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E
'''EarthPortal''' est le foyer des '''ontologies et des artefacts sémantique du système Terre. ''' En téléchargeant et partageant une ontologie sur EarthPortal, il est possible de : * Découvrir de nouvelles perspectives et connaissances en explorant d'autres ontologies ou ressources sémantiques dans le répertoire. * Contribuez au '''partage de connaissances et à l'interopérabilité sémantique du domaine'''. * '''Cartographier une ontologie avec d'autres ontologies pertinentes''' dans le domaine et collaborer avec d'autres utilisateurs. * Obtenir des retours et des suggestions d'autres utilisateurs qui peuvent utiliser et commenter l'ontologie. * '''Décrire précisément une ontologie avec des métadonnées pertinentes et obtenir un score FAIR'''.  +
'''EcoTaxa''' est une '''application web''' qui '''permet de stocker et classer des images d'organismes individuels, principalement du plancton''', en utilisant une taxonomie de référence. Les images et les métadonnées associées aux organismes qu'elles représentent sont chargées dans l'application afin de prédire leur identification (classification automatique). Les utilisateurs enregistrés peuvent ensuite valider cette classification ou améliorer le tri en visualisant celles-ci via un interface web dédié. Toutes les activités sont enregistrées afin de permettre un contrôle qualité. ECOTAXA accueille aujourd'hui plus de 50 millions d'images acquises avec différents types d'instruments. Environ 30% sont déjà validées. Ecotaxa est aujourd'hui la plus grande base d'images de plancton triée. L'application web EcoTaxa est hébergée et maintenue par la plateforme d’imagerie quantitative de Villefranche-sur-Mer - PIQv (Laboratoire d'Océanographie de Villefranche LOV - Institut de la Mer de Villefranche IMEV dédiée à l’analyse d’imagerie quantitative du plancton et des détritus aquatiques. Cette plateforme est intégrée dans l’offre de services de l’Infrastructure de Recherche EMBRC France, nœud français d’EMBRC.  +
S
'''En libre accès''', '''la base de données sPlotOpen''' contient près de '''100 000 relevés de végétation''' issus de '''114 pays''' et représentatifs de la diversité des bioclimats terrestres sur tous les continents sauf l’Antarctique. Chaque relevé de végétation donne '''la composition complète des espèces végétales''' qui cohabitent au sein de la même communauté. Le but est de limiter tout biais biogéographique pour de futures analyses globales sur le devenir des communautés végétales terrestres en contexte de changements globaux. Le projet sPlotOpen a été porté par '''le Centre Allemand de Recherche Intégrative sur la Biodiversité''' (iDiv) et '''le laboratoire [https://www.u-picardie.fr/edysan/ Ecologie et dynamique des systèmes anthropisés]''' ('''EDYSAN''' – UMR CNRS / Univ. Jules Verne) en collaboration avec l'Université Martin-Luther de Halle-Wittenberg (MLU). Cette base de données est le fruit d’un effort collaboratif regroupant 161 chercheurs et chercheuses issues de 57 pays. Les laboratoires français impliqués sont : * le [https://umr-marbec.fr/ laboratoire Biodiversité Marine, Exploitation et Conservation] (MARBEC – CNRS / Ifremer / IRD / Univ. Montpellier) ; * le [https://amap.cirad.fr/ laboratoire Botanique et modélisation de l'architecture des plantes et des végétation] (AMAP – CNRS / IRD / CIRAD / INRAE / Univ Montpellier) ; * [https://www.imbe.fr/ l’Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale] (IMBE – Avignon Univ. / IRD / Aix-Marseille Univ / CNRS) ; * le [https://www.cefe.cnrs.fr/ Centre d'écologie fonctionnelle et évolutive] (CEFE – CNRS / Univ. Montpellier / IRD / EPHE) ; * [http://www.ibmp.cnrs.fr/ l’Institut de biologie moléculaire des plantes] (IBMP - CNRS).  
