Aller au contenu

« MGX » : différence entre les versions

2 224 octets ajoutés ,  20 juin
aucun résumé des modifications
Aucun résumé des modifications
Aucun résumé des modifications
 
(12 versions intermédiaires par un autre utilisateur non affichées)
Ligne 2 : Ligne 2 :
|Logo=Logo MGX 2017 final-02.png
|Logo=Logo MGX 2017 final-02.png
|NomService=MGX
|NomService=MGX
|TypeService=Plateforme de calcul
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|StatutService=En production
|StatutService=En production
|NomAlternatif=Montpellier GenomiX
|NomDéveloppé=Montpellier GenomiX
|UrlService=https://www.mgx.cnrs.fr
|UrlService=https://www.mgx.cnrs.fr
|ContactMel=mgx@mgx.cnrs.fr
|ContactMel=mgx@mgx.cnrs.fr
|Localisation=Montpellier
|Localisation=Montpellier
|StructureAppartenance=IGF, France Génomique
|StructureAppartenance=IGF, France Génomique, IRMB, ISEM, AGAP, OREME
|Tutelle=Inserm, Université de Montpellier
|Tutelle=Inserm, Université de Montpellier
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse, Documentation
|International=Non
|International=Non
|NomAlternatif=Montpellier GenomiX
}}
}}
{{Coordonnées GPS
{{Coordonnées GPS
|CoordonneeGeographique=43.63516, 3.84557
|CoordonneeGeographique=43.63516, 3.84557
}}
{{Coordonnées GPS
|CoordonneeGeographique=43.62877, 3.86592
}}
{{Coordonnées GPS
|CoordonneeGeographique=43.63132, 3.86072
}}
{{Coordonnées GPS
|CoordonneeGeographique=43.68422, 3.87808
}}
}}
{{Service
{{Service
|Description=MGX-Montpellier GenomiX résulte de la mise en réseau des 4 plateaux de génomique de Montpellier :
|Description='''MGX-Montpellier GenomiX''' propose les services suivants :
 
* '''Séquençage haut débit (NGS)'''
* '''Bio-statistiques et bio-informatique'''
 
Les applications incluent notamment '''le séquençage de novo ou le re-séquençage de génomes, l’étude du transcriptome''' de nombreuses espèces animales, végétales et procaryotes, mais également les techniques d’'''étude de la structure et de la dynamique chromatinienne (ChIP-seq, 4C, Hi-C…) et des modifications épigénétiques''' (méthylation de l’ADN). Il développe des approches de génomique sur cellules uniques.


* Plateau MGX-NGS(IGF) : Séquençage très haut débit, biostatistiques et bioinformatique
Elle offre également un '''service complet pour l’analyse des données issues du séquençage nouvelle génération'''. Elle peut réaliser la contextualisation fonctionnelle des données.
* MGX-Transcriptome (IRMB) : Puces à ADN Affymetrix
* MGX-qPCR HD (DBS-B3ESTE) : PCR quantitative haut débit
* MGX-Génotypage (AGAP-ISEM) : Génotypage


MGX offre un interlocuteur unique pour les utilisateurs des plateaux de génomique montpelliérains et optimise la répartition du personnel et des moyens financiers.
La plateforme développe également des protocoles à façon pour répondre à des besoins spécifiques et participe à la formation de ses utilisateurs, tant pour la construction des banques que pour l’analyse des données.
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, NGS, Séquençage, Transcriptomique, RNA-Seq, Single cell RNA-Seq, small RNA-Seq, micro-ARN, Chromatine, ChIP-Seq, Epigénétique, Méthylation de l’ADN, Génotypage, Variants, PCR quantitative, PCR digitale, Statistiques
|TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage
|Communaute=Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique.
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins
|ConditionUsage=Après une première prise de contact par téléphone ou par mail à l’adresse mgx@mgx.cnrs.fr, une réunion, en présentiel ou à distance, sera organisée afin que les demandeurs puissent présenter la thématique et les objectifs de votre projet aux personnels de la plateforme. Après validation de la faisabilité technique du projet, une proposition chiffrée sera soumise aux utilisateurs, ainsi qu’une fiche de prestation détaillant les prérequis attendus pour les échantillons. Les expériences seront lancées après réception et vérification des échantillons. Un compte rendu sera remis en fin de projet. Si besoin, la plateforme pourra également déposer les résultats dans des bases de données ad hoc et rédiger la partie Matériels et méthodes en vue d’une publication.
|ModeleEconomique=Après validation de la faisabilité technique du projet, une proposition chiffrée sera soumise aux utilisateurs
|Certification=ISO 9001:2015; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat%20mgx%20fr.pdf,
|Certification=ISO 9001:2015; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat%20mgx%20fr.pdf,
IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/,
IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/,
NFX 50-900:2016; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat-mgx-nfx.pdf
NFX 50-900:2016; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat-mgx-nfx.pdf
}}
}}