« MassBank » : différence entre les versions

MassBank
Type de service	Entrepôt de données
Caractéristiques de l'entrepôt
Type d’entrepôt	Disciplinaire
Type de restriction	Soumis à la création d'un compte
Hébergement des données	UE
Identifiant pérenne	✓
Identifiants fournis	DOI (via Zenodo)
Identifiants utilisés
Formats de fichiers acceptés	Format d'enregistrement MassBank
Schéma de métadonnées
Licence des jeux de données	Creative Commons, Copyrights
Conditions d'accès aux données	Ouvert
Modération / Curation	Un modération automatique est effectuée. En effet, un format spécifique est imposé pour le dépôt. La cohérence sémantique et des métadonnées est ensuite vérifiée à la soumission par un logiciel de validation.
Volumétrie maximale définie
Politique de conservation des données	MassBank Europe existe depuis 2011. Le soutien de NFDI4CHEM assure une pérennité pour au moins 5 ans.
Interopérabilité machine	API REST
Versioning	✓
Statut	En production
Autres noms
URL	https://massbank.eu/MassBank/
Contact	massbank@massbank.eu
Localisation	Leipzig (Allemagne)
Structure d'appartenance	MassBank Consortium
Tutelles
Identifiants
re3data	10.17616/R3K05Z
Identifiant dans un autre catalogue	https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.dk451a (FAIRsharing)

Version du 10 juillet 2024 à 10:09

MassBank est une bibliothèque de spectres de masse à source ouverte pour l'identification de petites molécules chimiques relevant de la métabolomique, de l'exposomique et de l'environnement.

La grande majorité du contenu de MassBank comprend aujourd'hui des données de spectrométrie de masse à haute résolution, bien que tous les types de données de spectres de masse soient acceptés.

Une série d'options de recherche sont disponibles pour parcourir les données. La bibliothèque MassBank est basée sur des enregistrements de fichiers texte contenant les métadonnées de l'enregistrement et les informations spectrales de masse dans le format d'enregistrement MassBank.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies

PE5 Chimie de synthèse et matériaux

Thématique et/ou mots clés :

Chimie environnementale

Type de données :Données de spectrométrie de masse à haute résolution, Molécules d'intérêt environnemental, en métabolomique et en exposomique

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants

Conditions d'usage : Toutes les données sont archivées sur GitHub et Zenodo. Le code est également sur GitHub : https://github.com/MassBank. La bibliothèque MassBank peut être téléchargée sous différents formats tels que des enregistrements textuels, des fichiers de base de données (sql) et des fichiers MSP.

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
MassBank Consortium	MassBank

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 {{Infobox Service
+|Logo=Logo MassBank.png
 |NomService=MassBank
 |TypeService=Entrepôt de données
+|TypeEntrepot=Disciplinaire
+|TypeRestriction=Soumis à la création d'un compte
+|HebergementDonnees=UE
+|AttributionIdentifiant=Oui
+|TypeIdentifiantAttribue=DOI (via Zenodo)
+|FormatsFichiers=Format d'enregistrement MassBank
 |Licences=Creative Commons, Copyrights
 |ConditionAccesDonnees=Ouvert
+|Curation=Un modération automatique est effectuée. En effet, un format spécifique est imposé pour le dépôt. La cohérence sémantique et des métadonnées est ensuite vérifiée à la soumission par un logiciel de validation.
+|ConservationDonnees=MassBank Europe existe depuis 2011. Le soutien de NFDI4CHEM assure une pérennité pour au moins 5 ans.
 |Interoperabilite=API REST
 |Versioning=Oui
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 |UrlService=https://massbank.eu/MassBank/
 |ContactMel=massbank@massbank.eu
+|Localisation=Leipzig (Allemagne)
 |StructureAppartenance=MassBank Consortium
 |IDre3data=10.17616/R3K05Z
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 |PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation
 |International=Oui
+}}
+{{Coordonnées GPS
+|CoordonneeGeographique=51.35248, 12.43451
 }}
 {{Service
+|Description='''MassBank''' est une '''bibliothèque de spectres de masse à source ouverte pour l'identification de petites molécules chimiques relevant de la métabolomique, de l'exposomique et de l'environnement'''.
+La grande majorité du contenu de MassBank comprend aujourd'hui des données de spectrométrie de masse à haute résolution, bien que tous les types de données de spectres de masse soient acceptés.
+Une série d'options de recherche sont disponibles pour parcourir les données. La bibliothèque MassBank est basée sur des enregistrements de fichiers texte contenant les métadonnées de l'enregistrement et les informations spectrales de masse dans le format d'enregistrement MassBank.
 |Discipline=Sciences & Technologies
 |SousDisciplineSciences&Technologies=PE5 Chimie de synthèse et matériaux
 |Thematique=Chimie environnementale
-|TypeDonnee=Spectres de masse, entre autres à haute résolution, Molécules d'intérêt environnemental, en métabolomique et en exposomique
+|TypeDonnee=Données de spectrométrie de masse à haute résolution, Molécules d'intérêt environnemental, en métabolomique et en exposomique
+|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants
+|ConditionUsage=Toutes les données sont archivées sur GitHub et Zenodo. Le code est également sur GitHub : https://github.com/MassBank. La bibliothèque MassBank peut être téléchargée sous différents formats tels que des enregistrements textuels, des fichiers de base de données (sql) et des fichiers MSP.
 }}