E
'''Eskemm Numérique''', Groupement d’Intérêt Public (GIP) Numérique de Bretagne, est un centre de ressources et de compétences dont les missions principales sont : * Créer et opérer le '''Datacenter Eskemm Data''', une infrastructure mutualisée de '''stockage et traitement de données''', '''mésocentre de calculs''' et de services associés ; * Assurer l’animation et le développement d’Eskemm C@mpus, une infrastructure de communication collaborative ; * Apporter un service numérique Eskemm Network, un Réseau d’Accès Ultra Haut Débit qui permet le transport des services de RENATER jusqu’aux sites bénéficiaires.  +
'''Estrades : Services de TRanscription, d’Analyse et de Diffusion pour l’Édition Structurée''' est une plateforme qui propose des solutions techniques, des outils et un accompagnement pour les questions relatives à l''''édition structurée et critique de sources textuelles ou graphiques''', depuis l'acquisition des données jusqu'à leur diffusion, en passant par leur analyse et leur enrichissement. L'acronyme sous entend une infrastructure relativement simple mais suffisamment stable, permettant le mise en avant des projets qu’elle soutient. Deux démarches guident les réflexions de la plateforme : * La science ouverte, d'une part, par la '''réutilisation et la réutilisabilité des ressources, jeux de données et outils''' * La volonté de '''développer et de soutenir des solutions énergétiquement et technologiquement plus sobres'''.  +
'''Euclid''' est un '''satellite de cosmologie observationnelle multi-sonde''' (oscillations acoustiques des baryons, cisaillement gravitationnel, distorsions de redshifts, etc.) sélectionné par l’Agence Spatiale Européenne (ESA) en 2012 pour un lancement désormais prévu en 2023. Le télescope de 1,2 m est équipé de deux instruments panoramiques, VIS – un imageur optique – et NISP – à la fois un imageur et un spectrographe sans fente travaillant dans le domaine infrarouge. Au final, le sondage est prévu pour durer 6 ans et couvrir un champ de 15 000 deg². Le '''consortium international Euclid''' dirigé par la France regroupe 17 pays européens, organisés autour d’un consortium scientifique de plus de 1200 personnes inscrites, incluant un groupe d’une quarantaine de chercheurs des Etats-Unis. La mission est sous responsabilité ESA avec une participation minoritaire de la NASA. Le consortium a la responsabilité de définir les objectifs de la mission, de préparer son exploitation scientifique et de livrer à l’ESA les deux instruments embarqués, le spectrographe et caméra infrarouge NISP, et l’imageur visible VIS. Le consortium doit aussi livrer à l’ESA l’ensemble des logiciels du segment sol pour le traitement des données. Les données Euclid seront rendues publiques par l'intermédiaire de trois "[https://www.euclid.caltech.edu/page/data-release-timeline data releases]" (DR) et quatre "quick releases" (Q). DR1 couvrira la première année de prise de données (~2500 degrés carrés) et sera livré un peu plus de 2 ans après le début de la prise de données nominales d'Euclid. DR2 couvrira 3 ans (~7500 degrés carrés), livré après 4 ans de prise de données. Enfin, DR3 couvrira les 6 années complètes de fonctionnement d'Euclid avec 15000 degrés carrés. Les "quick releases" Q1 à Q4 sont livrées lors des années sans DR, Q1 étant prévue 14 mois après le début de la prise de données.  +
'''Euris Cloud Santé''' intervient comme '''Hébergeur certifié HDS et comme Tiers de confiance''', notamment pour des services de pseudonymisation de donnée de santé, de chiffrement et d’analyse de données (RMO) du Système National de Données de Santé. Il dispose d’infrastructures IT répondants aux '''normes de sécurité les plus élevées, en conformité avec les principaux cadres réglementaires appliqués à la gestion de données de santé en France et à l’international''' : RGPD, ISO 27001/27701, HDS (Europe).  +
'''Europarser''' est un outil qui permet de '''compiler''' et de '''formater des corpus''' issus de '''la base Europresse''' et exportés en HTML. Les formats de sortie proposés par cet outil sont directement exploitables dans des logiciels de traitement textuel comme Iramuteq ou TXM. Europarser est développé par le '''CERES''', Centre d’expérimentation en méthodes numériques pour les recherches en Sciences Humaines et Sociales.  +
