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I
L’infrastructure INGESTEM développe les '''applications médicales issues des cellules souches humaines embryonnaires (ESC) et pluripotentes induites (iPSC)'''. L’objectif est d’accélérer le développement des technologies de pointe et la recherche translationnelle pour modéliser des maladies via les iPSC avec le but de développer des nouvelles thérapies cellulaires et génique pour des futures applications, médecine régénérative et de cancérologie.
INGESTEM rassemble des plateformes de culture de cellules souches, de reprogrammation et d’ingénierie cellulaire, de génomique fonctionnelle et d’édition du génome, de transgénèse dans les modèles primates, de criblage moléculaire et d’usines cellulaires automatisées.
NGESTEM développe aujourd’hui la banque nationale d’IPSC « Haplobank » au sein d’une plateforme universitaire à Genopole pour générer des lignées d’IPSC de grade clinique qui permettront de générer des « MTI » médicaments de thérapies innovantes, pour des essais cliniques Phase I/II en médecine régénérative et immuno- oncologie.
Une partie des publications issues de projets utilisant l’infrastructure est en accès ouvert. +
L'Institut national d'histoire de l'art est un '''établissement public à caractère scientifique''', culturel et professionnel (EPSCP), destiné à promouvoir la recherche scientifique en histoire de l'art.
Au service des chercheurs et de toute personne ou institution intéressée par '''la recherche en histoire de l'art''', l'INHA développe et met en valeur '''l'activité scientifique de la discipline'''.
L'INHA donne accès à '''un large public, de l'amateur au spécialiste, à un grand nombre de ressources en histoire de l'art'''. Cette diffusion des connaissances passe à la fois par la '''Bibliothèque de l'INHA''' qui dispose d'un des plus grands fonds d’histoire de l’art au monde, et par la mise à disposition de nombreuses ressources documentaires (bases de données, répertoires...), souvent numériques, produites grâce aux travaux de recherche menés par les équipes de l'INHA et ses partenaires. De nombreuses '''manifestations et rencontres''', de formes variées, organisées ou co-organisées par l'établissement, donnent la parole aux chercheurs, leur permettant de valoriser les travaux de la communauté scientifique et de transmettre leurs connaissances.
En 2023, l'INHA a mis en place une [https://www.inha.fr/_plugins/flipbook/inha/_resource-flipbook/INHA/2023_INHA_Charte_science.pdf/book.html charte pour la science ouverte]. +
L’Inventaire National du Patrimoine Naturel, INPN, est un programme d’inventaire pour '''gérer et diffuser des informations de référence''' sur les '''espèces animales et végétales''' actuelles et anciennes, continentales et marines, les '''habitats naturels''', les '''espaces protégés''' et le '''patrimoine géologique''', en métropole et en outre-mer.
Ses objectifs sont :
*d’assurer le développement d’une '''banque nationale de référence sur la biodiversité française''', permettant la mise en cohérence de données d’origines diverses
*de diffuser les données des programmes nationaux de différents types :
** '''espace''' : ZNIEFF, Natura 2000, espaces protégés, inventaire national du patrimoine géologique
**'''répartition''' : inventaires nationaux, inventaires par unité départementale, état de conservation, programmes d’inventaire et de sciences participatives, collections…
**'''statut d’espèce''' : taxonomie, protection et réglementation, menaces (listes rouges…)
*de fournir une information consolidée sur les sujets liés à la conservation de la biodiversité avec des processus de validation robustes : répartition et bases de connaissance (textes sur les espèces et habitats, iconographie…)
*de permettre l’expertise des lacunes et des besoins en matière d’inventaire et de suivi de la biodiversité notamment pour le compte du Ministère de l’écologie
*de faire des synthèses et des communications sur l’évolution de la biodiversité et de la géodiversité
*contribuer aux rapportages nationaux et internationaux (CDDA, INSPIRE, état de conservation directive Habitats…)
Les informations sont issues de nombreux programmes nationaux et de données fournies par un ensemble de partenaires .
L'UMS PatriNat organise leur synthèse, leur validation au titre de sa mission statutaire et assure leur diffusion notamment à travers le site internet. Cette diffusion est respectueuse des producteurs en assurant une traçabilité complète de l’origine des données.
'''[[OpenObs]]''', outil d'interrogation multicritères, permet la visualisation, l'exploration, la validation et le téléchargement de données d'observation d'espèces de l'INPN.
