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« MicroScope » : différence entre les versions
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{{Infobox Service | {{Infobox Service | ||
|Logo= | |Logo=MicroScope logo.jpg | ||
|NomService=MicroScope | |NomService=MicroScope | ||
|TypeService=Plateforme de calcul | |TypeService=Plateforme de calcul | ||
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|ContactMel=mage@genoscope.cns.fr | |ContactMel=mage@genoscope.cns.fr | ||
|Localisation=Evry | |Localisation=Evry | ||
|StructureAppartenance=IFB | |StructureAppartenance=Génomique Métabolique, IFB | ||
| | |Tutelle=CEA, CNRS, Université Paris-Saclay | ||
| | |IDre3data=10.17616/R31NJMGW | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation | |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation | ||
|International=Non | |||
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{{Coordonnées GPS | |||
|CoordonneeGeographique=48.62399, 2.43972 | |CoordonneeGeographique=48.62399, 2.43972 | ||
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{{Service | {{Service | ||
|Description=La plateforme MicroScope (MaGe) est une infrastructure informatique dédiée à l’annotation et l’analyse comparative de génomes ou méta-génomes de microorganismes. | |Description=La '''plateforme MicroScope (MaGe)''' est une '''infrastructure informatique dédiée à l’annotation et l’analyse comparative de génomes ou méta-génomes de microorganismes'''. | ||
Plateforme web d'annotation et d'analyses comparatives de génomes procaryotes développée par l'équipe LABGeM, laboratoire Analyses Bio-informatique pour la Génomique et le Métabolisme du CEA/Genoscope. Cette infrastructure informatique intègre des données (génomes, annotations automatiques et expertes, résultats d'analyses et données expérimentales), et des interfaces graphiques Web permettant d'explorer ces données et d'utiliser les outils méthodologiques régulièrement intégrés à la plateforme. | Plateforme web d'annotation et d'analyses comparatives de génomes procaryotes développée par l'équipe LABGeM, laboratoire Analyses Bio-informatique pour la Génomique et le Métabolisme du CEA/Genoscope. Cette infrastructure informatique intègre des données (génomes, annotations automatiques et expertes, résultats d'analyses et données expérimentales), et des interfaces graphiques Web permettant d'explorer ces données et d'utiliser les outils méthodologiques régulièrement intégrés à la plateforme. | ||
MicroScope combine des outils et des interfaces graphiques pour analyser les génomes dans un contexte comparatif et métabolique. Cette plateforme fournit des données provenant de milliers de projets sur le génome ainsi que des expériences post-génomiques permettant aux utilisateurs d'améliorer la compréhension des fonctions des gènes. Des annotations d'experts sont continuellement rassemblées dans la base de données MicroScope, ce qui contribue à l'amélioration de la qualité des annotations du génome microbien. MicroScope peut être utilisé comme une ressource communautaire pour l'analyse comparative et l'annotation des génomes accessibles au public, mais aussi comme une ressource privée avec des droits d'accès limités aux données génomiques. | MicroScope combine des '''outils et des interfaces graphiques pour analyser les génomes dans un contexte comparatif et métabolique'''. Cette plateforme fournit des données provenant de milliers de projets sur le génome ainsi que des expériences post-génomiques permettant aux utilisateurs d'améliorer la compréhension des fonctions des gènes. Des annotations d'experts sont continuellement rassemblées dans la '''base de données MicroScope''', ce qui contribue à l'amélioration de la qualité des annotations du génome microbien. MicroScope peut être utilisé comme une '''ressource communautaire pour l'analyse comparative et l'annotation des génomes accessibles au public''', mais aussi comme une ressource privée avec des droits d'accès limités aux données génomiques. | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante= | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique,Génome, Métagénome, RNA-seq et évolution | |Thematique=Plateforme de bioinformatique,Génome, Métagénome, RNA-seq et évolution | ||
|TypeDonnee= | |TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage | ||
|Communaute= | |Communaute=Communauté de la recherche scientifique publique et privée, française, européenne et internationale | ||
|Beneficiaire= | |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignant-Chercheurs | ||
|ConditionUsage= | |ConditionUsage=Formulaire de demande d'accès sur le site, il est très recommandé de suivre les sessions de formations proposées | ||
|ModeleEconomique= | |ModeleEconomique=Accès gratuit pour le monde académique, devis disponible sur demande pour les non académiques | ||
|Certification= | |Certification=ISO 9001:2015;http://qualite.ibisa.net/certificats/ERQ_LABGeM_ISO9001_2015_FR.pdf,IBiSA;https://www.ibisa.net/plateformes/, NFX 50-900;http://qualite.ibisa.net/certificats/ERQ_LABGeM_NFX50-900_2016_FR.pdf, ELIXIR Data Resources;https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources?page=2 | ||
|Cgu= | |Cgu=https://mage.genoscope.cns.fr/microscope/about/microscopecharter.php | ||
|Relation=France Génomique, PPanGGOLiN | |||
|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/ | |||
}} | }} | ||
[[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]] | |||