'''European Molecular Biology Laboratory, EMBL''' est une '''organisation internationale''' qui possède une grande expertise en '''biologie moléculaire structurale'''. Elle vise à poursuivre des recherches fondamentales en biologie moléculaire, à proposer des services aux scientifiques de ses 21 états membres, à former des scientifiques de haut niveau ou encore à développer de nouvelles méthodologies pour la recherche en biologie. Composé de 6 sites de recherche (Heidelberg et Hambourg (Allemagne), Grenoble (France), Monterotondo (Italie), Hinxton (Royaume-Uni), Barcelone (Espagne)), chacun des centres a un domaine de recherche spécifique : biologie et imagerie cellulaires, biologie structurale, développement de modèles murins, bioinformatique et biologie des systèmes. L’EMBL propose un programme international de doctorat en sciences de la vie et un programme d’accueil de post-doctorants. L’EMBL organise de nombreux cours et conférences (EMBL courses and conferences, EMBL-EBI trainings). L’EMBL fournit aussi des services informatiques en particulier des bases de données et des logiciels d’analyse bioinformatique dans tous les champs d’expertise du laboratoire. L'EMBL développe des plateformes technologiques accessibles aux chercheurs des États Membres dans les domaines de la biologie biologie structurale, de l’imagerie et des technologies « omics ». Tous les résultats de la recherche (articles de recherche, données, logiciels, conceptions matérielles, réactifs, protocoles et autres produits similaires) doivent être mis à la disposition du public sans délai. Infrastructure dotée d’une politique de données FAIR en application.  +
'''European Plate Observing System France''' ('''Epos-France''') est une infrastructure de recherche (IR) nationale inscrite sur la feuille de route des infrastructures de recherche éditée par le MESR. L’Institut national des sciences de l’Univers du CNRS coordonne le consortium Epos-France, composé de la majorité des universités et organismes français concernés par la recherche en Géosciences. Une grande part des recherches françaises portant sur la Terre solide rejoindront progressivement l’IR Epos‑France, qui représente la participation française à [[EPOS ERIC|EPOS]], l’IR européenne dont la mission est d’intégrer les IR nationales et transnationales chargées d’observer et comprendre notre planète. Epos-France a pris la suite de Résif, le Réseau sismologique et géodésique français, qui a déployé sur le territoire national depuis 2011 une instrumentation moderne (sismomètres, stations GNSS et gravimètres) pour la mesure des déformations de la surface terrestre et initié des recherches transverses. Epos-France assure la '''mise à disposition libre et gratuite de données géophysiques et géologiques ainsi que de produits et outils associés''', tant par ses propres canaux de diffusion nationaux que via la plateforme européenne d’EPOS. Celle-ci propose un accès pérenne et coordonné aux données multidisciplinaires européennes et favorise l’interopérabilité mondiale dans le domaine des sciences de la Terre. Epos-France est au cœur des grands sujets sociétaux, comme la gestion des ressources (du sous-sol, en eau…), les problématiques associées à la sismicité induite, les risques telluriques (séismes, éruptions volcaniques, glissements de terrain…) ainsi que les aléas naturels multipliés par le changement climatique ou encore par l’évolution de l’urbanisation. Epos-France constitue donc également, par l’ensemble de ses activités, un appui aux politiques publiques et aux acteurs impliqués dans la surveillance et la gestion des risques telluriques et dans l’utilisation raisonnée des ressources du sous-sol. Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://gricad-gitlab.univ-grenoble-alpes.fr/OSUG/RESIF/. Infrastructure dotée d’une politique de données FAIR en application. Les données validées et décrites sont publiées sur un entrepôt de données https://seismology.resif.fr/fr/page-daccueil-2/  
'''ExpoDoR''' propose ses compétences aux chercheurs de l’ESR pour '''gérer, partager et diffuser leurs données (bases, collections, jeux de données)''' : * '''Traitement des objets''' # Numérisation des documents # Reconnaissance optique de caractères (OCR) des textes imprimés # Création de fichiers de métadonnées pour chaque document * '''Préparation des données et métadonnées''' # Structuration et reformatage de grands volumes de données # Normalisation des métadonnées selon les standards internationaux # Enrichissement avec des référentiels généralistes ou spécialisés et avec des terminologies # Attribution d’un identifiant pérenne * '''Partage et exposition des données''' : # Création et paramétrage d’une bibliothèque virtuelle avec '''le logiciel libre Omeka S''' * '''Accompagnement à la gestion de vos collections de données''' # Aide à l’administration de la bibliothèque virtuelle via Omeka S.  +
F
