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|TypeService=Plateforme d'acquisition
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|StatutService=En production
|StatutService=En production
|NomDéveloppé=GenOmique at Lille
|NomAlternatif=GenOmique at Lille
|NomAlternatif=GenOmique at Lille
|UrlService=https://ums-plbs.univ-lille.fr/les-plateformes-constitutives/genomique
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|StructureAppartenance=PLBS
|StructureAppartenance=PLBS
|Tutelle=Université de Lille, Inserm, CHU de Lille, CNRS, Institut Pasteur de Lille
|Tutelle=Université de Lille, Inserm, CHU de Lille, CNRS, Institut Pasteur de Lille
|PhaseCycleVie=Collecte
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse, Documentation
|International=Non
|International=Non
}}
}}
{{Service
{{Service
|Description=La '''plateforme Go@l''' offre son expertise en étude de faisabilité et en montage de projets d’analyse génomique pour des projets à moyen/haut débit. Elle propose la technologie de séquençage en adéquation avec le projet, sa complexité et en fonction du type d’échantillons. Avec une approche globale ou ciblée, elle assure le suivi et la réalisation des projets de recherche de la qualification des échantillons, de la préparation des librairies et de leurs séquençage, jusqu’à l’analyse bioinformatique et biostatistique de ces données. La plateforme développe son expertise sur les approches suivantes :
|Description=La '''plateforme Go@l''' offre son expertise en '''étude de faisabilité et en montage de projets d’analyse génomique pour des projets à moyen/haut débit'''.
* Génomique « génomes entiers » : WGS, WES, amplicon-seq, Tn-seq, CGH-arrays.
* Transcriptomique : RNA-seq, sRNA-seq, dRNA-seq, NGS-RACE, qRT-PCR, RNA-seq full-length, micro-arrays, DGE, single-cell.
* Métagénomique : amplicon-seq ciblé 16S-ITS.


De la réalisation des expérimentations à l’accompagnement des équipes, la plateforme apporte son expertise sur le traitement des données générées :
Elle comprend deux plateaux spécialisés :
* Assemblage, caractérisation et annotation génomiques, détection et annotation desvariants, étude de transmission mendélienne.
* Le plateau Transcriptomics and Applied Genomics (TAG)
* Analyse différentielle d’expression, analyse non supervisée.
* Le plateau de Génomique Fonctionnelle et Structurale (GFS)
* Assignation taxonomique, évaluation diversité (α et β), mesure de dysbiose.


La plateforme développe son expertise sur les approches suivantes :
* '''Génomique « génomes entiers »''' : WGS, WES, amplicon-seq, Tn-seq, CGH-arrays.
* '''Transcriptomique''' : RNA-seq, sRNA-seq, dRNA-seq, NGS-RACE, qRT-PCR, RNA-seq full-length, micro-arrays, DGE, single-cell.
* '''Métagénomique''' : amplicon-seq ciblé 16S-ITS.


 
De la réalisation des expérimentations à l’accompagnement des équipes, la plateforme apporte son expertise sur le traitement des données générées :
 
* '''Assemblage, caractérisation et annotation génomiques, détection et annotation des variants, étude de transmission mendélienne'''.
La plateforme GO@L comprend deux plateaux spécialisés :
* '''Analyse différentielle d’expression''', analyse non supervisée.
 
* '''Assignation taxonomique, évaluation diversité (α et β), mesure de dysbiose'''.
* Le plateau Transcriptomics and Applied Genomics (TAG), localisé à l’Institut Pasteur de Lille, est spécialisé dans les applications de microbiologie.
* Le plateau de Génomique Fonctionnelle et Structurale (GFS), intégré dans les locaux du Centre de Biologie Pathologie Génétique du CHU de Lille, développe son expertise notamment au service de la génomique humaine associée à des pathologies ciblées (cancers, maladies neuro-dégénératives...) et l'étude de modèles animaux.
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/genomic-at-lille-go-l-625.html
|Thematique=Plateforme de génomique, Transcriptomique, Single cell, RNA-Seq, Small RNA-Seq, Biostatistique, DGE
|Relation=France Génomique
|TypeDonnee=Données de séquençage, Données génomiques
|StatutPage=Page en construction
|Communaute=Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique.
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins
|ConditionUsage=La soumission des projets se fait par l’intermédiaire du portail internet de France Génomique
|Certification=IBiSA; http://www.ibisa.net/plateformes/
|Relation=France Génomique, Transcriptomique et de Génomique Appliquée
}}
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SidonieRaffy
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