analyse.
 
|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
Mais ARTbio souhaite être plus qu’une simple plateforme de service et continuer à développer de nouveaux logiciels et à participer à l’enrichissement du système Galaxy. L’équipe d’ARTbio développe ainsi actuellement un logiciel visant à analyser la présence de nouveaux virus à partir des expériences de séquençages d’ARN. Elle développe également un outil de virtualisation, qui permet à tout utilisateur d’exécuter ses propres codes sans quitter l’environnement Galaxy, ainsi que le logiciel "Galaxy-Kick-Start", qui permet de déployer rapidement des serveurs Galaxy personnalisés et adaptés à chaque projet d'analyse
|SousDisciplineSciences&Technologies=PE1 Mathématiques; PE6 Sciences informatiques et informatique
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative; LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Génomique
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Génomique
|Relation=IFB
|Relation=IFB
|StatutPage=Page en construction
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