'''F-CRIN''' - '''French Clinical Research Infrastructure Network''' est une '''infrastructure nationale en recherche clinique'''. L’Infrastructure F-CRIN est une plateforme de soutien et de structuration de réseaux nationaux de recherche, d’expertise et d’investigation clinique dans des thématiques médicales ciblées. Modèle original d’organisation intégrée et fédérative, elle constitue une communauté nationale transversale d’expertises complémentaires de pointe (médicales, scientifiques, méthodologique). F-CRIN sélectionne, soutient et accompagne des réseaux de recherche clinique français d’envergure nationale et des plateformes de services de pointe selon un cahier des charges précis. La labélisation est attribuée par le Conseil de gouvernance de l’Infrastructure à l’issue de campagnes d’appels à candidature sur évaluation positive par le conseil scientifique international de F-CRIN. F-CRIN compte à l’heure actuelle 21 composantes, dont 16 réseaux nationaux thématiques de recherche et d’investigation clinique, 3 réseaux d’expertise ciblées, une plateforme de services de pointe en recherche clinique, et une coordination nationale qui assure une double fonction de représentation de l’Infrastructure et de centrale de services supports pour l’ensemble des composantes. F-CRIN est la composante française de [[:ECRIN ERIC|ECRIN ERIC]], European clinical research infrastructure network, réseau européen de recherche clinique. Les données validées et décrites sont publiées sur un entrepôt de données [http://www.fcrin.org www.fcrin.org]  +
'''FAIR-Checker''' est un outil en ligne ayant pour vocation d''''évaluer la qualité des métadonnées''' présentées par les ressources numériques. Il offre deux facettes principales : * Un module "Check" qui propose une évaluation approfondie des métadonnées pour chacun des principes et des recommandations techniques * Un module "Inspect" qui aide les utilisateurs à améliorer la qualité des métadonnées et, par conséquent, le caractère FAIR de leur ressource. FAIR-Checker s'appuie sur les '''normes et technologies du web sémantique''', telles que les requêtes SPARQL et les contraintes SHACL, pour évaluer automatiquement les principes FAIR. Les utilisateurs sont informés des '''métadonnées manquantes, nécessaires ou recommandées''' pour diverses catégories de ressources.  +
'''FAIR-EASE''' a pour objectif global de personnaliser et d''''exploiter des services distribués et intégrés pour l'observation et la modélisation du système terre, de l'environnement et de la biodiversité''' en améliorant leurs différents composants mis en œuvre en étroite collaboration avec les communautés d'utilisateurs, l'European Open Science Cloud (EOSC) et les infrastructures de recherche dans leur conception et leur disponibilité durable.  +
'''FAIR-IMPACT''' identifie des pratiques, des politiques, des outils et des spécifications techniques pour guider les chercheurs, les gestionnaires de référentiels, les organismes de recherche, les décideurs politiques et les citoyens scientifiques '''vers un cycle de gestion des données FAIR'''. L'accent est mis sur '''les identificateurs persistants (PID), les métadonnées, les ontologies, les mesures, la certification et l'interopérabilité''', en commençant par des cas d'utilisation réels en sciences sociales et humaines, en sciences des photons et des neutrons, en sciences de la vie et en sciences agroalimentaires et environnementales.  +
'''FAIRDATACITÉ''' propose un dispositif d’'''accompagnement à la gestion des données de la recherche, tout au long de leur cycle de vie'''. Il s’inscrit dans le cadre des ateliers de la donnée de l'écosystème Recherche Data Gouv. Il s’adresse aux doctorants, chercheurs, équipes de recherche, personnels d’appui à la recherche de l’université Paris Cité, de l’Institut de physique du globe de Paris (IPGP), de l’Institut Pasteur. Le dispositif d’accompagnement de FAIRDATACITÉ se décline en une offre de '''9 services''' : # '''Accompagnement à la rédaction de plans de gestion de données''': formation généraliste, accompagnement personnalisé, '''incitation et accompagnement à la mise en place de PGD d’entité''', consignes générales sur les sites de Science ouverte d’UPCité ou de l’Institut Pasteur. # Développement de la culture de la donnée # Sensibilisation aux questions juridiques, éthiques et à la sécurité informatique # '''Sensibilisation aux bonnes pratiques de gestion des codes et logiciels''' # '''Accompagnement au traitement et à l’exploitation des données''' # Sensibilisation aux pratiques de conservation/suppression des données # '''Curation et accompagnement au dépôt de jeux de données''' # Valorisation de données FAIR # '''Structuration et animation du réseau des référents science ouverte ''' Il prend également la forme d'un '''guichet unique''' pour que les chercheurs posent toutes leurs questions en lien avec la gestion des données de la recherche.  +
