« DANDI » : différence entre les versions

DANDI
Type de service	Entrepôt de données
Caractéristiques de l'entrepôt
Type d’entrepôt	Disciplinaire
Type de restriction	Soumis à la création d'un compte
Hébergement des données	Hors UE
Identifiant pérenne	✓
Identifiants fournis	DOI, ID Interne
Identifiants utilisés	ORCID
Formats de fichiers acceptés
Schéma de métadonnées	Repository-Developed Metadata Schemas, DataCite Metadata Schema, PROV
Licence des jeux de données	Creative Commons
Conditions d'accès aux données	Ouvert, Embargo
Modération / Curation	La modération est automatique et elle s'effectue à deux niveaux pour les spécifications du format NWB et les métadonnées de base
Volumétrie maximale définie	Il y a une limite de 5TB par fichier.
Politique de conservation des données	Le NIH a financé, pour la période 08/2019-04/2024, à hauteur de 1,3 million de dollars chaque année.
Interopérabilité machine	API REST
Versioning	✓
Statut	En production
Autres noms	The DANDI Archive, Distributed Archives for Neurophysiology Data Integration
URL	https://dandiarchive.org
Contact	info@dandiarchive.org
Localisation	Cambridge (États-Unis)
Structure d'appartenance	CON, McGovern Institute, NIH
Tutelles
Identifiants
re3data	10.17616/R31NJN0M

Dernière version du 23 octobre 2024 à 09:34

L'entrepôt DANDI est :

Une archive de données ouverte pour soumettre des données neurophysiologiques pour l'électrophysiologie, l'optophysiologie et les séries temporelles comportementales, ainsi que des images provenant d'expériences d'immunomarquage. Ces données, même acquises chez l'humain, peuvent être facilement anonymisées et donc partagées.
Une collection pérenne, versionnée et croissante d'ensembles de données normalisées.
Un endroit où héberger les données afin de collaborer.

Il offre :

Une archive de données FAIR pour héberger des données neurophysiologiques normalisées et des données associées.
Des métadonnées riches pour faciliter la recherche dans les données.
Des normes de données cohérentes et transparentes pour simplifier la réutilisation des données et le développement de logiciels.
Les données sont accessibles par API, ce qui permet aux logiciels de travailler directement avec les données dans le cloud.

L'infrastructure est construite sur une pile logicielle de produits open source.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative; LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux Thématique et/ou mots clés :

Neurophysiologie cellulaire
Optophysiologie
Electrophysiologie

Type de données :Données neurophysiologiques, Images d'immunomarquage

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique internationale en neurobiologie. C'est un entrepôt de référence pour la communauté en éléctrophysiologie Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants

Conditions d'usage : Le projet DANDI est organisé autour de plusieurs dépôts GitHub : https://github.com/dandi/dandi-archive

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :CoSO (https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiance-pour-le-depot-de-donnees-methodologie-et-analyse-de-loffre-existante/)

Conditions générales d'utilisation : https://www.dandiarchive.org/handbook/about/terms/

Portée internationale de DANDI

Brain Initiative (https://braininitiative.nih.gov/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
CON	DANDI
McGovern Institute	DANDI
NIH	NeMO Archive DANDI

