« USCBF-CN » : différence entre les versions
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|Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé | |Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé | ||
|SousDisciplineSciences&Technologies=Chimie de synthèse et matériaux | |SousDisciplineSciences&Technologies=Chimie de synthèse et matériaux | ||
|SousDisciplineVie&Sante=Biologie moléculaire | |SousDisciplineVie&Sante=Biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale et biophysique moléculaire | ||
|Thematique=Chimiothèque académique, Collections de produits de synthèse, Collections de composés naturels, Collections d’extraits naturels, Chimio-informatique, Logiciel MDL Isis/Base, Format SDF, Standard database format, Criblage biologique, Criblage haut débit, Relation structure activité, Visualisation structures chimiques | |Thematique=Chimiothèque académique, Collections de produits de synthèse, Collections de composés naturels, Collections d’extraits naturels, Chimio-informatique, Logiciel MDL Isis/Base, Format SDF, Standard database format, Criblage biologique, Criblage haut débit, Relation structure activité, Visualisation structures chimiques | ||
|TypeDonnee=Bases de données chimiques, Base de données structurales | |TypeDonnee=Bases de données chimiques, Base de données structurales |
Version du 6 septembre 2019 à 08:13
Type de service | Plateforme d'accès |
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Statut | En production |
Autres noms | Unité de Gestion de la Chimiothèque Nationale, UGCN, UPS 3035 |
URL | http://ugcn.cn.cnrs.fr/ups3035/ |
Contact | philippe.jauffret@enscm.fr |
Localisation | Montpellier |
Structure d'appartenance | Chimiothèque Nationale |
Tutelles | |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
L’UGCN est chargée des aspects opérationnels de la Chimiothèque Nationale : l’aide au développement des chimiothèques et extractothèques, l’administration du système d'information, la communication et l’aide à la mise en place des collaborations scientifiques à l'interface chimie-biologie. Les missions de l’UGCN sont de :
- Définir les normes de conditionnement des substances et de représentation de l'information chimique des collections (structures, nomenclatures, propriétés, codages des molécules, logiciel MDL Isis/Base, format SDF, format standard compatible avec le criblage à haut débit, livre blanc du chimiothécaire); -
- Constituer et administrer une base de données regroupant des collections de produits chimiques de synthèse et de substances naturelles mises à disposition par les laboratoires publics français (70.000 composés et 15.000 extraits naturels, pour la plupart originaux et peu testés);
- Enrichir cette base de données par de nouveaux descripteurs chimio-informatiques et des données d’activités biologiques mises à disposition par les laboratoires partenaires;
- Faciliter la mise en place de collaborations scientifiques entre les laboratoires dépositaires des substances et des laboratoires publics ou privés de recherche en biologie : procédures simples, peu onéreuses et protégées juridiquement par un accord de transfert de matériel (MTA Material tranfer agreement, définit les termes de la collaboration scientifique entre chimiste et biologiste);
- Promouvoir le criblage de la chimiothèque sur des cibles biologiques diversifiées afin d’offrir des services adaptés aux besoins des biologistes : Criblage total de la Chimiothèque Nationale, Criblage de la «Chimiothèque Essentielle » (sélection de 1040 composés « les plus divers »), Criblage de Chimiothèques « ciblées » sur des familles pour des tests biologiques particuliers, Criblage de Chimiothèque personnalisée (sélection de composés par l’utilisateur). Les résultats d’un criblage sont archivés à l’UGCN et renvoyés vers les équipes de la chimiothèque, chacun pour ses produits;
- Former les nouveaux chimiothécaires à la création et l'administration de bases de données chimiques de leurs laboratoires.
Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé
Chimie de synthèse et matériaux
Biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale et biophysique moléculaire
Thématique et/ou mots clés :
- Chimiothèque académique
- Collections de produits de synthèse
- Collections de composés naturels
- Collections d’extraits naturels
- Chimio-informatique
- Logiciel MDL Isis/Base
- Format SDF
- Standard database format
- Criblage biologique
- Criblage haut débit
- Relation structure activité
- Visualisation structures chimiques
Type de données :Bases de données chimiques, Base de données structurales
Communauté d'utilisateurs : Chimistes des laboratoires publics qui sont membres du GIS Chimiothèque Nationale, Biologistes des laboratoires publics et privés Usagers et bénéficiaires :Chercheurs
Conditions d'usage : L'utilisateur s'enregistre en remplissant un formulaire, sélectionne des molécules et présente un projet. L'UGCN établit un accord de transfert de matériel (MTA , Material tranfer agreement) dans le cadre d"une collaboration scientifique.
Conditions tarifaires : Gratuit pour l'accès aux bases de données (nécessite un enregistrement préalable). Payant pour l'acquisition des produits issus des collections de la Chimiothèque Nationale (participation aux frais de conditionnement, de gestion de dossier et d’expédition)
Certification/Label :http://ugcn.cn.cnrs.fr/ups3035/certificat_ISO9001-_2018-2021.pdf (?)
Conditions générales d'utilisation :
Structure | Services proposés |
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ChemBioFrance | Chimiothèque Nationale USCBF-CN ADME-Tox Criblage Chémoinformatique |
Chimiothèque Nationale | USCBF-CN |