« PIC-STRA » : différence entre les versions
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* Freewares/librairies basés sur le machine/deep learning (Cellpose, Stardist, Yolo, QuPath, Ilastik) | * Freewares/librairies basés sur le machine/deep learning (Cellpose, Stardist, Yolo, QuPath, Ilastik) | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|TypeDonnee=données de bioimagerie | |||
|Communaute=Communauté scientifique académique et privée | |Communaute=Communauté scientifique académique et privée | ||
|Beneficiaire=Chercheurs, Acteurs du secteur privé | |Beneficiaire=Chercheurs, Acteurs du secteur privé | ||
|ConditionUsage=https://crbs.unistra.fr/plateformes-scientifiques/imagerie/reservations/ | |||
|Certification=CoRTecS (https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes) | |Certification=CoRTecS (https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes) | ||
|Relation=FBI, IBiSA, EBI | |Relation=FBI, IBiSA, EBI | ||
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Version du 13 avril 2025 à 20:05
| Type de service | Plateforme d'acquisition |
|---|---|
| Statut | En production |
| Autres noms | |
| URL | https://crbs.unistra.fr/plateformes-scientifiques/imagerie |
| Contact | Pascal.Kessler@unistra.fr |
| Localisation | Strasbourg |
| Structure d'appartenance | Université de Strasbourg |
| Tutelles | Université de Strasbourg, Inserm |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Elle met à disposition de ses utilisateurs plusieurs systèmes d’imagerie (stéréomicroscope, champ large, confocal) permettant l’observation multi-échelle, du petit animal entier aux détails subcellulaires. Elle fournit différentes solutions pour l’observation d’échantillons fixés et vivants (vidéomicroscopie) et est équipée pour le traitement et l’analyse d’images (IMARIS, Fiji/ImageJ, ICY, iLastik).
Expertises principales en imagerie
- stéréomicroscopie, macroscopie
- microscopie à champ large, lumière transmise et fluorescence
- microscopie confocale à balayage par point mono et multi-photonique
- microscopie confocale rapide à disque rotatif (spinning-disk)
- F-techniques (FRAP, FRET, FLIM)
Ressources logicielles / bases de données
- Logiciel Imaris de Bitplane
- Freewares conventionnels (ImageJ/FIji, ICY, Cell profiler)
- Freewares/librairies basés sur le machine/deep learning (Cellpose, Stardist, Yolo, QuPath, Ilastik)
Domaines scientifiques :Vie & Santé
Thématique et/ou mots clés :
Type de données :données de bioimagerie
Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique académique et privée Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Acteurs du secteur privé
Conditions d'usage : https://crbs.unistra.fr/plateformes-scientifiques/imagerie/reservations/
Conditions tarifaires :
Certification/Label :CoRTecS (https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes) (?)
Conditions générales d'utilisation :
PIC-STRA est en lien avec les services et structures
| Structure | Services proposés |
|---|---|
| CRBS | PIC-STRA |