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 {{Infobox Service
-|Logo=DANDI-logo.png
+|Logo=Dandi-banner.png
 |NomService=DANDI
 |TypeService=Entrepôt de données
@@ Ligne 7 : / Ligne 7 : @@
 |HebergementDonnees=Hors UE
 |AttributionIdentifiant=Oui
-|TypeIdentifiantAttribue=DOI
+|TypeIdentifiantAttribue=DOI, ID Interne
 |TypeIdentifiantUtilise=ORCID
 |SchemaMetadonnees=Repository-Developed Metadata Schemas, DataCite Metadata Schema, PROV
 |Licences=Creative Commons
 |ConditionAccesDonnees=Ouvert, Embargo
+|Curation=La modération est automatique et elle s'effectue à deux niveaux pour les spécifications du format NWB et les métadonnées de base
+|Volumetrie=Il y a une limite de 5TB par fichier.
+|ConservationDonnees=Le NIH a financé, pour la période 08/2019-04/2024, à hauteur de 1,3 million de dollars chaque année.
 |Interoperabilite=API REST
 |Versioning=Oui
@@ Ligne 18 : / Ligne 21 : @@
 |UrlService=https://dandiarchive.org
 |ContactMel=info@dandiarchive.org
-|StructureAppartenance=NIH
+|Localisation=Cambridge (États-Unis)
+|StructureAppartenance=CON, McGovern Institute, NIH
 |IDre3data=10.17616/R31NJN0M
-|PhaseCycleVie=Analyse, Conservation, Exposition, Réutilisation
+|PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation
+|International=Oui
 }}
 {{Service
-|Description=L'entrepôt DANDI est une archive de données ouverte pour soumettre des données neurophysiologiques pour l'électrophysiologie, l'optophysiologie et les séries temporelles comportementales, ainsi que des images provenant d'expériences d'immunomarquage.
+|Description=L''''entrepôt DANDI''' est :
-Une collection persistante, versionnée et croissante d'ensembles de données normalisées.
+* Une '''archive de données ouverte pour soumettre des données neurophysiologiques''' pour l'électrophysiologie, l'optophysiologie et les séries temporelles comportementales, ainsi que des images provenant d'expériences d'immunomarquage. Ces données, même acquises chez l'humain, peuvent être facilement anonymisées et donc partagées.
-Un endroit où héberger les données pour collaborer entre les sites de recherche.
+* Une '''collection pérenne, versionnée et croissante d'ensembles de données normalisées'''.
-Soutenu par les programmes BRAIN Initiative et AWS Public dataset.
+* Un endroit où héberger les données afin de collaborer.
+Il offre :
-La plateforme DANDI est soutenue par la BRAIN Initiative pour la publication, le partage et le traitement des données neurophysiologiques. Les archives acceptent les données de neurophysiologie cellulaire, y compris les séries chronologiques d'électrophysiologie, d'optophysiologie et de comportement, ainsi que les images provenant d'expériences d'immunomarquage. La plateforme est désormais disponible pour le téléchargement et la distribution des données. Le stockage des données dans les archives est également pris en charge par le programme Amazon Opendata.
+* Une '''archive de données FAIR''' pour héberger des données neurophysiologiques normalisées et des données associées.
+* Des '''métadonnées riches''' pour faciliter la recherche dans les données.
-Traduit avec DeepL.com (version gratuite)
+* Des normes de données cohérentes et transparentes pour simplifier la réutilisation des données et le développement de logiciels.
+* Les données sont accessibles par API, ce qui permet aux logiciels de travailler directement avec les données dans le cloud.
+L'infrastructure est construite sur une '''pile logicielle de produits open source'''.
 |Discipline=Vie & Santé
 |SousDisciplineVie&Sante=LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative; LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux
-|Thematique=Neurophysiologie cellulaire
+|Thematique=Neurophysiologie cellulaire, Optophysiologie, Electrophysiologie
+|TypeDonnee=Données neurophysiologiques, Images d'immunomarquage
+|Communaute=Communauté scientifique internationale en neurobiologie. C'est un entrepôt de référence pour la communauté en éléctrophysiologie
+|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants
+|ConditionUsage=Le projet DANDI est organisé autour de plusieurs dépôts GitHub : https://github.com/dandi/dandi-archive
 |ModeleEconomique=Gratuit
+|Certification=CoSO;https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiance-pour-le-depot-de-donnees-methodologie-et-analyse-de-loffre-existante/
 |Cgu=https://www.dandiarchive.org/handbook/about/terms/
+|PorteeInternationale=Brain Initiative; https://braininitiative.nih.gov/
 }}