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« ARTbio » : différence entre les versions
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|ContactMel=artbio@listes.upmc.fr | |ContactMel=artbio@listes.upmc.fr | ||
|Localisation=Paris | |Localisation=Paris | ||
|StructureAppartenance=IBPS | |StructureAppartenance=IBPS, IFB | ||
|Tutelle= | |Tutelle=CNRS, Sorbonne Université | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage | |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage | ||
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{{Service | {{Service | ||
|Description='''ARTbio''' est une plateforme de service s’appuyant sur l’outil '''Galaxy''', une plateforme ouverte et collaborative qui intègre un ensemble de '''logiciels d’analyses de données'''. Il permet aux chercheurs qui ont peu de connaissances en bioinformatique de les acquérir et de mener ainsi eux-mêmes leurs analyses. | |Description='''ARTbio''' est une plateforme de service s’appuyant sur l’outil '''Galaxy''', une plateforme ouverte et collaborative qui intègre un ensemble de '''logiciels d’analyses de données'''. Il permet aux chercheurs qui ont peu de connaissances en bioinformatique de les acquérir et de mener ainsi eux-mêmes leurs analyses. L’objectif est d’amener les chercheurs à réaliser leurs propres analyses, en rendant accessibles les outils dont ils ont besoin, en les aidant à choisir la meilleure stratégie et à identifier les paramètres les plus adaptés à leurs analyses. | ||
Cet objectif est abordé à travers 3 axes: | |||
* '''Services''' (services d'analyse ou de projets collaboratifs, services web en ligne) | |||
* '''Enseignement''' (accompagnement, journées de formation, séminaires, documentation) | |||
* '''Développement''' (outils, workflows, environnements d'analyse, stockage, etc) | |||
L’équipe d’ARTbio développe actuellement un logiciel visant à analyser la présence de nouveaux virus à partir des expériences de séquençages d’ARN. Elle développe également un outil de virtualisation, qui permet à tout utilisateur d’exécuter ses propres codes sans quitter l’environnement Galaxy, ainsi que le logiciel "Galaxy-Kick-Start", qui permet de déployer rapidement des serveurs Galaxy personnalisés et adaptés à chaque projet d'analyse. | L’équipe d’ARTbio développe actuellement un logiciel visant à analyser la présence de nouveaux virus à partir des expériences de séquençages d’ARN. Elle développe également un outil de virtualisation, qui permet à tout utilisateur d’exécuter ses propres codes sans quitter l’environnement Galaxy, ainsi que le logiciel "Galaxy-Kick-Start", qui permet de déployer rapidement des serveurs Galaxy personnalisés et adaptés à chaque projet d'analyse. | ||
|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé | |Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé | ||
|SousDisciplineSciences&Technologies= | |SousDisciplineSciences&Technologies=PE6 Sciences informatiques et informatique | ||
|SousDisciplineVie&Sante= | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Génomique | |Thematique=Plateforme de bioinformatique, Génomique, Logiciel, Analyse à grande échelle, Séquençage | ||
| | |TypeDonnee=Données computationnelles | ||
| | |Communaute=Communautés académique et privée | ||
|Beneficiaire=Biologistes, Médécins | |||
|ConditionUsage=Création de compte | |||
|Certification=IBiSA; http://www.ibisa.net/plateformes/ | |||
|Relation=Inserm, France Génomique | |||
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