'''INRAE''', l’institut national de '''recherche''' pour l’'''agriculture''', l’'''alimentation''' et l’'''environnement''', est né le 1er janvier 2020 de la fusion de l’Inra – institut national de la recherche agronomique et Irstea – institut national de recherche en sciences et technologies pour l’environnement et l’agriculture.
INRAE s’engage résolument dans des démarches de science ouverte et participative, porté par la création d’une direction dédiée, en résonance avec les attentes sociétales. La Direction pour la Science Ouverte (DipSO) créée à INRAE a pour objectifs de répondre aux enjeux liées à l’ouverture de la recherche et au développement du numérique.
Mêlant recherche fondamentale et finalisée, tourné vers ses partenaires académiques, socio-économiques et vers les acteurs publics territoriaux, INRAE est le 1er EPST à se doter d’une Direction Générale Déléguée à l’Expertise et à l’Appui aux Politiques publiques.
En octobre 2021, INRAE a adopté [https://www.inrae.fr/sites/default/files/pdf/Politique_INRAE_Science_Ouverte.pdf une politique de science ouverte]. L'Institut a construit un [https://www.inrae.fr/sites/default/files/pdf/Plan%20donnees%20pour%20la%20science.pdf plan « Données pour la science » (2022-2024)] afin de mieux utiliser et partager les données scientifiques.
Au sein de la DipSO, le Pôle Numérique pour la Science propose un [[INRAE_:_Accompagnement_PGD|service d’accompagnement à '''la rédaction de plan de gestion de données''']] (PGD). +
Au sein de la Direction pour la Science Ouverte (DipSO), le Pôle Numérique pour la Science propose un service d’accompagnement à '''la rédaction de plan de gestion de données''' (PGD) destiné aux chercheurs de l'INRAE. +
Le réseau des référents données opérationnels est actuellement composé d'à peu près 250 agents répartis sur les 14 départements de recherche et qui accompagnent ~270 unités. Certaines unités sont en co-tutelle avec d'autres instituts et universités.
Le réseau est animé par le pôle Num4Sci de la DipSO.
Les missions du RDO:
* Développer et mettre en œuvre une culture commune des bonnes pratiques en matière de gestion des données.Votre action portera sur les données produites au sein des unités (données, codes et modèles), mais également celles qui sont nécessaires à nos recherches et qui seraient produites par des tiers.
* Apporter aux scientifiques des éléments de réponse concrets pour les accompagner tout au long de leurs projets de recherche (réflexion, conseils, appui méthodologique, ressources pédagogiques, etc.). L'action bénéficiera aux collègues tout au long du cycle de vie des données.
Pour exercer ces missions, les référents peuvent s'appuyer sur le réseau ainsi que sur les réseaux métiers concernés en proximité (IST,IPP, CPI, PEPI, CATI...).
Des animations et des formations adéquates seront mises en place par la DipSO à l’intention du réseau des référents données « opérationnels ».
Enfin, le référent sera l’interlocuteur privilégié du référent « stratégique » données nommé à l’échelle du département. Leur périmètre d’action concerne leur collectif .
Pour répondre à ces missions, avec l’appui actif de ses responsables, les actions suivantes seront conduites :
* Sensibiliser le collectif de recherche à l’importance du partage des données pour répondre aux missions de l’Institut, dans le cadre du montage puis de la mise en œuvre de leurs projets et pour la reconnaissance des travaux menés au sein des unités.·
* Sensibiliser le collectif de recherche sur les enjeux (juridique,de valorisation, technique) de la science ouverte et du partage des données.
* Sensibiliser le collectif à l’intérêt de réutiliser les données de recherche produites par des tiers en complément ou à la place de celles qu’elles produisent elles-mêmes.
https://datapartage.inrae.fr par exemple
* Fournir à la communauté de travail une vision globale des données qu’elle produit et utilise, et contribuer par là même à une cartographie des données de recherche pour les départements (cf Référents « stratégiques » données)
* Accompagner le collectif de recherche dans la mise en œuvre des bonnes pratiques, en informant sur les méthodologies utiles, en conseillant les outils pertinents, en s’appuyant notamment sur les ressources mises à disposition par la DipSO.
