USCBF-CN
| Type de service | Plateforme d'accès |
|---|---|
| Statut | En production |
| Autres noms | Unité de Gestion de la Chimiothèque Nationale, UGCN, UPS 3035 |
| URL | http://ugcn.cn.cnrs.fr/ups3035/ |
| Contact | philippe.jauffret@enscm.fr |
| Localisation | Montpellier |
| Structure d'appartenance | Chimiothèque Nationale |
| Tutelles | |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
L’UGCN est chargée des aspects opérationnels de la Chimiothèque Nationale : l’aide au développement des chimiothèques et extractothèques, l’administration du système d'information, la communication et l’aide à la mise en place des collaborations scientifiques à l'interface chimie-biologie. Les missions de l’UGCN sont de :
- Définir les normes de conditionnement des substances et de représentation de l'information chimique des collections (structures, nomenclatures, propriétés, codages des molécules, logiciel MDL Isis/Base, format SDF, format standard compatible avec le criblage à haut débit, livre blanc du chimiothécaire); -
- Constituer et administrer une base de données regroupant des collections de produits chimiques de synthèse et de substances naturelles mises à disposition par les laboratoires publics français (70.000 composés et 15.000 extraits naturels, pour la plupart originaux et peu testés);
- Enrichir cette base de données par de nouveaux descripteurs chimio-informatiques et des données d’activités biologiques mises à disposition par les laboratoires partenaires;
- Faciliter la mise en place de collaborations scientifiques entre les laboratoires dépositaires des substances et des laboratoires publics ou privés de recherche en biologie : procédures simples, peu onéreuses et protégées juridiquement par un accord de transfert de matériel (MTA Material tranfer agreement, définit les termes de la collaboration scientifique entre chimiste et biologiste);
- Promouvoir le criblage de la chimiothèque sur des cibles biologiques diversifiées afin d’offrir des services adaptés aux besoins des biologistes : Criblage total de la Chimiothèque Nationale, Criblage de la «Chimiothèque Essentielle » (sélection de 1040 composés « les plus divers »), Criblage de Chimiothèques « ciblées » sur des familles pour des tests biologiques particuliers, Criblage de Chimiothèque personnalisée (sélection de composés par l’utilisateur). Les résultats d’un criblage sont archivés à l’UGCN et renvoyés vers les équipes de la chimiothèque, chacun pour ses produits;
- Former les nouveaux chimiothécaires à la création et l'administration de bases de données chimiques de leurs laboratoires.
Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé
Chimie de synthèse et matériaux
Biologie moléculaire et structurale et biochimie
Thématique et/ou mots clés :
- Chimiothèque académique
- Collections de produits de synthèse
- Collections de composés naturels
- Collections d’extraits naturels
- Chimio-informatique
- Logiciel MDL Isis/Base
- Format SDF
- Standard database format
- Criblage biologique
- Criblage haut débit
- Relation structure activité
- Visualisation structures chimiques
Type de données :Bases de données chimiques, Base de données structurales
Communauté d'utilisateurs : Chimistes des laboratoires publics qui sont membres du GIS Chimiothèque Nationale, Biologistes des laboratoires publics et privés Usagers et bénéficiaires :Chercheurs
Conditions d'usage :
Conditions tarifaires :
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation :
| Structure | Services proposés |
|---|---|
| ChemBioFrance | Chimiothèque Nationale USCBF-CN ADME-Tox Criblage Chémoinformatique |
| Chimiothèque Nationale | USCBF-CN |