« ANISEED » : différence entre les versions

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|Description=La '''base de données internationale ANISEED, Ascidian Network for In Situ Expression and Embrylogical Data''', permet une représentation du développement embryonnaire de l'ascidie au niveau du génome (séquences cis-regulatrices, expressions géniques, annotations de protéines), de la cellule (morphologie, destin, induction, lignée) ou de l’embryon complet (anatomie, morphogenèse).
|Description=La '''base de données internationale ANISEED, Ascidian Network for In Situ Expression and Embrylogical Data''', permet une représentation du développement embryonnaire de l'ascidie au niveau du génome (séquences cis-regulatrices, expressions géniques, annotations de protéines), de la cellule (morphologie, destin, induction, lignée) ou de l’embryon complet (anatomie, morphogenèse).


Le contenu de la base de données peut être exploré par l'intermédiaire d'un navigateur web classique. La plateforme Web associée www.aniseed.cnrs.fr permet d'afficher les données dans leur contexte génomique, un  module permet de manipuler des représentations tridimensionnelles de l’embryon et de décrire quantitativement les formes et l’organisation des cellules. Ce module permet aussi de combiner les informations moléculaires et embryologiques contenues dans la base à l’embryon virtuel.
Le contenu de la base de données peut être exploré par l'intermédiaire d'un navigateur web classique. La plateforme Web associée https://aniseed.fr/ permet d'afficher les données dans leur contexte génomique, un  module permet de manipuler des représentations tridimensionnelles de l’embryon et de décrire quantitativement les formes et l’organisation des cellules. Ce module permet aussi de combiner les informations moléculaires et embryologiques contenues dans la base à l’embryon virtuel.
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|Discipline=Vie & Santé
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|Thematique=Ascidies, Base de données
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|ConditionUsage=License : GNU General Public License. Base de données en accès libre avec login/mot de passe.  
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Pour soumettre des données : https://www.aniseed.cnrs.fr/aniseed/default/submit_data
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[[Catégorie:Annuaire CNRS]] [[Catégorie:Annuaire CNRS-INSB]]
[[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]]

Dernière version du 26 novembre 2024 à 14:20

  ANISEED
Type de service Entrepôt de données
Caractéristiques de l'entrepôt
Type d’entrepôt Disciplinaire
Type de restriction Soumis à la création d'un compte
Hébergement des données France
Identifiant pérenne
Identifiants fournis Identifiant interne
Identifiants utilisés
Formats de fichiers acceptés Excel
Schéma de métadonnées
Licence des jeux de données
Conditions d'accès aux données Ouvert
Modération / Curation
Volumétrie maximale définie
Politique de conservation des données
Interopérabilité machine API REST
Versioning
Statut En production
Autres noms Ascidian Network for InSitu Expression and Embryological Data
URL https://aniseed.fr/
Contact aniseedteam@aniseed.fr
Localisation Montpellier
Structure d'appartenance CRBM
Tutelles CNRS
Identifiant dans un autre catalogue https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.xp1x9c (FAIRsharing)


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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La base de données internationale ANISEED, Ascidian Network for In Situ Expression and Embrylogical Data, permet une représentation du développement embryonnaire de l'ascidie au niveau du génome (séquences cis-regulatrices, expressions géniques, annotations de protéines), de la cellule (morphologie, destin, induction, lignée) ou de l’embryon complet (anatomie, morphogenèse). Le contenu de la base de données peut être exploré par l'intermédiaire d'un navigateur web classique. La plateforme Web associée https://aniseed.fr/ permet d'afficher les données dans leur contexte génomique, un module permet de manipuler des représentations tridimensionnelles de l’embryon et de décrire quantitativement les formes et l’organisation des cellules. Ce module permet aussi de combiner les informations moléculaires et embryologiques contenues dans la base à l’embryon virtuel.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération Thématique et/ou mots clés :

  • Ascidies
  • Base de données

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignant-Chercheurs, Doctorants


Conditions d'usage : License : GNU General Public License. Base de données en accès libre avec login/mot de passe.

Pour soumettre des données : https://www.aniseed.fr/aniseed/default/submit_data

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :ELIXIR Data Resources (https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources)

Conditions générales d'utilisation : https://www.aniseed.fr/aniseed/default/termOfUse

ANISEED est en lien avec les services et structures

IFB

Portée internationale de ANISEED

ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/)


Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
CRBMANISEED