Le document Gouvernance des données et ses annexes techniques fournissent un cadre de travail et les principaux éléments concrets pour développer ces bonnes pratiques. Celles-ci incluent notamment :
* rédiger un PGD pour chaque projet de recherche et mettre en place des actions pour aboutir à un degré de FAIRisation adapté,
* identifier les données existantes pouvant présenter un intérêt pour les scientifiques du collectif,
* documenter les données (choisir un schéma de métadonnées, trouver et utiliser les bons outils),
* standardiser les données,
* choisir une licence pour publier les données, publier les données,
* indiquer les infrastructures adéquates pour le calcul, le stockage et le partage des données,
* identifier les formations existantes et orienter les scientifiques vers les ressources de formation à disposition (interne INRAE, à l’échelle inter établissement ou à l’international),
* identifier les expériences originales (en matière de gestion, partage et réutilisation des données) de manière à favoriser leur extension, ou les formations qu’il serait utile de développer en complément de celles existantes,
* contribuer activement au réseau des référents données « opérationnels » de manière à capitaliser les expériences respectives et/ou trouver des réponses dans le cas de situations particulières,
* interagir avec les acteurs locaux de la Science Ouverte pour mutualiser et partager les efforts et les compétences locales,
* interagir avec le référent « stratégique » données du département dans le cadre des actions liées à sa mission.·Contribuer aux réflexions, animations ou formations du réseau des référents données« opérationnels », animé par la DipSO.
INRAE Genomics est l''''infrastructure de recherche distribuée en Génomique reconnue par INRAE'''. L'nfrastructure rassemble et mutualise les ressources de 5 plateformes INRAE de génomique :
*'''EPGV''' - Evry (Etude des Polymorphismes des Génomes Végétaux)
*'''GENTYANE''' - Clermont-Ferrand (GENoTYpage et Séquençage en AuvergNE)
*'''GeT''' - Toulouse (Génome et Transcriptome)
*'''PGTB''' - Bordeaux (Plateforme Genome Transcriptome de Bordeaux)
*'''CNRGV''' - Castanet Tolosan (Centre National de Ressources Génomiques Végétales)
L'objectif de cette infrastructure est de fournir à la communauté scientifique publique et privée ainsi qu’aux acteurs socio-économiques, le plus haut niveau d’expertise et de compétences dans la '''production et l’analyse des données de génomique ainsi qu’un accompagnement des projets'''.
Dans les domaines agricole végétal et animal, les secteurs de l’environnement, de l’agro-alimentaire, de la santé, de la pharmacie et des biotechnologies, les plateformes d’INRAE Genomics proposent une offre large dans 5 domaines d’applications complémentaires : séquençage de génomes de novo, étude du polymorphisme génétique, étude de l’expression, étude de la régulation de l’expression, métagénomique. +
[[File:construction_site.png|50px|link=]] Page en construction +
Rattachée à la Direction générale déléguée à la science et à l’innovation, la '''Direction pour la science ouverte DipSO à INRAE''' contribue à l’'''élaboration et à la mise en œuvre de la politique de science ouverte''' de l’institut, à l’ouverture de la recherche et de ses résultats et à l’évolution des e-infrastructures. Elle organise la gouvernance des données, développe une capacité d’appui et d’aide à la décision du management scientifique (notamment via des services de veille et de scientiométrie) et accompagne l’évolution des compétences et des pratiques dont celles de la fonction IST.
Au sein de la DipSO, le Pôle Numérique pour la Science propose un [[INRAE_:_Accompagnement_PGD|service d’accompagnement à la rédaction de plan de gestion de données]] (PGD). +
L’'''Institut de Neurosciences des Systèmes''' ('''INS''') est un Institut de recherche multidisciplinaire composé de chercheurs qui s’intéressent aux dynamiques cérébrales, intégrant des approches expérimentales, théoriques et cliniques afin de comprendre les fonctions et dysfonctions cérébrales.
Équipes de recherche de l’INS :
* DYNAMAP : Groupe de cartographie cérébrale dynamique
* PHYSIONET : Physiologie & physiopathologie du réseau cérébral
* TNG : Neuroscience théorique
* DCP : Dynamique des processus cognitifs. +
L’'''Institut National des Sciences Appliquées Centre Val de Loire''' ('''INSA Centre Val de Loire''') forme '''des paysagistes, des ingénieurs et des docteurs pluridisciplinaires'''.
Les activités de recherche de l’INSA Centre Val de Loire sont structurées autour de 4 enjeux sociétaux :
* Ingénierie pour la santé
* Sécurité et maîtrise du risque
* Données numériques au service de la société
* Optimisation des ressources et des énergies.
L’INSA Centre Val de Loire est un partenaire de l’Atelier de la donnée Centre-Val de Loire (ADCVL). +
L’'''INSA Lyon''', '''Institut National des Sciences Appliquées de Lyon''', est une grande école d’ingénieurs dont les missions sont la formation, la recherche et l’innovation.
