« MDverse » : différence entre les versions

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|NomAlternatif=Recycling molecular dynamics data
|NomAlternatif=Recycling molecular dynamics data
|UrlService=https://mdverse.streamlit.app, https://mdverse.github.io/
|UrlService=https://mdverse.streamlit.app, https://mdverse.github.io/
|ContactMel=pierre.poulain@u-paris.fr
|ContactMel=pierre.poulain@u-paris.fr, Matthieu.Chavent@ipbs.fr
|Localisation=Paris
|Localisation=Paris
|StructureAppartenance=IPBS, IJM
|Tutelle=CNRS, Université Paris Cité
|Tutelle=CNRS, Université Paris Cité
|PhaseCycleVie=Documentation, Exposition, Réutilisation
|PhaseCycleVie=Documentation, Exposition, Réutilisation
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|Description='''MDverse''' a pour objectifs de :
|Description='''MDverse''' a pour objectifs de :
* '''Cataloguer les données issues de simulations de dynamique moléculaire''' disponibles dans différents entrepôts de données ouvertes
* '''Cataloguer les données issues de simulations de dynamique moléculaire''' disponibles dans différents entrepôts de données ouvertes
* '''D’améliorer les métadonnées existantes''' pour rendre ces données plus facilement trouvables et réutilisables par la communauté scientifique
* '''Améliorer les métadonnées existantes''' pour rendre ces données plus facilement trouvables et réutilisables par la communauté scientifique




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|Communaute=Communauté scientifique en biologie moléculaire
|Communaute=Communauté scientifique en biologie moléculaire
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Biologistes
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Biologistes
|ConditionUsage=Toutes les données sont partagées sous forme de fichiers Parquet sous licence Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0).
|ConditionUsage=Les données sont conservées dans l'entrepôt Zenodo.
Les données sont conservées dans l'entrepôt Zenodo.
Le code est, quant à lui, open-source, librement disponible sur GitHub (https://github.com/MDverse/mdde) et archivé dans Software Heritage.
Toutes les données sont partagées sous forme de fichiers Parquet sous licence Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0).
|ModeleEconomique=Gratuit
|ModeleEconomique=Gratuit
}}
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Dernière version du 10 janvier 2025 à 09:30

  MDverse
Type de service Plateforme d'accès
Statut En cours d'élaboration
Autres noms Recycling molecular dynamics data
URL https://mdverse.streamlit.app, https://mdverse.github.io/
Contact pierre.poulain@u-paris.fr, Matthieu.Chavent@ipbs.fr
Localisation Paris
Structure d'appartenance IPBS, IJM
Tutelles CNRS, Université Paris Cité


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :




MDverse a pour objectifs de :
  • Cataloguer les données issues de simulations de dynamique moléculaire disponibles dans différents entrepôts de données ouvertes
  • Améliorer les métadonnées existantes pour rendre ces données plus facilement trouvables et réutilisables par la communauté scientifique


MDVerse permet de mettre en avant des données ouvertes en enrichissant leur description et leurs métadonnées via la mise à disposition d’un métamoteur facilitant la découverte de ces données et d’un indicateur de potentiel de réutilisation défini par des experts du domaine.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions Thématique et/ou mots clés :

  • Dynamique moléculaire

Type de données :Données de simulation

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique en biologie moléculaire Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Biologistes


Conditions d'usage : Les données sont conservées dans l'entrepôt Zenodo. Le code est, quant à lui, open-source, librement disponible sur GitHub (https://github.com/MDverse/mdde) et archivé dans Software Heritage. Toutes les données sont partagées sous forme de fichiers Parquet sous licence Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0).

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IJMMDverse
IPBSMDverse