« MDverse » : différence entre les versions

MDverse
Type de service	Plateforme d'accès
Statut	En cours d'élaboration
Nom développé	Recycling molecular dynamics data
URL	https://mdverse.streamlit.app, https://mdverse.github.io/
Contact	pierre.poulain@u-paris.fr, Matthieu.Chavent@ipbs.fr
Localisation	Paris
Structure d'appartenance	IPBS, IJM
Tutelles	CNRS, Université Paris Cité

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Dernière version du 31 mars 2026 à 14:28

MDverse a pour objectifs de :

Cataloguer les données issues de simulations de dynamique moléculaire disponibles dans différents entrepôts de données ouvertes
Améliorer les métadonnées existantes pour rendre ces données plus facilement trouvables et réutilisables par la communauté scientifique

MDVerse permet de mettre en avant des données ouvertes en enrichissant leur description et leurs métadonnées via la mise à disposition d’un métamoteur facilitant la découverte de ces données et d’un indicateur de potentiel de réutilisation défini par des experts du domaine.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions Thématique et/ou mots clés :

Dynamique moléculaire

Type de données :Données de simulation

Périmètre de communauté : ESR, thématique, national, international

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique en biologie moléculaire

Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Biologistes

Conditions d'usage : Les données sont conservées dans l'entrepôt Zenodo. Le code est, quant à lui, open-source, librement disponible sur GitHub (https://github.com/MDverse/mdde) et archivé dans Software Heritage. Toutes les données sont partagées sous forme de fichiers Parquet sous licence Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0).

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IJM	MDverse
IPBS	MDverse

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 |StatutService=En cours d'élaboration
 |NomDéveloppé=Recycling molecular dynamics data
-|NomAlternatif=Recycling molecular dynamics data
 |UrlService=https://mdverse.streamlit.app, https://mdverse.github.io/
 |ContactMel=pierre.poulain@u-paris.fr, Matthieu.Chavent@ipbs.fr
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 |PhaseCycleVie=Documentation, Exposition, Réutilisation
 |International=Non
+|NomAlternatif=Recycling molecular dynamics data
 }}
 {{Service
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 |Thematique=Dynamique moléculaire
 |TypeDonnee=Données de simulation
+|PerimetreCommunaute=ESR, thématique, national, international
 |Communaute=Communauté scientifique en biologie moléculaire
 |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Biologistes