CATdb

CATdb

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Type de service	Entrepôt de données
	Caractéristiques de l'entrepôt Type d’entrepôt Type de restriction Hébergement des données Identifiant pérenne Type d'identifiant fourni Type d'identifiant auteur utilisé Formats de fichiers acceptés Schéma de métadonnées Licence des jeux de données Conditions d'accès aux données Modération / Curation Volumétrie maximale définie Politique de conservation des données Interopérabilité machine Versioning
Statut	En production
Autres noms	Complete Arabidopsis Trancriptome database
URL	http://tools.ips2.u-psud.fr/CATdb, http://tools.ips2.u-psud.fr/GEM2NET/
Contact	gnet.db@ips2.upsaclay.fr
Localisation	Gif-sur-Yvette
Structure d'appartenance	IPS2
Tutelles	CNRS, INRAE

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Documentation

Conservation

Exposition

Réutilisation

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CATdb met à disposition les analyses de transcriptome réalisées par la plateforme POPS de l’IPS2 (cf. SPOMICS), depuis les plans expérimentaux jusqu’aux analyses différentielles en passant par les descriptions complètes des échantillons et leurs traitements, pour plusieurs espèces végétales. Le module GEM2Net donne accès aux méta-analyses du transcriptome d’Arabidopsis thaliana sous conditions de stress variées.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes Thématique et/ou mots clés :

Type de données :Données et Analyses transcriptomiques

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation : http://tools.ips2.u-psud.fr/CATdb/terms/ten/

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IPS2	CATdb

code unique assigné à un objet de façon permanente (DOI, Handle…).

Ensemble structuré d’informations décrivant, expliquant et localisant une ressource physique ou numérique

autorisation par laquelle l'auteur d’une œuvre de l’esprit concède certains des droits que lui offre le droit d'auteur quant à l'utilisation, à la modification, à la rediffusion et à la réutilisation de l'œuvre.

la curation de données consiste à trier, organiser et mettre en forme un ensemble de données, de manière à le rendre exploitable.

capable de communiquer et d’opérer avec d’autres systèmes d’information.

Centre National de la Recherche Scientifique