L’INSA Lyon a structuré sa recherche sur la base de son implication dans cinq grands enjeux sociétaux :
* Energie pour un Développement Durable ;
* Environnement : Milieux naturels, Industriels et Urbains ;
* Information et Société Numérique ;
* Santé Globale et BioIngénierie ;
* Transport : Structures, Infrastructures et Mobilités.
Dans le cadre de la science ouverte, l’INSA Lyon dispose d’une archive ouverte [https://hal-insa-lyon.archives-ouvertes.fr/ HAL-INSA Lyon]. Les INSA - INSA Centre Val de Loire, INSA Hauts de France, INSA Lyon, INSA Rennes, INSA Rouen Normandie, INSA Strasbourg, INSA Toulouse et le Groupe INSA ont élaboré un [https://www.groupe-insa.fr/guide-de-la-science-ouverte Guide de la science ouverte] et travaillent à la mise en place d’un Plan de Gestion de Données (PGD) pour chaque projet de recherche financé sur fonds publics, en respect des exigences de l’ANR et de la Commission Européenne. +
L’'''INSA Rennes''' est la plus grande école d'ingénieurs en Bretagne proposant huit spécialités d'ingénieurs réparties en deux pôles :
* '''Sciences & Technologies de l'Information & de la Communication (STIC)''';
* '''Matériaux, Structures et Mécanique (MSM)'''.
C'est également un centre de recherche, avec six laboratoires de recherche dont cinq UMR du CNRS, en général associés à d'autres établissements universitaires.
Institut national des sciences appliquées de Rennes. +
L’'''INSA Rouen Normandie, Institut National des Sciences Appliquées de Rouen Normandie''', est une grande école d’ingénieurs dont les missions sont la formation, la recherche et l’innovation.
L'INSA Rouen Normandie dispose de 8 laboratoires de recherche :
*[https://www.insa-rouen.fr/recherche/laboratoires/cobra COBRA] - Chimie Organique et Bioorganique - Réactivité et Analyse ;
*[https://www.insa-rouen.fr/coria CORIA] - COmplexe de Recherche Interprofessionnel en Aérothermochimie ;
*[https://www.insa-rouen.fr/gpm GPM] - Groupe de Physique des Matériaux ;
*[https://www.insa-rouen.fr/recherche/laboratoires/litis LITIS] - Laboratoire d'Informatique, de Traitement de l'Information et des Systèmes ;
*[https://www.insa-rouen.fr/recherche/laboratoires/lmi LMI] - Laboratoire de Mathématiques de l'INSA ;
*[https://www.insa-rouen.fr/recherche/laboratoires/lmn LMN] - Laboratoire de Mécanique de Normandie ;
*[https://www.insa-rouen.fr/lspc LSPC]- Laboratoire de Sécurité des Procédés Chimiques ;
*[https://www.insa-rouen.fr/pbs PBS] - Polymères Biopolymères Surfaces.
Les INSA - INSA Centre Val de Loire, INSA Hauts de France, INSA Lyon, INSA Rennes, INSA Rouen Normandie, INSA Strasbourg, INSA Toulouse et le Groupe INSA ont élaboré un [https://www.groupe-insa.fr/guide-de-la-science-ouverte Guide de la science ouverte] et travaillent à la mise en place d’un Plan de Gestion de Données (PGD) pour chaque projet de recherche financé sur fonds publics, en respect des exigences de l’ANR et de la Commission Européenne.
INSA Rouen Normandie est un partenaire de l’Atelier de la donnée en Normandie, ADN.
L’INSA Strasbourg, Institut National des Sciences Appliquées de Strasbourg, est une grande école d’ingénieurs et une école d’architecture. L’une de ses missions concerne la recherche fondamentale et appliquée afin d’apporter des solutions aux préoccupations sociétales que sont la santé, l’énergie et l’environnement, l’efficacité des bâtiments, l’inventivité dans les systèmes organisationnels ou de production.
L’activité de recherche est structurée en trois unités :
* Le laboratoire [http://icube.unistra.fr/ ICube], le Laboratoire des Sciences de l’Ingénieur, de l’Imagerie et de l’Informatique ;
* L’équipe [http://www.insa-strasbourg.fr/fr/amup/ AMUP], Architecture, morphologie/morphogenèse urbaine et projet ;
* L’[http://www.insa-strasbourg.fr/fr/institut-charles-sadron/ Institut Charles Sadron], Laboratoire propre du CNRS, Étude des polymères et leurs surfaces.
