« PPanGGOLiN » : différence entre les versions
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|TypeService=Outils de gestion des données | |TypeService=Outils de gestion des données | ||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
|NomDéveloppé=Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors | |||
|NomAlternatif=Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors | |NomAlternatif=Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors | ||
|UrlService=https://ppanggolin.readthedocs.io/en/latest/ | |UrlService=https://ppanggolin.readthedocs.io/en/latest/ | ||
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|Tutelle=CNRS, Université Paris-Saclay, CEA | |Tutelle=CNRS, Université Paris-Saclay, CEA | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation | |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation | ||
|International=Non | |||
}} | }} | ||
{{Coordonnées GPS | {{Coordonnées GPS | ||
|CoordonneeGeographique=48.62399, 2.43972 | |CoordonneeGeographique=48.62399, 2.43972 | ||
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{{Service | {{Service | ||
|Description='''PPanGGOLiN''' est un logiciel de bioinformatique dédié à l'analyse de pangénomes. Il permet de '''créer, manipuler et analyser des pangénomes procaryotes''' en utilisant des dizaines voire des milliers de génomes d'une même espèce. Il permet ainsi d'étudier l'évolution ou l'écologie des microbes, ouvrant la voie à des découvertes importantes pour la santé humaine, l'agriculture, l'alimentation ou l'environnement. | |Description='''PPanGGOLiN''' est un logiciel de bioinformatique dédié à l'analyse de pangénomes developpé par le [https://labgem.genoscope.cns.fr/ LABGeM]. Il permet de '''créer, manipuler et analyser des pangénomes procaryotes''' en utilisant des dizaines voire des milliers de génomes d'une même espèce. Il permet ainsi d'étudier l'évolution ou l'écologie des microbes, ouvrant la voie à des découvertes importantes pour la santé humaine, l'agriculture, l'alimentation ou l'environnement. | ||
Le laboratoire LABGeM a également intégré l'outil dans sa plateforme de service, [[MicroScope]], mis à disposition des microbiologistes et qui comprend plus de 6600 utilisateurs à travers le monde. | Le laboratoire LABGeM a également intégré l'outil dans sa plateforme de service, [[MicroScope]], mis à disposition des microbiologistes et qui comprend plus de 6600 utilisateurs à travers le monde. | ||
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|Relation=MicroScope | |Relation=MicroScope | ||
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[[Aide à la gestion:: logiciel| ]] | |||