ENA
Type de service Entrepôt de données
Caractéristiques de l'entrepôt
Type d’entrepôt Disciplinaire
Type de restriction Soumis à la création d'un compte
Hébergement des données UE
Identifiant pérenne
Identifiants fournis ID interne, BioSample
Identifiants utilisés
Formats de fichiers acceptés
Schéma de métadonnées
Licence des jeux de données Creative Commons
Conditions d'accès aux données Ouvert, Embargo
Modération / Curation Les métadonnées sont modérées automatiquement via une checklist, à laquelle s'ajoute une vérification manuelle selon les cas. Il y a une prise de contact en direct avec les contributeurs dans certains cas.
Volumétrie maximale définie
Politique de conservation des données Cet entrepôt existe depuis 1985.
Interopérabilité machine API REST, FTP
Versioning
Statut En production
Autres noms European Nucleotide Archive, Archive européenne des nucléotides
URL https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
Contact https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/support
Localisation Saffron Walden (Angleterre)
Structure d'appartenance EMBL-EBI
Tutelles
Identifiants
re3data 10.17616/R3HW3J
Identifiant dans un autre catalogue https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.dj8nt8 (FAIRsharing)


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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L'Archive européenne des nucléotides (ENA) capture et présente les informations relatives aux flux de travail expérimentaux basés sur le séquençage des nucléotides. Elle enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre les informations d'entrée, les données de sortie de la machine et les informations interprétées.

Les données qui parviennent à l'ENA proviennent de différentes sources. Il s'agit notamment de données brutes, de séquences assemblées et d'annotations provenant d'efforts de séquençage à petite échelle, de données fournies par les principaux centres de séquençage européens et d'échanges réguliers et complets avec nos partenaires de l'International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).

Dans le cadre de l'effort mondial visant à améliorer l'accès aux données de séquençage de nucléotides et leur utilisation, l'ENA collabore largement au développement de nos services et de nos technologies, ainsi qu'aux activités de normalisation.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Biologie moléculaire
  • Génomique

Type de données :Séquences nucléotidiques, Données brutes, Annotations

Communauté d'utilisateurs : Communauté de recherche en sciences de la vie Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants


Conditions d'usage :

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :Entrepôt CoSO (https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiance-pour-le-depot-de-donnees-methodologie-et-analyse-de-loffre-existante/)

Conditions générales d'utilisation : https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/


Portée internationale de ENA

ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/)

Global Core Biodata Resources (https://globalbiodata.org/what-we-do/global-core-biodata-resources/)


Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
EMBL-EBIENA
PRIDe