Au sein de l’INSA Strasbourg, la Direction de la Recherche en partenariat avec le service de la bibliothèque propose un accompagnement de la communauté de la recherche dans les démarches de la science ouverte. L'INSA Strasbourg dispose d’une archive ouverte sur [https://univoak.eu univOAK] (Open Access to Knowledge), la plateforme d'archives institutionnelles des établissements alsaciens d'enseignement supérieur et de recherche, ainsi qu’un portail [https://hal.archives-ouvertes.fr/INSA-STRASBOURG HAL INSA STRASBOURG].
Les INSA - INSA Centre Val de Loire, INSA Hauts de France, INSA Lyon, INSA Rennes, INSA Rouen Normandie, INSA Strasbourg, INSA Toulouse et le Groupe INSA ont élaboré un [https://www.groupe-insa.fr/guide-de-la-science-ouverte Guide de la science ouverte] et travaillent à la mise en place d’un Plan de Gestion de Données (PGD) pour chaque projet de recherche financé sur fonds publics, en respect des exigences de l’ANR et de la Commission Européenne.
INSA Strasbourg est un partenaire de l’Atelier de la donnée ADELE, Atelier DonnéE aLsacE Helpdesk.
L’'''Institut National des Sciences Appliquées Toulouse (INSA Toulouse)''' est un établissement public à caractère scientifique, culturel et professionnel rattaché au Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche.
Il organise son activité de formation et de recherche autour de '''8 départements de spécialité, des centres, 8 laboratoires de recherche, des services supports et de soutien à la formation et à la recherche''' (bibliothèque, service des relations internationales…).
La stratégie recherche de l’INSA Toulouse en '''5 enjeux''' vise à répondre aux grands défis scientifiques, environnementaux et sociétaux :
* Systèmes et données numériques au service de la société
* Environnement, milieux naturels, industriels & urbains
* Santé globale & bio-ingénierie
* Transport : structures, infrastructures et mobilités
* Énergie pour un développement durable
L'INSA Toulouse participe à l''''atelier de la donnée ADOO'''. +
'''L'INSEAD''' est une '''école privée internationale de management''' qui dispose de 4 campus se situant à Singapour, à Abou Dabi, à San Francisco et à Fontainebleau.
Elle dote sa communauté internationale des '''outils, des compétences et des connaissances de pointe'''. +
'''L'INSEI''', (Institut National Supérieur de formation et de recherche pour l’Éducation Inclusive), est un établissement public national de formation et de recherche dédié aux besoins éducatifs particuliers et à l’inclusivité. Il apporte son concours à la '''définition et à la mise en œuvre des politiques relatives à l’éducation inclusive, au handicap et l’accessibilité'''.
Ses missions s’organisent autour de trois pôles :
* '''Proposer des formations''' à tous les acteurs de l’éducation inclusive
* '''Développer un pôle ressources de référence'''
* '''Exercer une recherche interdisciplinaire'''. Le laboratoire de recherche Grhapes de l’INSEI a pour vocation d’engager l’Institut dans la recherche de pointe dans le domaine de la scolarisation, l’éducation et la formation des publics à besoins éducatifs particuliers (BEP). +
'''INSPIRE-HEP est une plateforme d'information pour la communauté de la physique des hautes énergies''', sur laquelle les chercheurs déposent et recherchent des informations scientifiques de qualité en physique des hautes énergies. La plateforme est le fruit d'une collaboration entre le CERN, DESY, le Fermilab, l'IHEP, CNRS Nucléaire & Particules et le SLAC. Le développement logiciel pour la nouvelle plateforme a été réalisé au CERN. Tous les partenaires contribuent, de façon coordonnée, au traitement des métadonnées et au fonctionnement journalier.
Plateforme d’accès à l’information scientifique en Physique des Hautes particules INSPIRE comprend 8 bases de données interconnectées sur la littérature scientifique (articles, preprints, etc.), les conférences, les institutions, les revues, les chercheurs, les expériences, les emplois et les données. INSPIRE s’appuie sur une interaction très étroite avec arXiv, ADS, HEPData, ORCID, Particle Data Group (PDG).
Depuis 2017, les laboratoires de l’IN2P3 centralisent le recensement et le catalogage de leur production scientifique dans la base de données INSPIRE-HEP du CERN. De cette manière, la valorisation des publications est optimisée par les documentalistes de l’Institut. Après validation, ces données sont transférées automatiquement dans l’archive ouverte HAL. +
INSTRUCT ERIC est une infrastructure de recherche paneuropéenne en biologie structurale, qui met les technologies et les méthodes de pointe à la disposition de tous les chercheurs européens. +