« BiP » : différence entre les versions
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(Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=BiP-logo2.png |NomService=BiP |TypeService=Plateforme de calcul |StatutService=En production |NomDéveloppé=Bioinformatics Platform |UrlService=https://www.ibmp.cnrs.fr/plateformes/bioinformatique/ |ContactMel=Valerie.cognat@ibmp.unistra.fr |Localisation=Strasbourg |StructureAppartenance=IBMP |Tutelle=CNRS, Université de Strasbourg |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse |International=Non }} {{Service |Description=La plateforme de bioinformati... ») |
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La plateforme possède des compétences en analyses de données NGS, plus particulièrement Illumina et Nanopore. Elles couvrent différentes thématiques, entre autres : | La plateforme possède des compétences en analyses de données NGS, plus particulièrement Illumina et Nanopore. Elles couvrent différentes thématiques, entre autres : | ||
– l’assemblage de génomes | – l’assemblage de génomes<br> | ||
– la détection de variants | – la détection de variants<br> | ||
– l’étude du transcriptome (RNA-seq et smallRNA-seq) | – l’étude du transcriptome (RNA-seq et smallRNA-seq)<br> | ||
– la métagénomique 16S | – la métagénomique 16S<br> | ||
– les interactions protéines/adn-arn (ChIP-seq, ….) | – les interactions protéines/adn-arn (ChIP-seq, ….)<br> | ||
– la méthylation | – la méthylation<br> | ||
La plateforme travaille en synergie avec la plateforme AEG pour une prise globale des projets de la définition du plan expérimental à l’exploitation des résultats. | |||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|TypeDonnee=Données biologiques | |TypeDonnee=Données biologiques<br> | ||
Données de séquençage haut débit | Données de séquençage haut débit | ||
|ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte. | |ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte. | ||