'''FG-DIRAC''' offre aux utilisateurs, à travers une interface web, une solution générale pour l’'''accès aux ressources de l’infrastructure ainsi que la gestion des tâches de calcul et des données scientifiques distribuées'''. DIRAC permet l’'''intégration de ressources hétérogènes'''. Il donne une '''solution au problème d’interopérabilité entre les différentes grilles de calcul, clouds et clusters locaux'''. Le service est basé sur le logiciel DIRAC qui est un cadre logiciel pour créer des systèmes de calculs distribués. Ce service, basé sur l’instance FG-DIRAC, est disponible pour les membres de plusieurs organisations virtuelles dont la VO vo.france-grilles.fr.  +
'''FG-iRODS''' est un service de '''stockage hautement disponible et personnalisable s’appuyant sur le logiciel iRODS'''. Le service iRODS offre à ses utilisateurs de l’espace de '''stockage via un système de virtualisation du stockage des données''' qui permet, entre autres, * de '''créer des collections de données et de les gérer''' simplement ; * d’'''assurer une haute disponibilité des données''' en les distribuant sur des systèmes distants ou en les répliquant ; * d’organiser l’arborescence des fichiers indépendamment de leur organisation physique sur les serveurs de données ; * de '''rechercher des lots de données via un catalogue de métadonnées''' contenant les informations relatives à l’état des données et leur description ; * de '''contrôler finement l’accès aux données''' ; * de '''faciliter la gestion de grandes collections de données''' en appliquant des politiques et des règles de gestion des données définies par l’utilisateur afin d’automatiser les tâches administratives et de renforcer la sécurité et l’intégrité des données ; * d’accéder aux données à distance depuis des ordinateurs individuels, des grilles ou des « clouds ». Ce service s’adresse à tous les acteurs scientifiques (individu ou groupe) de tous les domaines scientifiques qui ont des besoins en terme de stockage ou bien des problématiques de gestion des données. L’offre du service iRODS par France-Grilles inclue la prise en main d'iRODS et l’accompagnement des utilisateurs dans la conception des règles d’administration des données.  +
'''FR-SOLARIS''' est l’Infrastructure de Recherche française sur le '''solaire thermique concentré''' porté par le laboratoire PROMES (PRocédés, Matériaux et Énergie Solaire) du CNRS, suite au [https://www.equipex-socrate.fr/uploads/pdfs/documents/SOCRATE%20Brochure.pdf projet SOCRATE] (solaire concentré, recherches avancées et technologies énergétiques). Elle offre à la communauté scientifique nationale et internationale des moyens d’essais, des concentrateurs solaires et l’instrumentation associée nécessaires à la recherche fondamentale et appliquée. FR-SOLARIS met à disposition des chercheurs plusieurs équipements localisés sur les sites suivants : * Odeillo : 12 fours solaires de 1,5 à 1000 kW de puissance thermique (avec leurs 68 héliostats), 1 microcentrale cylindro-parabolique de 150 kW et 1 parabole de 50 kW ; * Targasonne : 1 tour solaire (Thémis) de 5000 kW avec 107 héliostats. Ces fours solaires permettent la réalisation de mesures et tests à haute température (jusqu’à 3 000 °C). Les objectifs sont l’amélioration des technologies de '''conversion et stockage de l’énergie solaire thermique''', ainsi que le développement des connaissances (photophysique/photochimie, thermochimie, thermique, métallurgie, nanomatériaux et matériaux céramiques). FR-SOLARIS est le noeud français de l’infrastructure [[:EU-SOLARIS|EU-SOLARIS]] (European SOLAR Research Infrastructure for Concentrating Solar power). Une partie des publications issues de projets utilisant l’infrastructure est en accès ouvert. FR-SOLARIS partage des données soit via prestation (archives météo), soit lors de collaboration (contribution en nature lors de projet). Ces services existent en interne à l'infrastructure : leur accès public n’est pas généralisé, mais est parfois fait, au cas par cas.  +
'''Fink''' a pour fonction d'explorer sans relâche les événements variables et transitoires du ciel. Sa mission principale est l’'''exploitation scientifique du flux d’alertes gigantesque''' que produira l’Observatoire Rubin à partir de fin 2024. Basé sur le '''cloud VirtualData''', Fink analyse depuis 2020 les données du relevé astronomique Zwicky Transient Facility avec une '''approche systémique, mêlant informatique, astronomie et cosmologie''', et réunissant plusieurs communautés scientifiques. Chaque nuit, ce sont des centaines de milliers d’alertes venant de multiples phénomènes astrophysiques qui sont décortiquées à la loupe des algorithmes de traitement se basant sur l’intelligence artificielle.  +