PIC-STRA

  PIC-STRA

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Autres noms
URL	https://crbs.unistra.fr/plateformes-scientifiques/imagerie
Contact	Pascal.Kessler@unistra.fr
Localisation	Strasbourg
Structure d'appartenance	CRBS
Tutelles	Université de Strasbourg, Inserm

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

Chargement de la carte...

{"format":"leaflet","minzoom":false,"maxzoom":false,"limit":50,"offset":0,"link":"all","sort":[""],"order":[],"headers":"show","mainlabel":"","intro":"","outro":"","searchlabel":"... autres r\u00e9sultats","default":"\u0026#32;","import-annotation":false,"width":"280px","height":"280px","centre":false,"title":"","label":"","icon":"","lines":[],"polygons":[],"circles":[],"rectangles":[],"copycoords":true,"static":false,"zoom":false,"defzoom":14,"layers":["OpenStreetMap"],"image layers":[],"overlays":[],"resizable":false,"fullscreen":false,"scrollwheelzoom":true,"cluster":true,"clustermaxzoom":20,"clusterzoomonclick":true,"clustermaxradius":20,"clusterspiderfy":true,"geojson":"","clicktarget":"","showtitle":true,"hidenamespace":true,"template":"","userparam":"","activeicon":"","pagelabel":false,"ajaxcoordproperty":"","ajaxquery":"","locations":[{"text":"\u003Cb\u003E\u003Ca href=\"/index.php/PIC-STRA\" title=\"PIC-STRA\"\u003EPIC-STRA\u003C/a\u003E\u003C/b\u003E","title":"PIC-STRA","link":"","lat":48.57689,"lon":7.73863,"icon":""}],"imageLayers":[]}

La plateforme d'imagerie du CRBS "PIC-STRA" a pour but de soutenir les équipes de recherche académiques et privées dans leurs projets en imagerie.

Elle met à disposition de ses utilisateurs plusieurs systèmes d’imagerie (stéréomicroscope, champ large, confocal) permettant l’observation multi-échelle, du petit animal entier aux détails subcellulaires. Elle fournit différentes solutions pour l’observation d’échantillons fixés et vivants (vidéomicroscopie) et est équipée pour le traitement et l’analyse d’images (IMARIS, Fiji/ImageJ, ICY, iLastik).

Expertises principales en imagerie

• stéréomicroscopie, macroscopie
• microscopie à champ large, lumière transmise et fluorescence
• microscopie confocale à balayage par point mono et multi-photonique
• microscopie confocale rapide à disque rotatif (spinning-disk)
• F-techniques (FRAP, FRET, FLIM)

Ressources logicielles / bases de données

• Logiciel Imaris de Bitplane
• Freewares conventionnels (ImageJ/FIji, ICY, Cell profiler)
• Freewares/librairies basés sur le machine/deep learning (Cellpose, Stardist, Yolo, QuPath, Ilastik)

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Thématique et/ou mots clés :

• Bioimagerie
• Observation multi-échelle

Type de données :Données de bioimagerie

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique académique et privée Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Acteurs du secteur privé

Conditions d'usage : https://crbs.unistra.fr/plateformes-scientifiques/imagerie/reservations/

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

PIC-STRA est en lien avec les services et structures

FBI, IBiSA, EBI

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
CRBS	PIC-STRA