Bureaucrates, emailconfirmed, Administrateurs d’interface, Administrateurs (MediaWiki Sémantique), Masqueurs de modifications, Administrateurs
3 732
modifications
« ARTbio » : différence entre les versions
aucun résumé des modifications
Aucun résumé des modifications |
Aucun résumé des modifications |
||
| (8 versions intermédiaires par le même utilisateur non affichées) | |||
| Ligne 8 : | Ligne 8 : | ||
|ContactMel=artbio@listes.upmc.fr | |ContactMel=artbio@listes.upmc.fr | ||
|Localisation=Paris | |Localisation=Paris | ||
|StructureAppartenance=IBPS | |StructureAppartenance=IBPS, IFB | ||
|Tutelle=CNRS, Sorbonne Université | |Tutelle=CNRS, Sorbonne Université | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage | |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage | ||
| Ligne 17 : | Ligne 17 : | ||
{{Service | {{Service | ||
|Description='''ARTbio''' est une plateforme de service s’appuyant sur l’outil '''Galaxy''', une plateforme ouverte et collaborative qui intègre un ensemble de '''logiciels d’analyses de données'''. Il permet aux chercheurs qui ont peu de connaissances en bioinformatique de les acquérir et de mener ainsi eux-mêmes leurs analyses. L’objectif est d’amener les chercheurs à réaliser leurs propres analyses, en rendant accessibles les outils dont ils ont besoin, en les aidant à choisir la meilleure stratégie et à identifier les paramètres les plus adaptés à leurs analyses. | |Description='''ARTbio''' est une plateforme de service s’appuyant sur l’outil '''Galaxy''', une plateforme ouverte et collaborative qui intègre un ensemble de '''logiciels d’analyses de données'''. Il permet aux chercheurs qui ont peu de connaissances en bioinformatique de les acquérir et de mener ainsi eux-mêmes leurs analyses. L’objectif est d’amener les chercheurs à réaliser leurs propres analyses, en rendant accessibles les outils dont ils ont besoin, en les aidant à choisir la meilleure stratégie et à identifier les paramètres les plus adaptés à leurs analyses. | ||
Cet objectif est abordé à travers 3 axes: | Cet objectif est abordé à travers 3 axes: | ||
| Ligne 23 : | Ligne 22 : | ||
* '''Enseignement''' (accompagnement, journées de formation, séminaires, documentation) | * '''Enseignement''' (accompagnement, journées de formation, séminaires, documentation) | ||
* '''Développement''' (outils, workflows, environnements d'analyse, stockage, etc) | * '''Développement''' (outils, workflows, environnements d'analyse, stockage, etc) | ||
L’équipe d’ARTbio développe actuellement un logiciel visant à analyser la présence de nouveaux virus à partir des expériences de séquençages d’ARN. Elle développe également un outil de virtualisation, qui permet à tout utilisateur d’exécuter ses propres codes sans quitter l’environnement Galaxy, ainsi que le logiciel "Galaxy-Kick-Start", qui permet de déployer rapidement des serveurs Galaxy personnalisés et adaptés à chaque projet d'analyse. | L’équipe d’ARTbio développe actuellement un logiciel visant à analyser la présence de nouveaux virus à partir des expériences de séquençages d’ARN. Elle développe également un outil de virtualisation, qui permet à tout utilisateur d’exécuter ses propres codes sans quitter l’environnement Galaxy, ainsi que le logiciel "Galaxy-Kick-Start", qui permet de déployer rapidement des serveurs Galaxy personnalisés et adaptés à chaque projet d'analyse. | ||
| Ligne 28 : | Ligne 28 : | ||
|SousDisciplineSciences&Technologies=PE6 Sciences informatiques et informatique | |SousDisciplineSciences&Technologies=PE6 Sciences informatiques et informatique | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Génomique | |Thematique=Plateforme de bioinformatique, Génomique, Logiciel, Analyse à grande échelle, Séquençage | ||
|TypeDonnee=Données computationnelles | |TypeDonnee=Données computationnelles | ||
|Communaute=Communautés académique et privée | |Communaute=Communautés académique et privée | ||
|Beneficiaire=Biologistes, Médécins | |Beneficiaire=Biologistes, Médécins | ||
|ConditionUsage=Création de compte | |ConditionUsage=Création de compte | ||
|Relation= | |Certification=IBiSA; http://www.ibisa.net/plateformes/ | ||
|Relation=Inserm, France Génomique | |||
}} | }} | ||