« PlantBioInfoPF » : différence entre les versions

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|TypeService=Plateforme de calcul
|TypeService=Plateforme de calcul
|StatutService=En production
|StatutService=En production
|NomDéveloppé=Plant Bioinformatics Facility
|NomAlternatifRéduit=Plateforme de bioinformatique des plantes
|NomAlternatif=Plant Bioinformatics Facility, Plateforme de bioinformatique des plantes
|NomAlternatif=Plant Bioinformatics Facility, Plateforme de bioinformatique des plantes
|UrlService=https://urgi.versailles.inra.fr/Platform/
|UrlService=https://urgi.versailles.inra.fr/Platform/
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|Description=Les activités de la '''plateforme de bioinformatique des plantes''' - '''PlantBioinfoPF''' sont étroitement liées aux systèmes d’information et à l’étude de l’impact des éléments transposables sur l’évolution des génomes. La plateforme propose à l'INRAE et ses partenaires un support à la publication de données de génétique et génomique des plantes et pathogènes végétaux, ainsi que l’intégration de ces données au système d’information [[GnpIS]].
|Description=Les activités de la '''plateforme de bioinformatique des plantes''' - '''PlantBioinfoPF''' sont étroitement liées aux systèmes d’information et à l’étude de l’impact des éléments transposables sur l’évolution des génomes. La plateforme propose à l'INRAE et ses partenaires un support à la publication de données de génétique et génomique des plantes et pathogènes végétaux, ainsi que l’intégration de ces données au système d’information [[GnpIS]].


A l’international, PlantBioinfoPF offre un service de portail de recherche aux fédérations de systèmes d’information comme [[WheatIS]]. En termes d’analyse des génomes, le service d’annotation des gènes et plus particulièrement des éléments transposables, qui s’appuie sur le pipeline REPET, est également ouvert à l’international. L’ensemble de ces activités sont développées par l’Unité de recherche génomique-info ([[URGI]]) à laquelle la plateforme est adossée et s’intègrent dans l’offre de l’Institut français de bioinformatique ([[IFB]]), nœud français de l’infrastructure européenne ELIXIR.
A l’international, PlantBioinfoPF offre un service de portail de recherche aux fédérations de systèmes d’information comme [[WheatIS]]. En termes d’a'''nalyse des génomes, le service d’annotation des gènes et plus particulièrement des éléments transposables''', qui s’appuie sur le pipeline REPET, est également ouvert à l’international. L’ensemble de ces activités sont développées par l’Unité de recherche génomique-info ([[URGI]]) à laquelle la plateforme est adossée et s’intègrent dans l’offre de l’Institut français de bioinformatique ([[IFB]]), nœud français de l’infrastructure européenne ELIXIR.


Expertises et services de la plateforme :
Expertises et services de la plateforme :
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|Beneficiaire=Chercheurs
|Beneficiaire=Chercheurs
|ConditionUsage=Il est possible de solliciter PlantBioinfoPF par mail à l’adresse urgi-contact@inrae.fr. Des formulaires sont mis à disposition sur le site internet de la plateforme pour formaliser les demandes concernant certains services. Les projets sont précisés avec les utilisateurs et arbitrés lors des réunions mensuelles de la plateforme. Les offres de formation de PlantBioinfoPF sont disponibles sur son site internet et diffusées en parallèle par mail sur liste de diffusion.
|ConditionUsage=Il est possible de solliciter PlantBioinfoPF par mail à l’adresse urgi-contact@inrae.fr. Des formulaires sont mis à disposition sur le site internet de la plateforme pour formaliser les demandes concernant certains services. Les projets sont précisés avec les utilisateurs et arbitrés lors des réunions mensuelles de la plateforme. Les offres de formation de PlantBioinfoPF sont disponibles sur son site internet et diffusées en parallèle par mail sur liste de diffusion.
|Certification=INRAE CNOC; https://doi.org/10.15454/1.5572414581735654E12, IBiSA;https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/
|Certification=CNOC INRAE; https://urgi.versailles.inrae.fr/Platform,  
IBiSA;https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/, ISO 9001:2015; https://urgi.versailles.inrae.fr/Quality
|Cgu=https://urgi.versailles.inra.fr/Platform/General-Terms-of-Use/Conditions-Generales-d-Utilisation
|Cgu=https://urgi.versailles.inra.fr/Platform/General-Terms-of-Use/Conditions-Generales-d-Utilisation
|Relation=France Génomique
|Relation=France Génomique
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