BAliBASE
| Type de service | Plateforme d'accès |
|---|---|
| Statut | En production |
| Autres noms | Benchmark Alignment dataBASE |
| URL | http://lbgi.fr/balibase/ |
| Contact | thompson@unistra.fr |
| Localisation | Strasbourg |
| Structure d'appartenance | IGBMC |
| Tutelles | CNRS, INSERM, Université de Strasbourg |
| Identifiants | |
| re3data | 10.17616/R31NJMHE |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
BAliBASE est une base de données qui contient des alignements de séquences multiples de haute qualité, construits manuellement et accompagnés d'annotations détaillées. Les alignements sont tous basés sur des superpositions structurelles tridimensionnelles, à l'exception des séquences transmembranaires.
Les utilisateurs peuvent :
- Consulter une liste de tous les alignements
- Télécharger la base de données complète par ftp
- Obtenir le programme "c" pour comparer un alignement test avec la référence BAliBASE,
- Consulter les résultats d'une étude comparative de plusieurs programmes d'alignement multiple, en utilisant les ensembles de référence BAliBASE.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération Thématique et/ou mots clés :
- Alignement
- Séquence transmembranaire
- Bioinformatique
- Permutation circulaire
Type de données :Base de données
Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique, académique Usagers et bénéficiaires :Chercheur, Enseignant-chercheur, Doctorant
Conditions d'usage : Accès libre. Le code source de BAliBASE est disponible gratuitement.
Conditions tarifaires : Accès gratuit
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation :
| Structure | Services proposés |
|---|---|
| IGBMC | BAliBASE GenomEast |